The EUropean TRAnsplantation and INnovation (EU-TRAIN) consortium for improving diagnosis and risk stratification in kidney transplant patients

Informations projet

EU-TRAIN

N° de convention de subvention: 754995

DOI

10.3030/754995

Projet clôturé

Date de signature de la CE 27 Novembre 2017

Date de début 1 Janvier 2018

Date de fin 30 Juin 2024

Financé au titre de

• SOCIETAL CHALLENGES - Health, demographic change and well-being

Coût total

€ 6 641 546,00

Contribution de l’UE

€ 6 641 546,00

Coordonné par

INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
France

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Other (2)

EUTRAIN-ESOT statistics course on risk stratification
EU-TRAIN session in ESOT events

EU-TRAIN session in ESOT events (M28 and M54)

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Communication and Dissemination tools

Publications

Peer reviewed articles (30)

Interferome signature dynamics during the anti-dengue immune response: a systems biology characterization

Auteurs: Júlia Nakanishi Usuda, Desirée Rodrigues Plaça, Dennyson Leandro M. Fonseca, Alexandre H. C. Marques, Igor Salerno Filgueiras, Victor Gabriel Bastos Chaves, Anny Silva Adri, Amanda Torrentes-Carvalho, Mario Hiroyuki Hirata, Paula Paccielli Freire, Rusan Catar, Gustavo Cabral-Miranda, Lena F. Schimke, Guido Moll, Otavio Cabral-Marques
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-3224
Éditeur: Fron. Immunol.
DOI: 10.3389/fimmu.2023.1243516

Surfing the Big Data Wave: Omics Data Challenges in Transplantation

Auteurs: Ba, Rokhaya; Geffard, Estelle; Douillard, Venceslas; Simon, Françoise; Mesnard, Laurent; Vince, Nicolas ; Gourraud, Pierre-Antoine; Limou, Sophie
Publié dans: Transplantation, 2021, ISSN 0041-1337
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1097/tp.0000000000003992

Multiple sclerosis clinical decision support system based on projection to reference datasets

Auteurs: Chadia Ed-driouch , Florent Chéneau, Françoise Simon, Guillaume Pasquier, Benoit Combès, Anne Kerbrat, Emmanuelle Le Page, Sophie Limou, Nicolas Vince, David-Axel Laplaud, Franck Mars, Cedric Dumas, Gilles Edan & Pierre-Antoine Gourraud
Publié dans: Annals of Clinical and Translational Neurology, Numéro Volume 9, Numéro 12, 2022, Page(s) 1863-1873, ISSN 2328-9503
Éditeur: -
DOI: 10.1002/acn3.51649

Subclinical rejection-free diagnostic after kidney transplantation using blood gene expression

Auteurs: Danger R, Le Berre L, Cadoux M, Kerleau C, Papuchon E, Mai HL, Nguyen TV, Guérif P, Morelon E, Thaunat O, Legendre C, Anglicheau D, Lefaucheur C, Couzi L, Del Bello A, Kamar N, Le Quintrec M, Goutaudier V, Renaudin K, Giral M, Brouard S; DIVAT Consortium
Publié dans: Kidney International, Numéro 2023 Jun;103(6):1167-1179, 2023, ISSN 0085-2538
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.kint.2023.03.019

CMV-specific Cell-mediated Immunity at 3-month Prophylaxis Withdrawal Discriminates D+/R+ Kidney Transplants at Risk of Late-onset CMV Infection Regardless the Type of Induction Therapy

Auteurs: Marta Jarque, Edoardo Melilli, Elena Crespo, Anna Manonelles, Nuria Montero, Joan Torras, Josep M. Cruzado, Sergi Luque, Salvador Gil-Vernet, Josep M. Grinyó, Oriol Bestard
Publié dans: Transplantation, Numéro 102, 2023, Page(s) e472-e480, ISSN 0041-1337
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1097/tp.0000000000002421

Addressing the Challenges and Barriers to the Integration of Machine Learning into Clinical Practice: An Innovative Method to Hybrid Human–Machine Intelligence

Auteurs: Chadia Ed-driouch, Franck Mars, Pierre-Antoine Gourraud, Cédric Dumas
Publié dans: Sensors, Numéro Volume 22, Numéro 21, 2022, Page(s) 8313, ISSN 1424-8220
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s22218313

