Description du projet
À la recherche de nouveaux mécanismes de défense contre les phages
Les bactéries ont développé des mécanismes de défense contre les phages, tels que les enzymes de restriction, et contre CRISPR-Cas, ce qui a considérablement influencé l’évolution des deux espèces. Diverses spéculations émergent cependant concernant l’existence d’une puissante batterie de systèmes de défense anti-phage non encore caractérisés dans les génomes bactériens. Financé par le Conseil européen de la recherche, le projet PhageResist entend étudier de manière systématique la présence de mécanismes supplémentaires qu’utilisent les microbes dans le cadre de leur lutte contre les phages. Les chercheurs feront appel à la génomique computationnelle, la biologie synthétique, et à des expériences génétiques et biochimiques pour mener leur étude à bien. Les résultats du projet peuvent non seulement contribuer à l’amélioration de notre compréhension des interactions entre bactéries et phages, mais également ouvrir la voie à de nouvelles applications d’ingénierie.
Objectif
The perpetual arms race between bacteria and phage has resulted in the evolution of efficient resistance systems that protect bacteria from phage infection. Such systems, which include restriction enzymes and CRISPR-Cas, have major influence on the evolution of both bacteria and phage, and have also proven to be invaluable for molecular and biotechnological applications. Although much have been learned on the biology of bacterial defense against phage, more than half of all sequenced bacteria do not contain CRISPR-Cas, and it is estimated that many additional, yet-uncharacterized anti-phage defense systems are encoded in bacterial genomes.
The goal of this project is to systematically understand the arsenal of defense mechanisms that are at the disposal of microbes in their struggle against phages. The project combines computational genomics, synthetic biology, high-throughput robotic assays, and deep genetic and biochemical experiments to discover, verify, and study the properties of anti-phage defense systems.
Champ scientifique
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriology
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- natural sciencesmathematicspure mathematicsdiscrete mathematicsgraph theory
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes
Programme(s)
Régime de financement
ERC-COG - Consolidator GrantInstitution d’accueil
7610001 Rehovot
Israël