Zebrafish vision in its natural context: from natural scenes through retinal and central processing to behaviour.

Projektinformationen

NeuroVisEco

ID Finanzhilfevereinbarung: 677687

DOI

10.3030/677687

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 22 April 2016

Startdatum 1 Juni 2016

Enddatum 31 Mai 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

THE UNIVERSITY OF SUSSEX
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Non-peer reviewed articles (3)

TReND in Africa: Toward a Truly Global (Neuro)science Community

Autoren: Tom Baden, Mahmoud Bukar Maina, Andre Maia Chagas, Yunusa Garba Mohammed, Thomas O. Auer, Ana Silbering, Lukas von Tobel, Marie Pertin, Renee Hartig, Jelena Aleksic, Ibukun Akinrinade, Mosab A. Awadelkareem, Artemis Koumoundourou, Aled Jones, Fabiana Arieti, Andrew Beale, Daniel Münch, Samyra Cury Salek, Sadiq Yusuf, Lucia L. Prieto-Godino
Veröffentlicht in: Neuron, Ausgabe 107/3, 2020, Seite(n) 412-416, ISSN 0896-6273
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2020.06.026

Species-specific motion detectors

Autoren: Thomas Euler, Tom Baden
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 535/7610, 2016, Seite(n) 45-46, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18454

Vertebrate vision: Lessons from non-model species

Autoren: Tom Baden
Veröffentlicht in: Seminars in Cell & Developmental Biology, Ausgabe 106, 2020, Seite(n) 1-4, ISSN 1084-9521
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2020.05.028

Peer reviewed articles (21)

A low-cost hyperspectral scanner for natural imaging and the study of animal colour vision above and under water

Autoren: N. E. Nevala, T. Baden
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-47220-6

Type-specific dendritic integration in mouse retinal ganglion cells

Autoren: Yanli Ran, Ziwei Huang, Tom Baden, Timm Schubert, Harald Baayen, Philipp Berens, Katrin Franke, Thomas Euler
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15867-9

Fovea-like Photoreceptor Specializations Underlie Single UV Cone Driven Prey-Capture Behavior in Zebrafish

Autoren: Takeshi Yoshimatsu, Cornelius Schröder, Noora E. Nevala, Philipp Berens, Tom Baden
Veröffentlicht in: Neuron, Ausgabe 107/2, 2020, Seite(n) 320-337.e6, ISSN 0896-6273
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2020.04.021

Distinct Synaptic Transfer Functions in Same-Type Photoreceptors

Autoren: Cornelius Schröder; Jonathan Oesterle; Philipp Berens; Takeshi Yoshimatsu; Tom Baden; Tom Baden
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 8, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2021.02.24.432674

Circuit mechanisms for colour vision in zebrafish

Autoren: Tom Baden
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 09609822, 2021, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.04.053

Zebrafish Retinal Ganglion Cells Asymmetrically Encode Spectral and Temporal Information across Visual Space

Autoren: Mingyi Zhou, John Bear, Paul A. Roberts, Filip K. Janiak, Julie Semmelhack, Takeshi Yoshimatsu, Tom Baden
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 30/15, 2020, Seite(n) 2927-2942.e7, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.05.055

African neuroscience on the global stage: Nigeria as a model

Autoren: Mahmoud Bukar Maina, Yunusa Garba Mohammed, Ali Maina Bukar, Umar Ahmad, Abubakar Tijjani Salihu, Harun A. Ibrahim, Muhammad Abdurrazak, Suleiman Kwairanga Hamidu, Aisha Umar Yaro, Mosab Ali Awadelkareem, Fayza Eid Nasr, Tom Baden
Veröffentlicht in: European Journal of Neuroscience, Ausgabe 49/12, 2019, Seite(n) 1544-1551, ISSN 0953-816X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ejn.14372

General features of inhibition in the inner retina

Autoren: Franke, Katrin; Baden, Tom
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, Ausgabe 7, 2019, ISSN 1469-7793
Herausgeber: Wiley

The €100 lab: A 3D-printable open-source platform for fluorescence microscopy, optogenetics, and accurate temperature control during behaviour of zebrafish, Drosophila, and Caenorhabditis elegans

Autoren: Andre Maia Chagas, Lucia L. Prieto-Godino, Aristides B. Arrenberg, Tom Baden
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 15/7, 2017, Seite(n) e2002702, ISSN 1545-7885
Herausgeber: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2002702

