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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Predictive modelling of 3D genome topology during progressive stages of embryonic development

Objetivo

The mechanisms that regulate genome activation and gene expression occur within a complex three-dimensional (3D) architecture, that helps bring functional regulatory elements into spatial proximity. Although observed at individual loci, the general principles and dynamics of enhancer-promoter interactions remain very poorly understood. The proposed project will use chromosome conformation capture, Hi-C, to measure 3D chromatin interactions at a genome-wide scale across different stages of embryogenesis.
The project will build on the Furlong lab’s recent findings in genome topology. First, it will look at changes in chromosome conformation during the entire developmental time-span to determine if the stability of interactions observed during the early stages holds true to the end of embryogenesis. It will also compare high-resolution interaction frequencies in two different cells types (mesodermal and neuronal) during different stages of development. The project will consider the entire spectrum of possible interactions, as opposed to a narrow set of enhancers, and thereby yield the first high-resolution view of the overall topology of the Drosophila genome as it develops and the general ‘search-space’ of developmental enhancers. Second, the results will identify constitutive and dynamic chromatin interactions, revealing the extent to which enhancer-promoter interactions change between cell types as they transition from a multipotent state to a terminally differentiated tissue. Third, these data will be used to make an integrative predictive model of chromatin loop formation, which should yield mechanistic insights into how chromatin contacts are formed and predict their dynamic or constitutive behaviour.
Given that the general principles underlying genomic architecture are deeply conserved, the project should not only help to explain regulatory principles underlying Drosophila development, but also greatly enhance our understanding of general chromatin organization.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2015

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 171 460,80
Dirección
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Alemania

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Región
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 171 460,80
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