The evolutionary significance of synonymous variations: Can codon usage preferences drive the propagation of antibiotic resistance?

Pubblicazioni

PlasForest: a homology-based random forest classifier for plasmid detection in genomic datasets.

Autori: Léa Pradier; Tazzio Tissot; Anna-Sophie Fiston-Lavier; Stéphanie Bedhomme
Pubblicato in: ISSN: 1471-2105, Numero 2, 2021, ISSN 1471-2105
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-021-04270-w

Evolutionary responses to codon usage of horizontally transferred genes in Pseudomonas aeruginosa: gene retention, amelioration and compensatory evolution

Autori: Martijn Callens, Celine Scornavacca and Stéphanie Bedhomme
Pubblicato in: Microbial Genomics, 2021, ISSN 2057-5858
Editore: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.000587

Plasmid and clonal interference during post horizontal gene transfer evolution

Autori: S. Bedhomme, D. Perez Pantoja, I. G. Bravo
Pubblicato in: Molecular Ecology, Numero 26/7, 2017, Pagina/e 1832-1847, ISSN 0962-1083
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.14056

Evolutionary Changes after Translational Challenges Imposed by Horizontal Gene Transfer

Autori: Stéphanie Bedhomme, Dolors Amorós-Moya, Luz M Valero, Nùria Bonifaci, Miquel-Àngel Pujana, Ignacio G Bravo
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, Numero 11/3, 2019, Pagina/e 814-831, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evz031

Read between the Lines: Diversity of Nontranslational Selection Pressures on Local Codon Usage.

Autori: Martijn Callens; Léa Pradier; Michael Finnegan; Caroline Rose; Stéphanie Bedhomme
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, Numero 2, 2021, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evab097

È in corso la ricerca di dati su OpenAIRE...

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