Bacterial isoprene metabolism: a missing link in a key global biogeochemical cycle

Información del proyecto

IsoMet

Identificador del acuerdo de subvención: 694578

DOI

10.3030/694578

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 31 Mayo 2016

Fecha de inicio 1 Noviembre 2016

Fecha de finalización 31 Diciembre 2022

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 494 693,00

Aportación de la UE

€ 2 494 693,00

Coordinado por

UNIVERSITY OF EAST ANGLIA
United Kingdom

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Publicaciones

Peer reviewed articles (21)

‘Omics-guided prediction of the pathway for metabolism of isoprene by Variovorax sp. WS11

Autores: Dawson, R.A., Rix, G.D., Crombie, A.T and Murrell, J.C.
Publicado en: Environmental Microbiology, Edición 24 (11), 2023, Página(s) 5151-5164, ISSN 1462-2912
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16149

Isoprene-Degrading Bacteria from Soils Associated with Tropical Economic Crops and Framework Forest Trees

Autores: Toungporn Uttarotai, Boyd A. McKew, Farid Benyahia, J. Colin Murrell, Wuttichai Mhuantong, Sunanta Wangkarn, Thararat Chitov, Sakunnee Bovonsombut, Terry J. McGenity
Publicado en: Microorganisms, Edición 9/5, 2021, Página(s) 1024, ISSN 2076-2607
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms9051024

Identification of active gaseous alkane degraders at natural gas seeps

Autores: Ul Haque, M.F.,Hernández, M., Crombie, A.T. and Murrell, J.C.
Publicado en: The ISME Journal, Edición 16, 2022, Página(s) 1705-1716, ISSN 1751-7362
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01211-0

Sphingopyxis sp. Strain OPL5, an Isoprene-Degrading Bacterium from the Sphingomonadaceae Family Isolated from Oil Palm Leaves

Autores: Nasmille L. Larke-Mejía, Ornella Carrión, Andrew T. Crombie, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Microorganisms, Edición 8/10, 2020, Página(s) 1557, ISSN 2076-2607
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8101557

Isoprene-degrading bacteria associated with the phyllosphere of Salix fragilis, a high isoprene-emitting willow of the northern hemisphere

Autores: Gibson, L., Crombie, A.T., McNamara, N.P. and Murrell, J.C.
Publicado en: Environmental Microbiome, Edición 16 (1), 2021, Página(s) 1-13, ISSN 2524-6372
Editor: MDPI
DOI: 10.1186/s40793-021-00386-x

Draft Genome Sequences of Three Terrestrial Isoprene-Degrading Rhodococcus Strains

Autores: Andrew T. Crombie, Helen Emery, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Genome Announcements, Edición 5/45, 2017, Página(s) e01256-17, ISSN 2169-8287
Editor: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/genomeA.01256-17

Microbial cycling of isoprene, the most abundantly produced biological volatile organic compound on Earth

Autores: Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie, J. Colin Murrell
Publicado en: The ISME Journal, 2018, ISSN 1751-7362
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-018-0072-6

Identification and characterisation of isoprene-degrading bacteria in an estuarine environment

Autores: Antonia Johnston, Andrew T. Crombie, Myriam El Khawand, Leanne Sims, Gregg M. Whited, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Environmental Microbiology, Edición 19/9, 2017, Página(s) 3526-3537, ISSN 1462-2912
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.13842

Gene probing reveals the widespread distribution, diversity and abundance of isoprene-degrading bacteria in the environment

Autores: Ornella Carrión, Nasmille L. Larke-Mejía, Lisa Gibson, Muhammad Farhan Ul Haque, Javier Ramiro-García, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Microbiome, Edición 6/1, 2018, ISSN 2049-2618
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1186/s40168-018-0607-0

Poplar phyllosphere harbors disparate isoprene-degrading bacteria

Autores: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Larke-Mejia, Helen Emery, Robin Dawson, Jennifer Pratscher, Gordon P. Murphy, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 115/51, 2018, Página(s) 13081-13086, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1812668115

Novel Isoprene-Degrading Proteobacteria From Soil and Leaves Identified by Cultivation and Metagenomics Analysis of Stable Isotope Probing Experiments

Autores: Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Jennifer Pratscher, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 10, 2019, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.02700

