Obiettivo
In Fragment-Based Lead Discovery (FBLD) highly sensitive biochemical and biophysical screening technologies are used to detect the low-affinity binding of low-molecular-weight compounds (the so-called fragments) to biological targets that are involved in pathophysiological processes. Knowledge of the molecular interactions between fragment hit(s) and the target protein allows the rational generation of high-quality leads for drug development. Thus, high-resolution (e.g. X-ray crystallography) and relatively high-throughput structure determination technologies are key to this approach but they can become a limiting factor for both technical and economical reasons. As a matter of fact, when the experimental characterization of binding mode fails, the success rate of FBLD approaches drastically drops. To overcome current limitations in FLBD, here we propose the development of a computational framework based on advanced-sampling molecular dynamics simulations to map the binding of fragments to protein surfaces on the proteome scale---thus generating the Fragmentome Altas. For each individual target this will allow to: a) systematically identify fragments binding to protein surfaces and cryptic pockets; b) reconstruct the mechanism of binding with atomistic spatiotemporal resolution; c) characterize the molecular determinants of affinity and kinetics in fragment-protein complexes. This insight is fundamental for optimizing and evolving fragments to lead compounds with desired thermodynamics and kinetics features. To date, neither experimental nor computational approaches can provide such information at affordable costs while maintaining the high throughput needed for screening campaigns. The successful implementation of this ambitious project lies in the unique combination of expertise of its participants, and it will allow a novel state-of-the-art for modern drug discovery to be established. The Fragentome Atlas will be a freely accessible on-line server.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia scoperta di farmaci
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze della terra e scienze ambientali connesse geologia mineralogia cristallografia
- scienze naturali scienze fisiche termodinamica
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2016
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
08028 BARCELONA
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.