Investigating bacterial strain evolution through metagenomic genome assemblies

Informazioni relative al progetto

PopMet

ID dell’accordo di sovvenzione: 660375

DOI

10.3030/660375

Progetto chiuso

Data della firma CE 27 Febbraio 2015

Data di avvio 1 Marzo 2015

Data di completamento 28 Febbraio 2017

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale

€ 159 460,80

Contributo UE

€ 159 460,80

Coordinato da

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (6)

Durable coexistence of donor and recipient strains after fecal microbiota transplantation

Autori: S. S. Li, A. Zhu, V. Benes, P. I. Costea, R. Hercog, F. Hildebrand, J. Huerta-Cepas, M. Nieuwdorp, J. Salojarvi, A. Y. Voigt, G. Zeller, S. Sunagawa, W. M. de Vos, P. Bork
Pubblicato in: Science, Numero 352/6285, 2016, Pagina/e 586-589, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aad8852

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Autori: Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Trine Nielsen, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Shinichi Sunagawa, Edi Prifti, Sara Vieira-Silva, Valborg Gudmundsdottir, Helle Krogh Pedersen, Manimozhiyan Arumugam, Karsten Kristiansen, Anita Yvonne Voigt, Henrik Vestergaard, Rajna Hercog, Paul Igor Costea, Jens Roat Kultima, Junhua Li, Torben Jørgensen, Florence Levenez, Joël Dore, H. Bjørn Nielsen,
Pubblicato in: Nature, Numero 528/7581, 2015, Pagina/e 262-266, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature15766

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

Autori: Helle Krogh Pedersen, Valborg Gudmundsdottir, Henrik Bjørn Nielsen, Tuulia Hyotylainen, Trine Nielsen, Benjamin A. H. Jensen, Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Edi Prifti, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Florence Levenez, Joel Doré, Ismo Mattila, Damian R. Plichta, Päivi Pöhö, Lars I. Hellgren, Manimozhiyan Arumugam, Shinichi Sunagawa, Sara Vieira-Silva, Torben Jørgensen, Jacob Bak
Pubblicato in: Nature, Numero 535/7612, 2016, Pagina/e 376-381, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18646

Gut Microbiota Linked to Sexual Preference and HIV Infection

Autori: Noguera-Julian M, Rocafort M, Guillén Y, Rivera J, Casadellà M, Nowak P, Hildebrand F, Zeller G, Parera M, Bellido R, Rodríguez C, Carrillo J, Mothe B, Coll J, Bravo I, Estany C, Herrero C, Saz J, Sirera G, Torrela A, Navarro J, Crespo M, Brander C, Negredo E, Blanco J, Guarner F, Calle ML, Bork P, Sönnerborg A, Clotet B, Paredes R.
Pubblicato in: EBioMedicine, Numero Volume 5, 2016, Pagina/e 135-146, ISSN 2352-3964
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2016.01.032

RTK: efficient rarefaction analysis of large datasets

Autori: Paul Saary, Kristoffer Forslund, Peer Bork, Falk Hildebrand
Pubblicato in: Bioinformatics, 2017, ISSN 1367-4803
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btx206

Microbial, functional and viral gut metagenome shifts in early stage L-DOPA naive PD patients

Autori: Bedarf JR, Hildebrand F, Coelho LP, Sunagawa S, Bahram M, Goeser F, Bork P, Wuellner U
Pubblicato in: Genome Medicine, 2017, ISSN 1756-994X
Editore: BioMed Central