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Microsatellite Barcoding: reconstructing the family tree of hematopoietic cells

Obiettivo

While murine hematopoiesis has been considered as resolved science, recent results using barcoding, which allows the tracing of single cells in vivo, clearly show that the topology of the murine hematopoietic tree needs revisions. In parallel, human hematopoiesis has been overlooked and is widely considered as following the same tree as in mice. To leverage our understanding of normal human hematopoiesis, tools for barcoding in humans are urgently needed. This research program seeks to meet this need by taking advantage of recent developments in next generation sequencing to provide an improved barcoding method for in vivo use in human. Our microsatellite barcoding method exploits the fact that microsatellites in various loci undergo length changes during cell division, to create a natural barcode for each cell, and reconstruct the overall differentiation tree using a phylogenetic algorithm. Our technique, which is highly detailed with respect to current versions of microsatellite barcoding, provides high dimensional characterization of the cells and will allow the inference of important properties such as new phenotypic markers and key molecular regulators. Therefore, we will provide insights into both cell lineage and the molecular mechanisms involved in differentiation. With this method, we will provide the first in vivo description of the human hematopoietic tree and identify new progenitors and key molecular factors involved in human hematopoiesis. This knowledge will allow us to test whether cells with different origins have different functions, a key question in immunology in particular during infection and inflammation, and it will help design ways of therapeutically manipulating the hematopoietic system. More generally it will impact our understanding of stem cell differentiation for which hematopoiesis is used as an exemplar.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-STG - Starting Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2017-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

INSTITUT CURIE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 154 375,00
Indirizzo
RUE D ULM 26
75231 Paris
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 500 000,00

Beneficiari (2)

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