A Machine Learning-Driven Virtual Biopsy System For Kidney Transplant Patients

Auteurs: Daniel Yoo, Gillian Divard, Marc Raynaud, Aaron Cohen, Tom D. Mone, John Thomas Rosenthal, Andrew J. Bentall, Mark D. Stegall, Maarten Naesens, Huanxi Zhang, Changxi Wang, Juliette Gueguen, Nassim Kamar, Antoine Bouquegneau, Ibrahim Batal, Shana M. Coley, John S. Gill, Federico Oppenheimer, Erika De Sousa-Amorim, Dirk R. J. Kuypers, Antoine Durrbach, Daniel Seron, Marion Rabant, Jean-Paul Duong Va
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-44595-z

Immunosuppressant drugs and quality-of-life outcomes in kidney transplant recipients: An international cohort study (EU-TRAIN)

Auteurs: François R Girardin, Anna Nicolet, Oriol Bestard, Carmen Lefaucheur, Klemens Budde, Fabian Halleck, Sophie Brouard, Magali Giral, Pierre-Antoine Gourraud, Béatrice Horcholle, Jean Villard, Joachim Marti, Alexandre Loupy
Publié dans: Frontiers in Pharmacology, Numéro 2023 April 27, 2023, Page(s) 14:1040584, ISSN 1663-9812
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2023.1040584

High-dimensional mass cytometry identified circulating natural killer T-cell subsets associated with protection from cytomegalovirus infection in kidney transplant recipients

Auteurs: Laura Donadeu, Thomas Jouve, Sofia Bin, Susan Hartzell, Elena Crespo, Alba Torija, Marta Jarque, Delphine Kevella, José Zúñiga, Weijia Zhang, Zeguo Sun, Alberto Verlato, Mónica Martínez-Gallo, Cristina Font-Miñarro, Maria Meneghini, Nestor Toapanta, Irina B. Torres, Joana Sellarés, Manel Perelló, Hannah Kaminski, Lionel Couzi, Alexandre Loupy, Gaetano La Manna, Francesc Moreso, Paolo Crave
Publié dans: Kidney International, 2024, ISSN 0085-2538
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.kint.2024.03.027

Autoantibodies from patients with kidney allograft vasculopathy stimulate a proinflammatory switch in endothelial cells and monocytes mediated via GPCR-directed PAR1-TNF-α signaling

Auteurs: Guido Moll, Christian Luecht, Michael Adu Gyamfi, Dennyson L. M. da Fonseca, Pinchao Wang, Hongfan Zhao, Zexian Gong, Lei Chen, Muhamad Imtiaz Ashraf, Harald Heidecke, Alexander Maximilian Hackel, Duska Dragun, Klemens Budde, Olaf Penack, Gabriela Riemekasten, Otávio Cabral-Marques, Janusz Witowski, Rusan Catar
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-3224
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fimmu.2023.1289744

Distributing HLA database in histocompatibility: a shift in HLA data governance

Auteurs: Sirine Sayadi 1, 2 Venceslas Douillard 3, 4 Nicolas Vince 3, 4 Mario Südholt 1, 2 Pierre-Antoine Gourraud 4, 3 
Publié dans: Exploration of Immunology , 2022, ISSN 2768-6655
Éditeur: Exploration of Immunology 

Race-free estimated glomerular filtration rate equation in kidney transplant recipients: development and validation study

Auteurs: Raynaud M, Al-Awadhi S, Juric I, Divard G, Lombardi Y, Basic-Jukic N, Aubert O, Dubourg L, Masson I, Mariat C, Prié D, Pernin V, Le Quintrec M, Larson TS, Stegall MD, Bikbov B, Ruggenenti P, Mesnard L, Ibrahim HN, Nielsen MB, Matas AJ, Nankivell BJ, Benjamens S, Pol RA, Bakker SJL, Jouven X, Legendre C, Kamar N, Smith BH, Wadei HM, Durrbach A, Vincenti F, Remuzzi G, Lefaucheur C, Bentall AJ, Loup
Publié dans: The BMJ, Numéro 2023 May, 2023, Page(s) 381:e073654, ISSN 0959-8138
Éditeur: BMJ
DOI: 10.1136/bmj-2022-073654

An automated histological classification system for precision diagnostics of kidney allografts

Auteurs: Yoo D, Goutaudier V, Divard G, Gueguen J, Astor BC, Aubert O, Raynaud M, Demir Z, Hogan J, Weng P, Smith J, Garro R, Warady BA, Zahr RS, Sablik M, Twombley K, Couzi L, Berney T, Boyer O, Duong-Van-Huyen JP, Giral M, Alsadi A, Gourraud PA, Morelon E, Le Quintrec M, Brouard S, Legendre C, Anglicheau D, Villard J, Zhong W, Kamar N, Bestard O, Djamali A, Budde K, Haas M, Lefaucheur C, Rabant M, Loupy
Publié dans: Nature medicine, Numéro 2023 May, 2023, Page(s) 29(5):1211-1220, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-023-02323-6

Comparison of artificial intelligence and human-based prediction and stratification of the risk of long-term kidney allograft failure.

