The evolutionary significance of synonymous variations: Can codon usage preferences drive the propagation of antibiotic resistance?

Información del proyecto

HGTCODONUSE

Identificador del acuerdo de subvención: 682819

DOI

10.3030/682819

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 13 Abril 2016

Fecha de inicio 1 Junio 2016

Fecha de finalización 31 Mayo 2022

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 992 366,00

Aportación de la UE

€ 1 992 366,00

Coordinado por

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publicaciones

Peer reviewed articles (5)

PlasForest: a homology-based random forest classifier for plasmid detection in genomic datasets.

Autores: Léa Pradier; Tazzio Tissot; Anna-Sophie Fiston-Lavier; Stéphanie Bedhomme
Publicado en: ISSN: 1471-2105, Edición 2, 2021, ISSN 1471-2105
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-021-04270-w

Evolutionary responses to codon usage of horizontally transferred genes in Pseudomonas aeruginosa: gene retention, amelioration and compensatory evolution

Autores: Martijn Callens, Celine Scornavacca and Stéphanie Bedhomme
Publicado en: Microbial Genomics, 2021, ISSN 2057-5858
Editor: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.000587

Plasmid and clonal interference during post horizontal gene transfer evolution

Autores: S. Bedhomme, D. Perez Pantoja, I. G. Bravo
Publicado en: Molecular Ecology, Edición 26/7, 2017, Página(s) 1832-1847, ISSN 0962-1083
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.14056

Evolutionary Changes after Translational Challenges Imposed by Horizontal Gene Transfer

Autores: Stéphanie Bedhomme, Dolors Amorós-Moya, Luz M Valero, Nùria Bonifaci, Miquel-Àngel Pujana, Ignacio G Bravo
Publicado en: Genome Biology and Evolution, Edición 11/3, 2019, Página(s) 814-831, ISSN 1759-6653
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evz031

Read between the Lines: Diversity of Nontranslational Selection Pressures on Local Codon Usage.

Autores: Martijn Callens; Léa Pradier; Michael Finnegan; Caroline Rose; Stéphanie Bedhomme
Publicado en: Genome Biology and Evolution, Edición 2, 2021, ISSN 1759-6653
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evab097