Investigating bacterial strain evolution through metagenomic genome assemblies

Projektinformationen

PopMet

ID Finanzhilfevereinbarung: 660375

DOI

10.3030/660375

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 27 Februar 2015

Startdatum 1 März 2015

Enddatum 28 Februar 2017

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 159 460,80

EU-Beitrag

€ 159 460,80

Koordiniert durch

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (6)

Durable coexistence of donor and recipient strains after fecal microbiota transplantation

Autoren: S. S. Li, A. Zhu, V. Benes, P. I. Costea, R. Hercog, F. Hildebrand, J. Huerta-Cepas, M. Nieuwdorp, J. Salojarvi, A. Y. Voigt, G. Zeller, S. Sunagawa, W. M. de Vos, P. Bork
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 352/6285, 2016, Seite(n) 586-589, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aad8852

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Autoren: Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Trine Nielsen, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Shinichi Sunagawa, Edi Prifti, Sara Vieira-Silva, Valborg Gudmundsdottir, Helle Krogh Pedersen, Manimozhiyan Arumugam, Karsten Kristiansen, Anita Yvonne Voigt, Henrik Vestergaard, Rajna Hercog, Paul Igor Costea, Jens Roat Kultima, Junhua Li, Torben Jørgensen, Florence Levenez, Joël Dore, H. Bjørn Nielsen,
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 528/7581, 2015, Seite(n) 262-266, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature15766

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

Autoren: Helle Krogh Pedersen, Valborg Gudmundsdottir, Henrik Bjørn Nielsen, Tuulia Hyotylainen, Trine Nielsen, Benjamin A. H. Jensen, Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Edi Prifti, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Florence Levenez, Joel Doré, Ismo Mattila, Damian R. Plichta, Päivi Pöhö, Lars I. Hellgren, Manimozhiyan Arumugam, Shinichi Sunagawa, Sara Vieira-Silva, Torben Jørgensen, Jacob Bak
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 535/7612, 2016, Seite(n) 376-381, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18646

Gut Microbiota Linked to Sexual Preference and HIV Infection

Autoren: Noguera-Julian M, Rocafort M, Guillén Y, Rivera J, Casadellà M, Nowak P, Hildebrand F, Zeller G, Parera M, Bellido R, Rodríguez C, Carrillo J, Mothe B, Coll J, Bravo I, Estany C, Herrero C, Saz J, Sirera G, Torrela A, Navarro J, Crespo M, Brander C, Negredo E, Blanco J, Guarner F, Calle ML, Bork P, Sönnerborg A, Clotet B, Paredes R.
Veröffentlicht in: EBioMedicine, Ausgabe Volume 5, 2016, Seite(n) 135-146, ISSN 2352-3964
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2016.01.032

RTK: efficient rarefaction analysis of large datasets

Autoren: Paul Saary, Kristoffer Forslund, Peer Bork, Falk Hildebrand
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2017, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btx206

Microbial, functional and viral gut metagenome shifts in early stage L-DOPA naive PD patients

Autoren: Bedarf JR, Hildebrand F, Coelho LP, Sunagawa S, Bahram M, Goeser F, Bork P, Wuellner U
Veröffentlicht in: Genome Medicine, 2017, ISSN 1756-994X
Herausgeber: BioMed Central