Auteurs: Divard G, Raynaud M, Tatapudi VS, Abdalla B, Bailly E, Assayag M, Binois Y, Cohen R, Zhang H, Ulloa C, Linhares K, Tedesco HS, Legendre C, Jouven X, Montgomery RA, Lefaucheur C, Aubert O, Loupy A
Publié dans: Communications medicine, Numéro 2022 Nov, 2022, Page(s) 2(1):150, ISSN 2730-664X
Éditeur: PubMed Central
DOI: 10.1038/s43856-022-00201-9

Evaluation of non-invasive biomarkers of kidney allograft rejection in a prospective multicenter unselected cohort study (EU-TRAIN)

Auteurs: Valentin Goutaudier, Richard Danger, Rusan Ali Catar, Maud Racapé, Aurélie Philippe, Michelle Elias, Marc Raynaud, Olivier Aubert, Didier Bouton, François Girardin, Éric Vicaut, Sarhan Yaiche, Jacques Demotes, Harald Heidecke, Jean-Luc Taupin, Christine Randoux-Lebrun, Mohamad Zaidan, Emmanuelle Papuchon, Hoa Le Mai, Thi-Van-Ha Nguyen, Francesc Moreso, Thierry Berney, Jean Villard, Christophe
Publié dans: Kidney International, 2024, ISSN 0085-2538
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.kint.2024.07.027

Long-Term Outcomes after Conversion to a Belatacept-Based Immunosuppression in Kidney Transplant Recipients

Auteurs: Gillian Divard, Olivier Aubert, Charlotte Debiais-Deschamp, Marc Raynaud, Valentin Goutaudier, Marta Sablik, Caroline Sayeg, Christophe Legendre, Julie Obert, Dany Anglicheau, Carmen Lefaucheur, Alexandre Loupy
Publié dans: Clinical Journal of the American Society of Nephrology, 2024, ISSN 1555-9041
Éditeur: American Society of Nephrology
DOI: 10.2215/cjn.0000000000000411

The global evolution and impact of systems biology and artificial intelligence in stem cell research and therapeutics development: a scoping review

Auteurs: Thayna Silva-Sousa, Júlia Nakanishi Usuda, Nada Al-Arawe, Francisca Frias, Irene Hinterseher, Rusan Catar, Christian Luecht, Katarina Riesner, Alexander Hackel, Lena F Schimke, Haroldo Dutra Dias, Igor Salerno Filgueiras, Helder I Nakaya, Niels Olsen Saraiva Camara, Stefan Fischer, Gabriela Riemekasten, Olle Ringdén, Olaf Penack, Tobias Winkler, Georg Duda, Dennyson Leandro M Fonseca, Otávio Ca
Publié dans: Stem Cells, 2024, ISSN 1066-5099
Éditeur: AlphaMed Press Inc
DOI: 10.1093/stmcls/sxae054

The Pseudokinase TRIB1 in Immune Cells and Associated Disorders

Auteurs: Richard Danger, Yodit Feseha and Sophie Brouard
Publié dans: Cancers, 2022, Page(s) 14(4), ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14041011

Pretransplant Donor-specific IFNγ ELISPOT as a Predictor of Graft Rejection

Auteurs: Nuria Montero, Samira Farouk, Ilaria Gandolfini, Elena Crespo, Marta Jarque, Maria Meneghini, Alba Torija, Umberto Maggiore, Paolo Cravedi, Oriol Bestard
Publié dans: Transplantation Direct, Numéro 5/5, 2019, Page(s) e451, ISSN 2373-8731
Éditeur: Wolters Kluwer Health, Inc
DOI: 10.1097/txd.0000000000000886

TCL1A, B Cell Regulation and Tolerance in Renal Transplantation

Auteurs: François Brinas, Richard Danger and Sophie Brouard
Publié dans: Cells, 2021, Page(s) 10(6), ISSN 2073-4409
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cells10061367

Antibody Mediated Rejection and T-cell Mediated Rejection Molecular Signatures Using Next-Generation Sequencing in Kidney Transplant Biopsies

