Illuminating GENome Organization through integrated MIcroscopy and Sequencing

Informazioni relative al progetto

GENOMIS

ID dell’accordo di sovvenzione: 715727

DOI 10.3030/715727

Progetto chiuso

Data della firma CE 7 Ottobre 2016

Data di avvio 1 Gennaio 2018

Data di completamento 31 Dicembre 2023

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale € 1 499 808,00

Contributo UE € 1 499 808,00

Coordinato da

KAROLINSKA INSTITUTET
Sweden

Pubblicazioni

Non-peer reviewed articles (1)

Dangerous RNA links pave the way to glioblastoma

Autori: Magda Bienko
Pubblicato in: Molecular Cell, 2023, ISSN 1097-4164
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.029

Peer reviewed articles (8)

A GC-centered view of 3D genome organization

Autori: Britta Am, Bouwman; Nicola, Crosetto; Magda, Bienko
Pubblicato in: Current Opinion in Genetics & Development, 2022, ISSN 0959-437X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2022.102020

Simultaneous visualization of DNA loci in single cells by combinatorial multi-color iFISH

Autori: Ana Mota, Maud Schweitzer, Erik Wernersson, Nicola Crosetto, Magda Bienko
Pubblicato in: Scientific Data, 2022, ISSN 2052-4463
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41597-022-01139-2

FRET-FISH probes chromatin compaction at individual genomic loci in single cells

Autori: Mota A, Berezicki S, Wernersson E, Harbers L, Li-Wang X, Gradin K, Peuckert C, Crosetto N, Bienko M.
Pubblicato in: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34183-y

Radial Organization in the Mammalian Nucleus

Autori: Nicola Crosetto, Magda Bienko
Pubblicato in: Frontiers in Genetics, Numero 11, 2020, ISSN 1664-8021
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2020.00033

iFISH is a publically available resource enabling versatile DNA FISH to study genome architecture

Autori: Eleni Gelali, Gabriele Girelli, Masahiro Matsumoto, Erik Wernersson, Joaquin Custodio, Ana Mota, Maud Schweitzer, Katalin Ferenc, Xinge Li, Reza Mirzazadeh, Federico Agostini, John P. Schell, Fredrik Lanner, Nicola Crosetto, Magda Bienko
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09616-w

GPSeq reveals the radial organization of chromatin in the cell nucleus

Autori: Gabriele Girelli, Joaquin Custodio, Tomasz Kallas, Federico Agostini, Erik Wernersson, Bastiaan Spanjaard, Ana Mota, Solrun Kolbeinsdottir, Eleni Gelali, Nicola Crosetto, Magda Bienko
Pubblicato in: Nature Biotechnology, 2020, ISSN 1087-0156
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-020-0519-y

RNA gradients: Shapers of 3D genome architecture

Autori: Britta A.M. Bouwman; Nicola Crosetto; Magda Bienko
Pubblicato in: Current Opinion in Cell Biology, 2021, ISSN 0955-0674
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ceb.2021.12.001

The era of 3D and spatial genomics

Autori: Britta A M Bouwman, Nicola Crosetto, Magda Bienko
Pubblicato in: Trends in Genetics, 2022, ISSN 0168-9525
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2022.05.010