Evolutionary genetics of guppy sex chromosomes

Informazioni relative al progetto

GUPPYSEX

ID dell’accordo di sovvenzione: 695225

DOI

10.3030/695225

Progetto chiuso

Data della firma CE 1 Luglio 2016

Data di avvio 1 Agosto 2016

Data di completamento 31 Luglio 2022

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 550 235,00

Contributo UE

€ 1 550 235,00

Coordinato da

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
United Kingdom

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (17)

Improved Reference Genome Uncovers Novel Sex-Linked Regions in the Guppy (Poecilia reticulata)

Autori: Bonnie A Fraser, James R Whiting, Josephine R Paris, Cameron J Weadick, Paul J Parsons, Deborah Charlesworth, Roberta Bergero, Felix Bemm, Margarete Hoffmann, Verena A Kottler, Chang Liu, Christine Dreyer, Detlef Weigel
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, Numero 12/10, 2020, Pagina/e 1789-1805, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evaa187

PromethION sequencing and assembly of the genome of Micropoecilia picta, a fish with a highly degenerated Y chromosome

Autori: D Charlesworth, C. Graham, U. Trivedi, J. Gardner and R. Bergero
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, 2021, Pagina/e evab171, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evab171

When and how do sex-inked regions become sex chromosomes

Autori: D. Charlesworth
Pubblicato in: Evolution, 2021, Pagina/e 569-581, ISSN 0014-3820
Editore: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1111/evo.14196

Young sex chromosomes in plants and animals.

Autori: Charlesworth, Deborah
Pubblicato in: Charlesworth , D 2019 , ' Young sex chromosomes in plants and animals ' , New Phytologist , vol. 224 , no. 3 . https://doi.org/10.1111/nph.16002, Numero 1, 2019, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16002

Exaggerated heterochiasmy in a fish with sex-linked male coloration polymorphisms

Autori: Roberta Bergero, Jim Gardner, Beth Bader, Lengxob Yong, Deborah Charlesworth
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 116/14, 2019, Pagina/e 6924-6931, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1818486116

Some thoughts about the words we use for thinking about sex chromosome evolution

Autori: D. Charlesworth
Pubblicato in: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2022, Pagina/e rstb.2021.0314, ISSN 0962-8436
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2021.0314

Evidences for a role of two Y-specific genes in sex determination in Populus deltoides

Autori: Liangjiao Xue, Huaitong Wu, Yingnan Chen, Xiaoping Li, Jing Hou, Jing Lu, Suyun Wei, Xiaogang Dai, Matthew S. Olson, Jianquan Liu, Mingxiu Wang, Deborah Charlesworth, Tongming Yin
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19559-2

Chromosome‐scale assembly of the genome of Salix dunnii reveals a male‐heterogametic sex determination system on chromosome 7

Autori: Li He, Kai‐Hua Jia, Ren‐Gang Zhang, Yuan Wang, Tian‐Le Shi, Zhi‐Chao Li, Si‐Wen Zeng, Xin‐Jie Cai, Natascha Dorothea Wagner, Elvira Hörandl, Aline Muyle, Ke Yang, Deborah Charlesworth, Jian‐Feng Mao
Pubblicato in: Molecular Ecology Resources, 2021, ISSN 1755-098X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1755-0998.13362

Local adaptation and the evolution of inversions on sex chromosomes and autosomes

Autori: Tim Connallon, Colin Olito, Ludovic Dutoit, Homa Papoli, Filip Ruzicka, Lengxob Yong
Pubblicato in: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 373/1757, 2018, Pagina/e 20170423, ISSN 0962-8436
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2017.0423

The Guppy Sex Chromosome System and the Sexually Antagonistic Polymorphism Hypothesis for Y Chromosome Recombination Suppression

Autori: Deborah Charlesworth
Pubblicato in: Genes, Numero 9/5, 2018, Pagina/e 264, ISSN 2073-4425
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes9050264

Locating the sex determining region of linkage group 12 of guppy (Poecilia reticulata)

Autori: Chay Graham; Deborah Charlesworth; Roberta Bergero; Lengxob Yong; Jim Gardner
Pubblicato in: G3, Numero 3, 2020, ISSN 2160-1836
Editore: Genetics Society of America
DOI: 10.1101/2020.04.30.063420

The timing of genetic degeneration of sex chromosomes

Autori: D. Charlesworth
Pubblicato in: Philosophical Transactions B., 2021, Pagina/e rstb.2020.0093, ISSN 0962-8436
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2020.0093

How did the guppy Y chromosome evolve?

Autori: Charlesworth, D., R. Bergero, C. Graham, J. Gardner and K. Keegan
Pubblicato in: PLoS Genetics, 2021, Pagina/e 1009704 Ithis journal doesn't have page numbers), ISSN 1553-7404
Editore: Public library of science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009704

Reply to Wright et al.: How to explain the absence of extensive Y-specific regions in the guppy sex chromosomes

Autori: Roberta Bergero, Deborah Charlesworth
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 116/26, 2019, Pagina/e 12609-12610, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1906633116

Sensory-based quantification of male colour patterns in Trinidadian guppies reveals no support for parallel phenotypic evolution in multivariate trait space

Autori: Yong, L., Croft, D. P., Troscianko, J., Ramnarine, I. W., & Wilson, A. J.
Pubblicato in: Molecular Ecology, 2022, ISSN 0962-1083
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16039

Partial sex linkage and linkage disequilibrium on the guppy sex chromosome

Autori: Lengxob Yong, Alastair Wilson, Darren Croft, Chay Graham, Deborah Charlesworth
Pubblicato in: Molecular Ecology, 2022, Pagina/e 5524-5537, ISSN 0962-1083
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16674

Using GC content to compare recombination patterns on the sex chromosomes and autosomes of the guppy, Poecilia reticulata, and its close outgroup species

Autori: Roberta Bergero; Lengxob Yong; Deborah Charlesworth; Chay Graham; Jim Gardner; Yexin Zhang
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero 1, 2020, ISSN 0737-4038
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.05.22.110635