Dissecting the crosstalk between metabolism and transcriptional regulation in pluripotent stem cells.

Mitochondrial fission links ECM mechanotransduction to metabolic redox homeostasis and metastatic chemotherapy resistance.

Autoren: Romani P, Nirchio N, Arboit M, Barbieri V, Tosi A, Michielin F, Shibuya S, Benoist T, Wu D, Hindmarch CCT, Giomo M, Urciuolo A, Giamogante F, Roveri A, Chakravarty P, Montagner M, Calì T, Elvassore N, Archer SL, De Coppi P, Rosato A, Martello G, Dupont S
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, Ausgabe 24, 2022, Seite(n) 168-180, ISSN 1465-7392
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-00843-w

3D ECM-rich environment sustains the identity of naive human iPSCs.

Autoren: Cesare E, Urciuolo A, Stuart HT, Torchio E, Gesualdo A, Laterza C, Gagliano O, Martewicz S, Cui M, Manfredi A, Di Filippo L, Sabatelli P, Squarzoni S, Zorzan I, Betto RM, Martello G, Cacchiarelli D, Luni C, Elvassore N
Veröffentlicht in: Cell Stem Cell, Ausgabe 29, 2022, Seite(n) 1703-1717, ISSN 1934-5909
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.011

Metabolic control of DNA methylation in naive pluripotent cells

Autoren: Betto RM, Diamante L, Perrera V, Audano M, Rapelli S, Lauria A, Incarnato D, Arboit M, Pedretti S, Rigoni G, Guerineau V, Touboul D, Stirparo GG, Lohoff T, Boroviak T, Grumati P, Soriano ME, Nichols J, Mitro N, Oliviero S, Martello G.
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 53, 2021, Seite(n) 215-229, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00770-2

PsiNorm: a scalable normalization for single-cell RNA-seq data.

Autoren: Borella M, Martello G, Risso D, Romualdi C.
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 38, 2021, Seite(n) 164-172, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioinformatics/btab641

BrewerIX enables allelic expression analysis of imprinted and X-linked genes from bulk and single-cell transcriptomes.

Autoren: Martini P, Sales G, Diamante L, Perrera V, Colantuono C, Riccardo S, Cacchiarelli D, Romualdi C, Martello G.
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 5, 2022, Seite(n) 146, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03087-4

STAT3 and HIF1α cooperatively mediate the transcriptional and physiological responses to hypoxia

Autoren: Dinarello A, Betto RM, Diamante L, Tesoriere A, Ghirardo R, Cioccarelli C, Meneghetti G, Peron M, Laquatra C, Tiso N, Martello G, Argenton F.
Veröffentlicht in: Cell Death Discovery, Ausgabe 9, 2023, Seite(n) 226, ISSN 2058-7716
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41420-023-01507-w

Y705 and S727 are required for the mitochondrial import and transcriptional activities of STAT3, and for regulation of stem cell proliferation.

Autoren: Peron M, Dinarello A, Meneghetti G, Martorano L, Betto RM, Facchinello N, Tesoriere A, Tiso N, Martello G, Argenton F.
Veröffentlicht in: Development, Ausgabe 148, 2021, Seite(n) dev199477, ISSN 1477-9129
Herausgeber: The Company of Biologists
DOI: 10.1242/dev.199477

Metabolic regulation in pluripotent stem cells

Autoren: Diamante L, Martello G.
Veröffentlicht in: Current Opinion in Genetics & Development, Ausgabe 75, 2022, Seite(n) 101923, ISSN 0959-437X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2022.101923

Direct generation of human naive induced pluripotent stem cells from somatic cells in microfluidics

Autoren: Stefano Giulitti, Marco Pellegrini, Irene Zorzan, Paolo Martini, Onelia Gagliano, Margherita Mutarelli, Michael Johannes Ziller, Davide Cacchiarelli, Chiara Romualdi, Nicola Elvassore, Graziano Martello
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, Ausgabe 21/2, 2019, Seite(n) 275-286, ISSN 1465-7392
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-018-0254-5

