Less is more: Single Cell Analysis of Zebrafish Blood Development

Projektinformationen

ZF_Blood

ID Finanzhilfevereinbarung: 677501

DOI

10.3030/677501

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 16 Februar 2016

Startdatum 1 Mai 2016

Enddatum 30 April 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation

Autoren: Giovanni Canu, Emmanouil Athanasiadis, Rodrigo A. Grandy, Jose Garcia-Bernardo, Paulina M. Strzelecka, Ludovic Vallier, Daniel Ortmann, Ana Cvejic
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 21/1, 2020, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-020-02058-4

Unsupervised generative and graph representation learning for modelling cell differentiation

Autoren: Ioana Bica, Helena Andrés-Terré, Ana Cvejic, Pietro Liò
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66166-8

Single-cell transcriptome analysis of fish immune cells provides insight into the evolution of vertebrate immune cell types

Autoren: Santiago J. Carmona, Sarah A. Teichmann, Lauren Ferreira, Iain C. Macaulay, Michael J.T. Stubbington, Ana Cvejic, David Gfeller
Veröffentlicht in: Genome Research, Ausgabe 27/3, 2017, Seite(n) 451-461, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.207704.116

Single-cell RNA-sequencing uncovers transcriptional states and fate decisions in haematopoiesis

Autoren: Emmanouil I. Athanasiadis, Jan G. Botthof, Helena Andres, Lauren Ferreira, Pietro Lio, Ana Cvejic
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-02305-6

CD4-Transgenic Zebrafish Reveal Tissue-Resident Th2- and Regulatory T Cell–like Populations and Diverse Mononuclear Phagocytes

Autoren: Christopher T. Dee, Raghavendar T. Nagaraju, Emmanouil I. Athanasiadis, Caroline Gray, Laura Fernandez del Ama, Simon A. Johnston, Christopher J. Secombes, Ana Cvejic, Adam F. L. Hurlstone
Veröffentlicht in: The Journal of Immunology, Ausgabe 197/9, 2016, Seite(n) 3520-3530, ISSN 0022-1767
Herausgeber: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.1600959

Power analysis of single-cell RNA-sequencing experiments

Autoren: Valentine Svensson, Kedar Nath Natarajan, Lam-Ha Ly, Ricardo J Miragaia, Charlotte Labalette, Iain C Macaulay, Ana Cvejic, Sarah A Teichmann
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 14/4, 2017, Seite(n) 381-387, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4220

Single-cell transcriptional analysis reveals ILC-like cells in zebrafish

Autoren: Pedro P. Hernández, Paulina M. Strzelecka, Emmanouil I. Athanasiadis, Dominic Hall, Ana F. Robalo, Catherine M. Collins, Pierre Boudinot, Jean-Pierre Levraud, Ana Cvejic
Veröffentlicht in: Science Immunology, Ausgabe 3/29, 2018, Seite(n) eaau5265, ISSN 2470-9468
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/sciimmunol.aau5265

A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma

Autoren: Felipe A. Vieira Braga, Gozde Kar, Marijn Berg, Orestes A. Carpaij, Krzysztof Polanski, Lukas M. Simon, Sharon Brouwer, Tomás Gomes, Laura Hesse, Jian Jiang, Eirini S. Fasouli, Mirjana Efremova, Roser Vento-Tormo, Carlos Talavera-López, Marnix R. Jonker, Karen Affleck, Subarna Palit, Paulina M. Strzelecka, Helen V. Firth, Krishnaa T. Mahbubani, Ana Cvejic, Kerstin B. Meyer, Kourosh Saeb-Parsy, M
Veröffentlicht in: Nature Medicine, 2019, ISSN 1078-8956
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-019-0468-5