Bacterial isoprene metabolism: a missing link in a key global biogeochemical cycle

Projektinformationen

IsoMet

ID Finanzhilfevereinbarung: 694578

DOI

10.3030/694578

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 31 Mai 2016

Startdatum 1 November 2016

Enddatum 31 Dezember 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 494 693,00

EU-Beitrag

€ 2 494 693,00

Koordiniert durch

UNIVERSITY OF EAST ANGLIA
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (21)

‘Omics-guided prediction of the pathway for metabolism of isoprene by Variovorax sp. WS11

Autoren: Dawson, R.A., Rix, G.D., Crombie, A.T and Murrell, J.C.
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 24 (11), 2023, Seite(n) 5151-5164, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16149

Isoprene-Degrading Bacteria from Soils Associated with Tropical Economic Crops and Framework Forest Trees

Autoren: Toungporn Uttarotai, Boyd A. McKew, Farid Benyahia, J. Colin Murrell, Wuttichai Mhuantong, Sunanta Wangkarn, Thararat Chitov, Sakunnee Bovonsombut, Terry J. McGenity
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 9/5, 2021, Seite(n) 1024, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms9051024

Identification of active gaseous alkane degraders at natural gas seeps

Autoren: Ul Haque, M.F.,Hernández, M., Crombie, A.T. and Murrell, J.C.
Veröffentlicht in: The ISME Journal, Ausgabe 16, 2022, Seite(n) 1705-1716, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01211-0

Sphingopyxis sp. Strain OPL5, an Isoprene-Degrading Bacterium from the Sphingomonadaceae Family Isolated from Oil Palm Leaves

Autoren: Nasmille L. Larke-Mejía, Ornella Carrión, Andrew T. Crombie, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 8/10, 2020, Seite(n) 1557, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8101557

Isoprene-degrading bacteria associated with the phyllosphere of Salix fragilis, a high isoprene-emitting willow of the northern hemisphere

Autoren: Gibson, L., Crombie, A.T., McNamara, N.P. and Murrell, J.C.
Veröffentlicht in: Environmental Microbiome, Ausgabe 16 (1), 2021, Seite(n) 1-13, ISSN 2524-6372
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.1186/s40793-021-00386-x

Draft Genome Sequences of Three Terrestrial Isoprene-Degrading Rhodococcus Strains

Autoren: Andrew T. Crombie, Helen Emery, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Genome Announcements, Ausgabe 5/45, 2017, Seite(n) e01256-17, ISSN 2169-8287
Herausgeber: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/genomeA.01256-17

Microbial cycling of isoprene, the most abundantly produced biological volatile organic compound on Earth

Autoren: Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: The ISME Journal, 2018, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-018-0072-6

Identification and characterisation of isoprene-degrading bacteria in an estuarine environment

Autoren: Antonia Johnston, Andrew T. Crombie, Myriam El Khawand, Leanne Sims, Gregg M. Whited, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 19/9, 2017, Seite(n) 3526-3537, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.13842

Gene probing reveals the widespread distribution, diversity and abundance of isoprene-degrading bacteria in the environment

Autoren: Ornella Carrión, Nasmille L. Larke-Mejía, Lisa Gibson, Muhammad Farhan Ul Haque, Javier Ramiro-García, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microbiome, Ausgabe 6/1, 2018, ISSN 2049-2618
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1186/s40168-018-0607-0

Poplar phyllosphere harbors disparate isoprene-degrading bacteria

Autoren: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Larke-Mejia, Helen Emery, Robin Dawson, Jennifer Pratscher, Gordon P. Murphy, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 115/51, 2018, Seite(n) 13081-13086, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1812668115

Novel Isoprene-Degrading Proteobacteria From Soil and Leaves Identified by Cultivation and Metagenomics Analysis of Stable Isotope Probing Experiments

Autoren: Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Jennifer Pratscher, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.02700

Isoprene Oxidation by the Gram-Negative Model bacterium Variovorax sp. WS11

Autoren: Robin A. Dawson, Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Muhammad Farhan Ul Haque, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 8/3, 2020, Seite(n) 349, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8030349