Auteurs: Esteban Cortes Garcia, Alessia Giarraputo, Maud Racapé, Valentin Goutaudier, Cindy Ursule-Dufait, Pierre de la Grange, Lucie Adoux, Marc Raynaud, Clément Couderau, Fariza Mezine, Jessie Dagobert, Oriol Bestard, Francesc Moreso, Jean Villard, Fabian Halleck, Magali Giral, Sophie Brouard, Richard Danger, Pierre-Antoine Gourraud, Marion Rabant, Lionel Couzi, Moglie Le Quintrec, Nassim Kamar, Emmanu
Publié dans: Transplant International, Numéro 37, 2024, ISSN 1432-2277
Éditeur: Wiley
DOI: 10.3389/ti.2024.13043

Editorial: Emerging talents in alloimmunity and transplantation: 2022

Auteurs: Guido Moll, Wai H. Lim, Olaf Penack
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 15, 2024, ISSN 1664-3224
Éditeur: Front. Immunol.
DOI: 10.3389/fimmu.2024.1393026

An exome-wide study of renal operational tolerance

Auteurs: Massart A*, Danger R*, Olsen C*, Emond M J, Viklicky O, Jacquemin V, Soblet J, Croes D, Perazzolo C, Hruba P, Daneels D, Caljon B, Sever M S, Pascual J, Pirson I, Ghisdal L, Smits G, Giral M, Abramowicz D, Abramowicz M and Brouard S
Publié dans: Frontiers in Medicine, Numéro 17 May 2023 Sec. Nephrology Volume 9 - 2022, 2023, ISSN 2296-858X
Éditeur: -
DOI: 10.3389/fmed.2022.976248

FaDA: A web application for regular laboratory data analyses

Auteurs: Danger R, Moiteaux Q, Feseha Y, Geffard E, Ramstein G, Brouard S
Publié dans: PLoS One, 2021, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0261083

Secure distribution of Factor Analysis of Mixed Data (FAMD) and its application to personalized medicine of transplanted patients

Auteurs: S Sayadi, E Geffard, M Südholt, N Vince, PA Gourraud
Publié dans: Springer nature, 2021, ISSN 2509-4807
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-75100-5_44

Structural insights into the catalytic mechanism of granzyme B upon substrate and inhibitor binding

Auteurs: Tripathi N, Danger R, Chesneau M, Brouard S, Laurent AD
Publié dans: Journal of Molecular Graphics and Modelling, Numéro 2022 Mar 22;114:108167, 2022, ISSN 1873-4243
Éditeur: ELSEVIER
DOI: 10.1016/j.jmgm.2022.108167

Prognostic Biomarkers in Kidney Transplantation: A Systematic Review and Critical Appraisal

Auteurs: Marc Raynaud, Solaf Al-Awadhi, Kevin Louis, Huanxi Zhang, Xiaojun Su, Valentin Goutaudier, Jiali Wang, Zeynep Demir, Yongcheng Wei, Agathe Truchot, Antoine Bouquegneau, Arnaud Del Bello, Élodie Bailly, Yannis Lombardi, Mehdi Maanaoui, Alessia Giarraputo, Sofia Naser, Gillian Divard, Olivier Aubert, Mohammad Hassan Murad, Changxi Wang, Longshan Liu, Oriol Bestard, Maarten Naesens, John J. Friedewa
Publié dans: Journal of the American Society of Nephrology, Numéro 35, 2024, Page(s) 177-188, ISSN 1046-6673
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1681/asn.0000000000000260

Blood Gene Signature as a Biomarker for Subclinical Kidney Allograft Rejection: Where Are We?

Auteurs: Christophe Masset, Richard Danger, Nicolas Degauque, Jacques Dantal, Magali Giral, Sophie Brouard
Publié dans: Transplantation, 2024, ISSN 0041-1337
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1097/tp.0000000000005105

Editorial: Pharmacoeconomics in the era of health technology assessment and outcomes research to prioritize resource use, innovation and investmentwww.frontiersin.org

Auteurs: François R. Girardin1, Karen Cohen, Matthias Schwenkglenks, Isabelle Durand-Zaleski
Publié dans: Frontiers in Pharmacology, Numéro 2023 May 16, 2023, Page(s) 14:1210002, ISSN 1663-9812
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2023.1210002

Relevance of the Banff Human Organ Transplant Consensus Gene Panel for Detecting Antibody and T-Cell–Mediated Rejection of Kidney Allografts

Auteurs: Alessia Giarraputo, Valentin Goutaudier, Blaise Robin, Annalisa Angelini, Marta Sablik, Olivier Aubert, Ivy A. Rosales, Rex N. Smith, Candice Roufosse, Benjamin Adam, Mark Haas, Robert B. Colvin, Carmen Lefaucheur, Michael Mengel, Dina Zielinski, Alexandre Loupy
Publié dans: Kidney International Reports, Numéro 9, 2024, Page(s) 2290-2294, ISSN 2468-0249
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.ekir.2024.04.054