General features of inhibition in the inner retina

Autoren: Katrin Franke, Tom Baden
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, Ausgabe 595/16, 2017, Seite(n) 5507-5515, ISSN 0022-3751
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1113/JP273648

Openspritzer: an open hardware pressure ejection system for reliably delivering picolitre volumes

Autoren: C. J. Forman, H. Tomes, B. Mbobo, R. J. Burman, M. Jacobs, T Baden, J. V. Raimondo
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, Seite(n) 2188, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-02301-2

Zebrafish Differentially Process Color across Visual Space to Match Natural Scenes

Autoren: Maxime J.Y. Zimmermann, Noora E. Nevala, Takeshi Yoshimatsu, Daniel Osorio, Dan-Eric Nilsson, Philipp Berens, Tom Baden
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 28/13, 2018, Seite(n) 2018-2032.e5, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2018.04.075

Spikeling: A low-cost hardware implementation of a spiking neuron for neuroscience teaching and outreach

Autoren: Tom Baden, Ben James, Maxime J. Y. Zimmermann, Phillip Bartel, Dorieke Grijseels, Thomas Euler, Leon Lagnado, Miguel Maravall
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 16/10, 2018, Seite(n) e2006760, ISSN 1545-7885
Herausgeber: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2006760

Inhibition decorrelates visual feature representations in the inner retina

Autoren: Katrin Franke, Philipp Berens, Timm Schubert, Matthias Bethge, Thomas Euler, Tom Baden
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 542/7642, 2017, Seite(n) 439-444, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature21394

Visual Neuroscience: A Retinal Ganglion Cell to Report Image Focus?

Autoren: Tom Baden, Frank Schaeffel, Philipp Berens
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 27/4, 2017, Seite(n) R139-R141, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2016.12.022

Retinal Physiology: Non-Bipolar-Cell Excitatory Drive in the Inner Retina

Autoren: Tom Baden, Thomas Euler
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 26/15, 2016, Seite(n) R706-R708, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2016.03.065

The retinal basis of vision in chicken

Autoren: M. Seifert, T. Baden, D. Osorio
Veröffentlicht in: Seminars in Cell & Developmental Biology, Ausgabe 106, 2020, Seite(n) 106-115, ISSN 1084-9521
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2020.03.011

Spectral inference reveals principal cone-integration rules of the zebrafish inner retina

Autoren: Philipp Bartel; Takeshi Yoshimatsu; F. Janiak; Tom Baden; Tom Baden
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 09609822, 2021, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1101/2021.08.10.455697

LED Zappelin’: An open source LED controller for arbitrary spectrum visual stimulation and optogenetics during 2-photon imaging

Autoren: Zimmermann, M.J.Y.; Chagas, A.M.; Bartel, P.; Pop, S.; Godino, L.L. Prieto; Baden, T.
Veröffentlicht in: HardwareX, Ausgabe 2, 2020, ISSN 0000-0000
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.ohx.2020.e00127

An arbitrary-spectrum spatial visual stimulator for vision research

Autoren: Katrin Franke; André Maia Chagas; Zhijian Zhao; Maxime JY Zimmermann; Philipp Bartel; Yongrong Qiu; Klaudia P Szatko; Tom Baden; Thomas Euler
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 3, 2019, ISSN 0000-0000
Herausgeber: eLife
DOI: 10.7554/elife.48779

Leveraging open hardware to alleviate the burden of COVID-19 on global health systems

Autoren: Andre Maia Chagas, Jennifer C. Molloy, Lucia L. Prieto-Godino, Tom Baden
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 18/4, 2020, Seite(n) e3000730, ISSN 1545-7885
Herausgeber: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000730

Monographic books (1)

The Functional Organization of Vertebrate Retinal Circuits for Vision

Autoren: Tom Baden, Timm Schubert, Philipp Berens, Thomas Euler
Veröffentlicht in: Oxford Research Encyclopedias, Neuroscience, Ausgabe Online, 2018, Seite(n) N/A
Herausgeber: Oxford Research Encyclopedias
DOI: 10.1093/acrefore/9780190264086.013.68

Other (1)

Studying a Light Sensor with Light: Multiphoton Imaging in the Retina

Autoren: Thomas Euler, Katrin Franke , Tom Baden
Veröffentlicht in: 2019
Herausgeber: preprints
DOI: 10.20944/preprints201903.0244.v1