Obiettivo
During embryonic development a single cell turns into a complex organism. This process is characterized by an antagonism between variation and stability. On the one hand, development is a tightly controlled process; tissues need to be specified at the right time, at the correct spatial position, and with a defined size. On the other hand, regulation should not be too rigid, since embryos need to adjust to environmental perturbations and correct errors caused by noisy gene expression. We will study variation and stability during pattern formation in the zebrafish heart. We seek to understand the origin of embryo-to-embryo variability as well as robustness against perturbation.
The zebrafish heart is a powerful model system for studying variability, since heart positioning is inverted along the left/right axis in 5-10% of wildtype embryos. We aim to identify the mechanism underlying variability in heart positioning and understand its function. To this end, we will combine two innovative approaches: Tomo-seq, a novel method for spatially-resolved transcriptomics developed by the applicant; and single-molecule FISH, a technique that allows absolute quantification of gene expression in single cells.
To expand our study of embryo-to-embryo variability beyond gene expression analysis, we will optimize a method for massively parallel single-cell lineage tracing based on CRISPR-Cas. This novel approach will allow us to study embryo-to-embryo variability in developmental lineage specification on the single cell level. We will use this strategy to systematically explore the corrective capacity of the zebrafish heart upon perturbation of progenitor cell pools, and to determine which mechanisms for error correction are activated in the embryo.
These quantitative experiments will provide unprecedented insight into variability and robustness during development. The concepts developed here will also be relevant for improving our understanding of variable outcomes in human disease.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biologia dello sviluppo
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione scienze computazionali
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina clinica embriologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-STG - Starting Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
13125 Berlin
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.