Bacterial isoprene metabolism: a missing link in a key global biogeochemical cycle

Informations projet

IsoMet

N° de convention de subvention: 694578

DOI

10.3030/694578

Projet clôturé

Date de signature de la CE 31 Mai 2016

Date de début 1 Novembre 2016

Date de fin 31 Decembre 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 494 693,00

Contribution de l’UE

€ 2 494 693,00

Coordonné par

UNIVERSITY OF EAST ANGLIA
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (21)

‘Omics-guided prediction of the pathway for metabolism of isoprene by Variovorax sp. WS11

Auteurs: Dawson, R.A., Rix, G.D., Crombie, A.T and Murrell, J.C.
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 24 (11), 2023, Page(s) 5151-5164, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16149

Isoprene-Degrading Bacteria from Soils Associated with Tropical Economic Crops and Framework Forest Trees

Auteurs: Toungporn Uttarotai, Boyd A. McKew, Farid Benyahia, J. Colin Murrell, Wuttichai Mhuantong, Sunanta Wangkarn, Thararat Chitov, Sakunnee Bovonsombut, Terry J. McGenity
Publié dans: Microorganisms, Numéro 9/5, 2021, Page(s) 1024, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms9051024

Identification of active gaseous alkane degraders at natural gas seeps

Auteurs: Ul Haque, M.F.,Hernández, M., Crombie, A.T. and Murrell, J.C.
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 16, 2022, Page(s) 1705-1716, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01211-0

Sphingopyxis sp. Strain OPL5, an Isoprene-Degrading Bacterium from the Sphingomonadaceae Family Isolated from Oil Palm Leaves

Auteurs: Nasmille L. Larke-Mejía, Ornella Carrión, Andrew T. Crombie, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Microorganisms, Numéro 8/10, 2020, Page(s) 1557, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8101557

Isoprene-degrading bacteria associated with the phyllosphere of Salix fragilis, a high isoprene-emitting willow of the northern hemisphere

Auteurs: Gibson, L., Crombie, A.T., McNamara, N.P. and Murrell, J.C.
Publié dans: Environmental Microbiome, Numéro 16 (1), 2021, Page(s) 1-13, ISSN 2524-6372
Éditeur: MDPI
DOI: 10.1186/s40793-021-00386-x

Draft Genome Sequences of Three Terrestrial Isoprene-Degrading Rhodococcus Strains

Auteurs: Andrew T. Crombie, Helen Emery, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Genome Announcements, Numéro 5/45, 2017, Page(s) e01256-17, ISSN 2169-8287
Éditeur: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/genomeA.01256-17

Microbial cycling of isoprene, the most abundantly produced biological volatile organic compound on Earth

Auteurs: Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie, J. Colin Murrell
Publié dans: The ISME Journal, 2018, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-018-0072-6

Identification and characterisation of isoprene-degrading bacteria in an estuarine environment

Auteurs: Antonia Johnston, Andrew T. Crombie, Myriam El Khawand, Leanne Sims, Gregg M. Whited, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 19/9, 2017, Page(s) 3526-3537, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.13842

Gene probing reveals the widespread distribution, diversity and abundance of isoprene-degrading bacteria in the environment

Auteurs: Ornella Carrión, Nasmille L. Larke-Mejía, Lisa Gibson, Muhammad Farhan Ul Haque, Javier Ramiro-García, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Microbiome, Numéro 6/1, 2018, ISSN 2049-2618
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1186/s40168-018-0607-0

Poplar phyllosphere harbors disparate isoprene-degrading bacteria

Auteurs: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Larke-Mejia, Helen Emery, Robin Dawson, Jennifer Pratscher, Gordon P. Murphy, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 115/51, 2018, Page(s) 13081-13086, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1812668115

Novel Isoprene-Degrading Proteobacteria From Soil and Leaves Identified by Cultivation and Metagenomics Analysis of Stable Isotope Probing Experiments

Auteurs: Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Jennifer Pratscher, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.02700

Isoprene Oxidation by the Gram-Negative Model bacterium Variovorax sp. WS11

Auteurs: Robin A. Dawson, Nasmille L. Larke-Mejía, Andrew T. Crombie, Muhammad Farhan Ul Haque, J. Colin Murrell
Publié dans: Microorganisms, Numéro 8/3, 2020, Page(s) 349, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8030349

Diversity of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from a high isoprene-emitting environment: a Malaysian oil palm plantation