Isoprene Oxidation by the Gram-Negative Model bacterium Variovorax sp. WS11

Autores: Robin A. Dawson, Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Muhammad Farhan Ul Haque, J. Colin Murrell
Publicado en: Microorganisms, Edición 8/3, 2020, Página(s) 349, ISSN 2076-2607
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8030349

Diversity of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from a high isoprene-emitting environment: a Malaysian oil palm plantation

Autores: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M. O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J. M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Microbiome, Edición 8/1, 2020, ISSN 2049-2618
Editor: Springer-Nature
DOI: 10.1186/s40168-020-00860-7

Molecular Ecology of Isoprene-Degrading Bacteria

Autores: Ornella Carrión, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Microorganisms, Edición 8/7, 2020, Página(s) 967, ISSN 2076-2607
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8070967

Complete Genome of Isoprene Degrading Nocardioides sp. WS12

Autores: Lisa Gibson, Nasmille L. Larke-Mejía, J. Colin Murrell
Publicado en: Microorganisms, Edición 8/6, 2020, Página(s) 889, ISSN 2076-2607
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8060889

Microbial metabolism of isoprene: a much-neglected climate-active gas

Autores: J. Colin Murrell, Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie
Publicado en: Microbiology, Edición May 2020, 2020, Página(s) 1-14, ISSN 1350-0872
Editor: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/mic.0.000931

Identification of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from high isoprene-emitting oil palm trees by DNA-stable isotope probing

Autores: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M.O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J.M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, J. Colin Murrell
Publicado en: Access Microbiology, Edición 2/7A, 2020, ISSN 2516-8290
Editor: Microbiology Society
DOI: 10.1099/acmi.ac2020.po0460

The microbiology of isoprene cycling in aquatic ecosystems

Autores: RA Dawson, AT Crombie, P Pichon, M Steinke, TJ McGenity, JC Murrell
Publicado en: Aquatic Microbial Ecology, 2021, ISSN 0948-3055
Editor: Inter-Research Science Publishing
DOI: 10.3354/ame01972

Peering down the sink: a review of isoprene metabolism by bacteria

Autores: Dawson, R.A., Crombie, A.T Jansen, R. S., Smith, T.J., Nichol, T. and Murrell, J.C.
Publicado en: Environmental Mirobiology, Edición 25, 2022, Página(s) 1-14, ISSN 1462-2912
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16325

Genome characterisation of an isoprene-degrading Alcaligenes sp. isolated from a tropical restored forest

Autores: Uttarotai, T.; Sutheeworapong, S.; Crombie, A.T.; Murrell, C.; Mhuantong, W.; Noirungsee, N.; Wangkarn, S.; Bovonsombut, S.; McGenity, T.J.; Chitov, T.
Publicado en: Biology, Edición 11 (4), 2022, Página(s) 519, ISSN 2079-7737
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/biology11040519

Purification and characterisation of the isoprene monooxygenase from Rhodococcus sp. AD45

Autores: Sims, LP; Lockwood, CWJ; Crombie, AT; Bradley, JM; Le Brun, NE; Murrell, JC
Publicado en: Applied and Environmental Microbiology, Edición 88 (7), 2022, Página(s) e00029-22, ISSN 0099-2240
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00029-22

Other (1)

Oil palm soil helps degrade environmental isoprene

Autores: Ornella Carrion, Lisa Gibson, Dafydd Elias, Niall McNamara, Theo van Alen, Huub Op den Camp, Christina Supramaniam, Terry McGenity, Colin Murrell
Publicado en: Research Square, Edición Video, 2020
Editor: MDPI

Book chapters (2)

Genetics and Ecology of Isoprene Degradation

Autores: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Mejia-Florez, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publicado en: Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils and Lipids. Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology, Edición 2018, 2018, Página(s) 1-15, ISBN 978-3-319-39782-5
Editor: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-39782-5_27-1

DNA-, RNA-, and Protein-based stable-isotope probing for high-throughput biomarker analysis of active microorganisms

Autores: Jameson, E., Taubert, M., Angel, R., Coyotzi, S., Chen, Y., Eyice, O., Schäfer, H., Murrell, J.C., Neufeld, J.D. and Dumont, M.G
Publicado en: Metagenomics, 2022, Página(s) 261-282, ISSN 1940-6029
Editor: Humana Press, New York
DOI: 10.1007/978-1-0716-2795-2