Diversity of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from a high isoprene-emitting environment: a Malaysian oil palm plantation

Autoren: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M. O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J. M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microbiome, Ausgabe 8/1, 2020, ISSN 2049-2618
Herausgeber: Springer-Nature
DOI: 10.1186/s40168-020-00860-7

Molecular Ecology of Isoprene-Degrading Bacteria

Autoren: Ornella Carrión, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 8/7, 2020, Seite(n) 967, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8070967

Complete Genome of Isoprene Degrading Nocardioides sp. WS12

Autoren: Lisa Gibson, Nasmille L. Larke-Mejía, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 8/6, 2020, Seite(n) 889, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8060889

Microbial metabolism of isoprene: a much-neglected climate-active gas

Autoren: J. Colin Murrell, Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie
Veröffentlicht in: Microbiology, Ausgabe May 2020, 2020, Seite(n) 1-14, ISSN 1350-0872
Herausgeber: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/mic.0.000931

Identification of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from high isoprene-emitting oil palm trees by DNA-stable isotope probing

Autoren: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M.O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J.M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Access Microbiology, Ausgabe 2/7A, 2020, ISSN 2516-8290
Herausgeber: Microbiology Society
DOI: 10.1099/acmi.ac2020.po0460

The microbiology of isoprene cycling in aquatic ecosystems

Autoren: RA Dawson, AT Crombie, P Pichon, M Steinke, TJ McGenity, JC Murrell
Veröffentlicht in: Aquatic Microbial Ecology, 2021, ISSN 0948-3055
Herausgeber: Inter-Research Science Publishing
DOI: 10.3354/ame01972

Peering down the sink: a review of isoprene metabolism by bacteria

Autoren: Dawson, R.A., Crombie, A.T Jansen, R. S., Smith, T.J., Nichol, T. and Murrell, J.C.
Veröffentlicht in: Environmental Mirobiology, Ausgabe 25, 2022, Seite(n) 1-14, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16325

Genome characterisation of an isoprene-degrading Alcaligenes sp. isolated from a tropical restored forest

Autoren: Uttarotai, T.; Sutheeworapong, S.; Crombie, A.T.; Murrell, C.; Mhuantong, W.; Noirungsee, N.; Wangkarn, S.; Bovonsombut, S.; McGenity, T.J.; Chitov, T.
Veröffentlicht in: Biology, Ausgabe 11 (4), 2022, Seite(n) 519, ISSN 2079-7737
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biology11040519

Purification and characterisation of the isoprene monooxygenase from Rhodococcus sp. AD45

Autoren: Sims, LP; Lockwood, CWJ; Crombie, AT; Bradley, JM; Le Brun, NE; Murrell, JC
Veröffentlicht in: Applied and Environmental Microbiology, Ausgabe 88 (7), 2022, Seite(n) e00029-22, ISSN 0099-2240
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00029-22

Other (1)

Oil palm soil helps degrade environmental isoprene

Autoren: Ornella Carrion, Lisa Gibson, Dafydd Elias, Niall McNamara, Theo van Alen, Huub Op den Camp, Christina Supramaniam, Terry McGenity, Colin Murrell
Veröffentlicht in: Research Square, Ausgabe Video, 2020
Herausgeber: MDPI

Book chapters (2)

Genetics and Ecology of Isoprene Degradation

Autoren: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Mejia-Florez, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Veröffentlicht in: Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils and Lipids. Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology, Ausgabe 2018, 2018, Seite(n) 1-15, ISBN 978-3-319-39782-5
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-39782-5_27-1

DNA-, RNA-, and Protein-based stable-isotope probing for high-throughput biomarker analysis of active microorganisms

Autoren: Jameson, E., Taubert, M., Angel, R., Coyotzi, S., Chen, Y., Eyice, O., Schäfer, H., Murrell, J.C., Neufeld, J.D. and Dumont, M.G
Veröffentlicht in: Metagenomics, 2022, Seite(n) 261-282, ISSN 1940-6029
Herausgeber: Humana Press, New York
DOI: 10.1007/978-1-0716-2795-2