A common molecular logic determines embryonic stem cell self‐renewal and reprogramming

Autoren: Sara‐Jane Dunn, Meng Amy Li, Elena Carbognin, Austin Smith, Graziano Martello
Veröffentlicht in: The EMBO Journal, Ausgabe 38/1, 2019, Seite(n) e100003, ISSN 0261-4189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2018100003

How Does Reprogramming to Pluripotency Affect Genomic Imprinting?

Autoren: Valentina Perrera, Graziano Martello
Veröffentlicht in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Ausgabe 7, 2019, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fcell.2019.00076

The transcriptional regulator ZNF398 mediates pluripotency and epithelial character downstream of TGF-beta in human PSCs

Autoren: Irene Zorzan, Marco Pellegrini, Mattia Arboit, Danny Incarnato, Mara Maldotti, Mattia Forcato, Guidantonio Malagoli Tagliazucchi, Elena Carbognin, Marco Montagner, Salvatore Oliviero, Graziano Martello
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16205-9

Chemical conversion of human conventional PSCs to TSCs following transient naive gene activation

Autoren: Zorzan I, Betto RM, Rossignoli G, Arboit M, Drusin A, Corridori C, Martini P, Martello G.
Veröffentlicht in: EMBO reports, Ausgabe 24, 2023, Seite(n) e55235, ISSN 1469-3178
Herausgeber: EMBO Press
DOI: 10.15252/embr.202255235

Esrrb guides naive pluripotent cells through the formative transcriptional programme.

Autoren: Carbognin E, Carlini V, Panariello F, Chieregato M, Guerzoni E, Benvegnù D, Perrera V, Malucelli C, Cesana M, Grimaldi A, Mutarelli M, Carissimo A, Tannenbaum E, Kugler H, Hackett JA, Cacchiarelli D, Martello G
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, Ausgabe 25, 2023, Seite(n) 643-657, ISSN 1476-4679
Herausgeber: springer Nature
DOI: 10.1038/s41556-023-01131-x

Genome-wide screening in pluripotent cells identifies Mtf1 as a suppressor of mutant huntingtin toxicity.

Autoren: Ferlazzo GM, Gambetta AM, Amato S, Cannizzaro N, Angiolillo S, Arboit M, Diamante L, Carbognin E, Romani P, La Torre F, Galimberti E, Pflug F, Luoni M, Giannelli S, Pepe G, Capocci L, Di Pardo A, Vanzani P, Zennaro L, Broccoli V, Leeb M, Moro E, Maglione V, Martello G.
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, Seite(n) 3962, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39552-9

Using Microfluidics to Generate Human Naïve and Primed Pluripotent Stem Cells

Autoren: Zorzan I, Gagliano O, Elvassore N, Martello G
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Ausgabe 2416, 2021, Seite(n) 53-71, ISBN 978-1-0716-1907-0
Herausgeber: Humana
DOI: 10.1007/978-1-0716-1908-7_5

Mitochondrial STAT3 regulates proliferation of tissue stem cells

Autoren: Margherita Peron, Giacomo Meneghetti, Alberto Dinarello, Laura Martorano, Riccardo M. Betto, Nicola Facchinello, Natascia Tiso, Graziano Martello, Francesco Argenton
Veröffentlicht in: www.biorXiv.org, 2020
Herausgeber: Cold Spring Harbor Press
DOI: 10.1101/2020.07.17.208264

Allelic expression analysis of Imprinted and X-linked genes from bulk and single-cell transcriptomes

Autoren: Paolo Martini, Gabriele Sales, Valentina Perrera, Linda Diamante, Chiara Romualdi, Graziano Martello
Veröffentlicht in: www.bioRxiv.org, 2020
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2020.05.20.105841

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