Objetivo
"The spatial architecture of mammalian interphase chromosomes, each consisting of tens of megabases of DNA, poses an intriguing topological problem and is relevant for various nuclear functions. A major challenge is that chromosome architecture exhibits substantial stochastic cell-to-cell variation. To unravel the principles of chromosome organization, new single-cell genome-wide approaches that capture the intrinsic variability are needed.
Interphase chromosomes interact extensively with relatively fixed nuclear ""landmarks"" such as the nuclear lamina and nucleoli, posing considerable restraints to the spatial organization of chromosomes. For example, about one-third of the mammalian genome interacts with the nuclear lamina. We have recently developed two complementary methods to (i) visualize and track landmark – genome interactions in living cells, and (ii) generate genome-wide maps of these interactions in single cells. These new methods offer unique opportunities to unravel chromosome architecture, taking cell-to-cell variation and dynamics into account.
Here I propose to take an integrative approach to study genome – landmark interactions in single mammalian cells. We will: (1) Extend our single-cell methods to visualize and map interactions of the genome with multiple landmarks, and with substantially enhanced genomic and temporal resolution; (2) Elucidate the dynamics and diversity of chromosome architecture in single cells, including differentiating cells; (3) Identify cis-determinants of chromosome - landmark interactions through systematic perturbation of linear chromosome organization, both by targeted mutagenesis and by a random scrambling approach; (4) elucidate the role of various proteins in the global and local control of single-cell dynamics of chromosome organization.
These tightly linked approaches will provide detailed understanding of the dynamic architecture of chromosomes in individual cells, and yield new methods and resources.
"
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2015-AdG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1066 CX Amsterdam
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.