Investigating bacterial strain evolution through metagenomic genome assemblies

Informations projet

PopMet

N° de convention de subvention: 660375

DOI

10.3030/660375

Projet clôturé

Date de signature de la CE 27 Février 2015

Date de début 1 Mars 2015

Date de fin 28 Février 2017

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 159 460,80

Contribution de l’UE

€ 159 460,80

Coordonné par

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (6)

Durable coexistence of donor and recipient strains after fecal microbiota transplantation

Auteurs: S. S. Li, A. Zhu, V. Benes, P. I. Costea, R. Hercog, F. Hildebrand, J. Huerta-Cepas, M. Nieuwdorp, J. Salojarvi, A. Y. Voigt, G. Zeller, S. Sunagawa, W. M. de Vos, P. Bork
Publié dans: Science, Numéro 352/6285, 2016, Page(s) 586-589, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aad8852

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Auteurs: Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Trine Nielsen, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Shinichi Sunagawa, Edi Prifti, Sara Vieira-Silva, Valborg Gudmundsdottir, Helle Krogh Pedersen, Manimozhiyan Arumugam, Karsten Kristiansen, Anita Yvonne Voigt, Henrik Vestergaard, Rajna Hercog, Paul Igor Costea, Jens Roat Kultima, Junhua Li, Torben Jørgensen, Florence Levenez, Joël Dore, H. Bjørn Nielsen,
Publié dans: Nature, Numéro 528/7581, 2015, Page(s) 262-266, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature15766

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

Auteurs: Helle Krogh Pedersen, Valborg Gudmundsdottir, Henrik Bjørn Nielsen, Tuulia Hyotylainen, Trine Nielsen, Benjamin A. H. Jensen, Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Edi Prifti, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Florence Levenez, Joel Doré, Ismo Mattila, Damian R. Plichta, Päivi Pöhö, Lars I. Hellgren, Manimozhiyan Arumugam, Shinichi Sunagawa, Sara Vieira-Silva, Torben Jørgensen, Jacob Bak
Publié dans: Nature, Numéro 535/7612, 2016, Page(s) 376-381, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18646

Gut Microbiota Linked to Sexual Preference and HIV Infection

Auteurs: Noguera-Julian M, Rocafort M, Guillén Y, Rivera J, Casadellà M, Nowak P, Hildebrand F, Zeller G, Parera M, Bellido R, Rodríguez C, Carrillo J, Mothe B, Coll J, Bravo I, Estany C, Herrero C, Saz J, Sirera G, Torrela A, Navarro J, Crespo M, Brander C, Negredo E, Blanco J, Guarner F, Calle ML, Bork P, Sönnerborg A, Clotet B, Paredes R.
Publié dans: EBioMedicine, Numéro Volume 5, 2016, Page(s) 135-146, ISSN 2352-3964
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2016.01.032

RTK: efficient rarefaction analysis of large datasets

Auteurs: Paul Saary, Kristoffer Forslund, Peer Bork, Falk Hildebrand
Publié dans: Bioinformatics, 2017, ISSN 1367-4803
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btx206

Microbial, functional and viral gut metagenome shifts in early stage L-DOPA naive PD patients

Auteurs: Bedarf JR, Hildebrand F, Coelho LP, Sunagawa S, Bahram M, Goeser F, Bork P, Wuellner U
Publié dans: Genome Medicine, 2017, ISSN 1756-994X
Éditeur: BioMed Central