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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Algorithms and experimental tools for integrating very large-scale single cell genomics data

Ziel

Robust and flexible tissue- and cell-type specific gene regulation is a definitive prerequisite for complex function in any multi-cellular organism. Modern genomics and epigenomics provide us with catalogues of gene regulatory elements and maps illustrating their activity in different tissues. Nevertheless, we are far from being able to explain emergence and maintenance of cellular states from such data, partly because we so far lacked characterization of individual molecular states and genome control mechanisms at their native resolution - the single cell. Recently, new approaches developed by the single cell genomics community, with several contributions from our group, allow massive acquisition of data on the transcriptional, epigenomic and chromosomal conformation states in large cohorts of single cells. In this research program, we aim to move forward rapidly to bridge a major gap between these experimental breakthroughs and models of genome regulation in complex tissues. We will develop algorithms and models for representing data the transcriptional profiles, DNA methylation landscapes and Hi-C maps of literally millions of cells. Our tools will be designed specifically to leverage on new single cell RNA-seq, single cell Hi-C, single cell capture-pBat and higher order 4C-seq that we will continue to develop experimentally. Furthermore, we shall enhance and optimize our interdisciplinary framework hand in hand with a working model aiming at unprecedentedly comprehensive single cell analysis of E8-E10 mouse embryos. This will provide us with hundreds of worked-out cases of tissue specific gene regulation. The techniques and insights from these studies will then be used to characterize cell type aberrations and epigenetic reprogramming in tumors. The open algorithms, techniques and methodology we shall develop can accelerate research in multiple groups that will utilize single cell genomics to study numerous questions on gene regulation in the coming years.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-COG - Consolidator Grant

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2016-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 437 500,00
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 437 500,00

Begünstigte (1)

Mein Booklet 0 0