Objetivo
CRISPR-Cas immune system represents one of the most effective weapons against mobile genetic elements in the host defense arsenal. Bacteriophages (phages) armed with anti-CRISPR proteins can, however, inhibit CRISPR immunity by sabotaging components of the immune system with evolutionary advantages. This proposal sets out to discover novel phage-encoded anti-CRISPR proteins and understand the molecular mechanisms of the inhibitory processes.
I will focus on novel anti-CRISPR proteins for Cas9-containing type II CRISPR-Cas systems in lactic acid bacteria (LAB). I expect anti-CRISPR proteins to be present in phages for LAB, for which the CRISPR system is an important line of defense. It is highly plausible that LAB-infecting phages have evolved to possess anti-CRISPR proteins. However, none of anti-CRISPR proteins against type II CRISPR have been described so far. To identify novel type II anti-CRISPR proteins encoded by phage genomes and explore novel features of the anti-CRISPR proteins, I will establish high-throughput screening methods using an integrated approach consisting of metagenomics, bioinformatics and mass spectrometry. After identifying candidate anti-CRISPR proteins, I will uncover the underlying molecular mechanisms of these viral anti-CRISPR proteins utilizing state-of-the-art single-molecule fluorescence methodologies.
The fierce virus–host arms race has resulted in high diversity of distinct prokaryotic CRISPR-Cas systems. Therefore, I anticipate that my high-throughput screening will lead to discovery of remarkably diverse anti-CRISPR proteins, specifically anti-CRISPR variants targeting Cas9. The proposed combination of viral diversity screening and single-molecule approaches will reveal novel mechanisms of anti-CRISPR activity that are difficult to obtain by traditional biochemistry, will impact potential applications of Cas9, and will provide unique insights into the host-virus arms race.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ciencias naturales ciencias químicas química orgánica ácido orgánico
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2016
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
2628 CN DELFT
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.