Auteurs: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M. O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J. M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Microbiome, Numéro 8/1, 2020, ISSN 2049-2618
Éditeur: Springer-Nature
DOI: 10.1186/s40168-020-00860-7

Molecular Ecology of Isoprene-Degrading Bacteria

Auteurs: Ornella Carrión, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Microorganisms, Numéro 8/7, 2020, Page(s) 967, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8070967

Complete Genome of Isoprene Degrading Nocardioides sp. WS12

Auteurs: Lisa Gibson, Nasmille L. Larke-Mejía, J. Colin Murrell
Publié dans: Microorganisms, Numéro 8/6, 2020, Page(s) 889, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms8060889

Microbial metabolism of isoprene: a much-neglected climate-active gas

Auteurs: J. Colin Murrell, Terry J. McGenity, Andrew T. Crombie
Publié dans: Microbiology, Numéro May 2020, 2020, Page(s) 1-14, ISSN 1350-0872
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/mic.0.000931

Identification of isoprene-degrading bacteria in phyllosphere and soil communities from high isoprene-emitting oil palm trees by DNA-stable isotope probing

Auteurs: Ornella Carrión, Lisa Gibson, Dafydd M.O. Elias, Niall P. McNamara, Theo A. van Alen, Huub J.M. Op den Camp, Christina Vimala Supramaniam, J. Colin Murrell
Publié dans: Access Microbiology, Numéro 2/7A, 2020, ISSN 2516-8290
Éditeur: Microbiology Society
DOI: 10.1099/acmi.ac2020.po0460

The microbiology of isoprene cycling in aquatic ecosystems

Auteurs: RA Dawson, AT Crombie, P Pichon, M Steinke, TJ McGenity, JC Murrell
Publié dans: Aquatic Microbial Ecology, 2021, ISSN 0948-3055
Éditeur: Inter-Research Science Publishing
DOI: 10.3354/ame01972

Peering down the sink: a review of isoprene metabolism by bacteria

Auteurs: Dawson, R.A., Crombie, A.T Jansen, R. S., Smith, T.J., Nichol, T. and Murrell, J.C.
Publié dans: Environmental Mirobiology, Numéro 25, 2022, Page(s) 1-14, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16325

Genome characterisation of an isoprene-degrading Alcaligenes sp. isolated from a tropical restored forest

Auteurs: Uttarotai, T.; Sutheeworapong, S.; Crombie, A.T.; Murrell, C.; Mhuantong, W.; Noirungsee, N.; Wangkarn, S.; Bovonsombut, S.; McGenity, T.J.; Chitov, T.
Publié dans: Biology, Numéro 11 (4), 2022, Page(s) 519, ISSN 2079-7737
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/biology11040519

Purification and characterisation of the isoprene monooxygenase from Rhodococcus sp. AD45

Auteurs: Sims, LP; Lockwood, CWJ; Crombie, AT; Bradley, JM; Le Brun, NE; Murrell, JC
Publié dans: Applied and Environmental Microbiology, Numéro 88 (7), 2022, Page(s) e00029-22, ISSN 0099-2240
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00029-22

Other (1)

Oil palm soil helps degrade environmental isoprene

Auteurs: Ornella Carrion, Lisa Gibson, Dafydd Elias, Niall McNamara, Theo van Alen, Huub Op den Camp, Christina Supramaniam, Terry McGenity, Colin Murrell
Publié dans: Research Square, Numéro Video, 2020
Éditeur: MDPI

Book chapters (2)

Genetics and Ecology of Isoprene Degradation

Auteurs: Andrew T. Crombie, Nasmille L. Mejia-Florez, Terry J. McGenity, J. Colin Murrell
Publié dans: Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils and Lipids. Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology, Numéro 2018, 2018, Page(s) 1-15, ISBN 978-3-319-39782-5
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-39782-5_27-1

DNA-, RNA-, and Protein-based stable-isotope probing for high-throughput biomarker analysis of active microorganisms

Auteurs: Jameson, E., Taubert, M., Angel, R., Coyotzi, S., Chen, Y., Eyice, O., Schäfer, H., Murrell, J.C., Neufeld, J.D. and Dumont, M.G
Publié dans: Metagenomics, 2022, Page(s) 261-282, ISSN 1940-6029
Éditeur: Humana Press, New York
DOI: 10.1007/978-1-0716-2795-2