Opis projektu
W poszukiwaniu nowych mechanizmów obronnych przeciwko bakteriofagom
Bakterie rozwinęły mechanizmy obronne przeciwko bakteriofagom – w skład nowego arsenału wchodzą enzymy restrykcyjne i CRISPR-Cas, które znacząco wpłynęły na ewolucję obu gatunków. W świecie nauki trwają jednak spekulacje na temat istnienia wielu dotychczas niescharakteryzowanych systemów obrony przed fagami w genomach bakterii. Zespół finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu PhageResist ma na celu systematyczne badanie obecności dodatkowych mechanizmów wykorzystywanych przez drobnoustroje w walce z fagami. W tym celu naukowcy wykorzystają genomikę obliczeniową, biologię syntetyczną, a także doświadczenia genetyczne i biochemiczne. Oprócz lepszego zrozumienia interakcji między bakteriami a bakteriofagami, rezultaty projektu mogą przyczynić się do nowych rozwiązań w zakresie inżynierii genetycznej.
Cel
The perpetual arms race between bacteria and phage has resulted in the evolution of efficient resistance systems that protect bacteria from phage infection. Such systems, which include restriction enzymes and CRISPR-Cas, have major influence on the evolution of both bacteria and phage, and have also proven to be invaluable for molecular and biotechnological applications. Although much have been learned on the biology of bacterial defense against phage, more than half of all sequenced bacteria do not contain CRISPR-Cas, and it is estimated that many additional, yet-uncharacterized anti-phage defense systems are encoded in bacterial genomes.
The goal of this project is to systematically understand the arsenal of defense mechanisms that are at the disposal of microbes in their struggle against phages. The project combines computational genomics, synthetic biology, high-throughput robotic assays, and deep genetic and biochemical experiments to discover, verify, and study the properties of anti-phage defense systems.
Dziedzina nauki
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriology
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- natural sciencesmathematicspure mathematicsdiscrete mathematicsgraph theory
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-COG - Consolidator GrantInstytucja przyjmująca
7610001 Rehovot
Izrael