Topological organization of vertebrate regulatory landscapes: The Hox genes paradigm

Información del proyecto

RegulHox

Identificador del acuerdo de subvención: 667156

DOI

10.3030/667156

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Junio 2015

Fecha de inicio 1 Septiembre 2015

Fecha de finalización 28 Febrero 2021

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 499 628,00

Aportación de la UE

€ 2 499 628,00

Coordinado por

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

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Publicaciones

Peer reviewed articles (10)

Control of Hoxd gene transcription in the mammary bud by hijacking a preexisting regulatory landscape

Autores: Ruben Schep, Anamaria Necsulea, Eddie Rodríguez-Carballo, Isabel Guerreiro, Guillaume Andrey, Thi Hanh Nguyen Huynh, Virginie Marcet, Jozsef Zákány, Denis Duboule, Leonardo Beccari
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 113/48, 2016, Página(s) E7720-E7729, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1617141113

Large scale genomic reorganization of topological domains at the HoxD locus

Autores: Pierre J. Fabre, Marion Leleu, Benjamin H. Mormann, Lucille Lopez-Delisle, Daan Noordermeer, Leonardo Beccari, Denis Duboule
Publicado en: Genome Biology, Edición 18/1, 2017, ISSN 1474-760X
Editor: Genome Biology
DOI: 10.1186/s13059-017-1278-z

Embryonic timing, axial stem cells, chromatin dynamics, and the Hox clock

Autores: Jacqueline Deschamps, Denis Duboule
Publicado en: Genes & Development, Edición 31/14, 2017, Página(s) 1406-1416, ISSN 0890-9369
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.303123.117

Hotair Is Dispensible for Mouse Development

Autores: Ana Rita Amândio, Anamaria Necsulea, Elisabeth Joye, Bénédicte Mascrez, Denis Duboule
Publicado en: PLOS Genetics, Edición 12/12, 2016, Página(s) e1006232, ISSN 1553-7404
Editor: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pgen.1006232

Integration of Shh and Fgf signaling in controlling Hox gene expression in cultured limb cells

Autores: Alan R. Rodrigues, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Yuji Atsuta, Guillaume Andrey, Patrick Schorderet, Denis Duboule, Clifford J. Tabin
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 114/12, 2017, Página(s) 3139-3144, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1620767114

Nanoscale spatial organization of the HoxD gene cluster in distinct transcriptional states

Autores: Pierre J. Fabre, Alexander Benke, Elisabeth Joye, Thi Hanh Nguyen Huynh, Suliana Manley, Denis Duboule
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 112/45, 2015, Página(s) 13964-13969, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1517972112

The HoxD cluster is a dynamic and resilient TAD boundary controlling the segregation of antagonistic regulatory landscapes

Autores: Eddie Rodríguez-Carballo, Lucille Lopez-Delisle, Ye Zhan, Pierre J. Fabre, Leonardo Beccari, Imane El-Idrissi, Thi Hanh Nguyen Huynh, Hakan Ozadam, Job Dekker, Denis Duboule
Publicado en: Genes & Development, Edición 31/22, 2017, Página(s) 2264-2281, ISSN 0890-9369
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.307769.117

Control of growth and gut maturation by HoxD genes and the associated lncRNA Haglr

Autores: Jozsef Zakany, Fabrice Darbellay, Bénédicte Mascrez, Anamaria Necsulea, Denis Duboule
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 114/44, 2017, Página(s) E9290-E9299, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1712511114

A role for HOX13 proteins in the regulatory switch between TADs at the HoxD locus

Autores: Leonardo Beccari, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Joost M. Woltering, Anamaria Necsulea, Nicolas Lonfat, Eddie Rodríguez-Carballo, Benedicte Mascrez, Shiori Yamamoto, Atsushi Kuroiwa, Denis Duboule
Publicado en: Genes & Development, 2016, ISSN 0890-9369
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.281055.116

Reorganisation of Hoxd regulatory landscapes during the evolution of a snake-like body plan

Autores: Isabel Guerreiro, Sandra Gitto, Ana Novoa, Julien Codourey, Thi Hanh Nguyen Huynh, Federico Gonzalez, Michel C Milinkovitch, Moises Mallo, Denis Duboule
Publicado en: eLife, Edición 5, 2016, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.16087