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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Study of the interplay between CRISPR interference and DNA repair pathways towards the development of novel CRISPR tools

Objectif

CRISPR-Cas loci are the adaptive immune system of archaea and bacteria. They can capture pieces of invading DNA and use this information to degrade target DNA through the action of RNA-guided nucleases. The consequences of DNA cleavage by Cas nucleases, i.e. how breaks are processed and whether they can be repaired, remains to be investigated. A better understanding of the interplay between DNA repair and CRISPR-Cas is critical both to shed light on the evolution and biology of these fascinating systems and for the development of biotechnological tools based on Cas nucleases. CRISPR systems have indeed become a popular tool to edit Eukaryotic genomes. The strategies employed take advantage of different DNA repair pathways to introduce mutations upon DNA cleavage. In bacteria however, the introduction of breaks by Cas nucleases in the chromosome has been described to kill the cell. Preliminary data indicates that this might not always be the case and that some DNA repair pathways could compete with CRISPR immunity allowing cells to survive. Using a combination of bioinformatics and genetics approaches we will investigate the interplay between CRISPR and DNA repair in bacteria with a particular focus on the widely used CRISPR-Cas9 system. The knowledge gained from this study will then help us develop novel tools for bacterial genome engineering. In particular we will introduce a NHEJ pathway in E.coli making it possible to perform CRISPR knockout screens. Finally using CRISPR libraries and multiplexed targeting, we will generate for the first time all combinations of pair-wise gene knockouts in an organism, a task that for now remains elusive, even for large consortiums and with the use of automation. This will enable to decipher genome-scale genetic interaction networks, an important step for our understanding of bacteria as a system.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-STG - Starting Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

INSTITUT PASTEUR
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 499 763,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 499 763,00

Bénéficiaires (1)

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