Less is more: Single Cell Analysis of Zebrafish Blood Development

Información del proyecto

ZF_Blood

Identificador del acuerdo de subvención: 677501

DOI

10.3030/677501

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 16 Febrero 2016

Fecha de inicio 1 Mayo 2016

Fecha de finalización 30 Abril 2022

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 500 000,00

Aportación de la UE

€ 1 500 000,00

Coordinado por

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Publicaciones

Peer reviewed articles (8)

Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation

Autores: Giovanni Canu, Emmanouil Athanasiadis, Rodrigo A. Grandy, Jose Garcia-Bernardo, Paulina M. Strzelecka, Ludovic Vallier, Daniel Ortmann, Ana Cvejic
Publicado en: Genome Biology, Edición 21/1, 2020, ISSN 1474-760X
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-020-02058-4

Unsupervised generative and graph representation learning for modelling cell differentiation

Autores: Ioana Bica, Helena Andrés-Terré, Ana Cvejic, Pietro Liò
Publicado en: Scientific Reports, Edición 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66166-8

Single-cell transcriptome analysis of fish immune cells provides insight into the evolution of vertebrate immune cell types

Autores: Santiago J. Carmona, Sarah A. Teichmann, Lauren Ferreira, Iain C. Macaulay, Michael J.T. Stubbington, Ana Cvejic, David Gfeller
Publicado en: Genome Research, Edición 27/3, 2017, Página(s) 451-461, ISSN 1088-9051
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.207704.116

Single-cell RNA-sequencing uncovers transcriptional states and fate decisions in haematopoiesis

Autores: Emmanouil I. Athanasiadis, Jan G. Botthof, Helena Andres, Lauren Ferreira, Pietro Lio, Ana Cvejic
Publicado en: Nature Communications, Edición 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-02305-6

CD4-Transgenic Zebrafish Reveal Tissue-Resident Th2- and Regulatory T Cell–like Populations and Diverse Mononuclear Phagocytes

Autores: Christopher T. Dee, Raghavendar T. Nagaraju, Emmanouil I. Athanasiadis, Caroline Gray, Laura Fernandez del Ama, Simon A. Johnston, Christopher J. Secombes, Ana Cvejic, Adam F. L. Hurlstone
Publicado en: The Journal of Immunology, Edición 197/9, 2016, Página(s) 3520-3530, ISSN 0022-1767
Editor: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.1600959

Power analysis of single-cell RNA-sequencing experiments

Autores: Valentine Svensson, Kedar Nath Natarajan, Lam-Ha Ly, Ricardo J Miragaia, Charlotte Labalette, Iain C Macaulay, Ana Cvejic, Sarah A Teichmann
Publicado en: Nature Methods, Edición 14/4, 2017, Página(s) 381-387, ISSN 1548-7091
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4220

Single-cell transcriptional analysis reveals ILC-like cells in zebrafish

Autores: Pedro P. Hernández, Paulina M. Strzelecka, Emmanouil I. Athanasiadis, Dominic Hall, Ana F. Robalo, Catherine M. Collins, Pierre Boudinot, Jean-Pierre Levraud, Ana Cvejic
Publicado en: Science Immunology, Edición 3/29, 2018, Página(s) eaau5265, ISSN 2470-9468
Editor: AAAS
DOI: 10.1126/sciimmunol.aau5265

A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma

Autores: Felipe A. Vieira Braga, Gozde Kar, Marijn Berg, Orestes A. Carpaij, Krzysztof Polanski, Lukas M. Simon, Sharon Brouwer, Tomás Gomes, Laura Hesse, Jian Jiang, Eirini S. Fasouli, Mirjana Efremova, Roser Vento-Tormo, Carlos Talavera-López, Marnix R. Jonker, Karen Affleck, Subarna Palit, Paulina M. Strzelecka, Helen V. Firth, Krishnaa T. Mahbubani, Ana Cvejic, Kerstin B. Meyer, Kourosh Saeb-Parsy, M
Publicado en: Nature Medicine, 2019, ISSN 1078-8956
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-019-0468-5