Microsatellite Barcoding: reconstructing the family tree of hematopoietic cells

Informazioni relative al progetto

MicroBar

ID dell’accordo di sovvenzione: 758170

DOI

10.3030/758170

Progetto chiuso

Data della firma CE 15 Novembre 2017

Data di avvio 1 Agosto 2018

Data di completamento 31 Luglio 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 500 000,00

Contributo UE

€ 1 500 000,00

Coordinato da

INSTITUT CURIE
France

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

Hematopoiesis in numbers

Autori: Jason Cosgrove, Lucie S.P. Hustin, Rob J. de Boer, Leïla Perié
Pubblicato in: Trends in Immunology, Numero 42, 2023, Pagina/e 1100-1112, ISSN 1471-4906
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.it.2021.10.006

CellDestiny: A RShiny application for the visualization and analysis of single-cell lineage tracing data

Autori: Louisa Hadj Abed, Tamar Tak, Jason Cosgrove, Leïla Perié
Pubblicato in: Frontiers in Medicine, Numero 9, 2022, ISSN 2296-858X
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fmed.2022.919345

Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools

Autori: Wenjie Sun, Meghan Perkins, Mathilde Huyghe, Marisa M. Faraldo, Silvia Fre, Leïla Perié, Anne-Marie Lyne
Pubblicato in: Nature Computational Science, Numero 4, 2024, Pagina/e 128-143, ISSN 2662-8457
Editore: springer nature
DOI: 10.1038/s43588-024-00595-7

DRAG in situ barcoding reveals an increased number of HSPCs contributing to myelopoiesis with age

Autori: Jos Urbanus, Jason Cosgrove, Joost B. Beltman, Yuval Elhanati, Rafael A. Moral, Cecile Conrad, Jeroen W. van Heijst, Emilie Tubeuf, Arno Velds, Lianne Kok, Candice Merle, Jens P. Magnusson, Léa Guyonnet, Jonas Frisén, Silvia Fre, Aleksandra M. Walczak, Thierry Mora, Heinz Jacobs, Ton N. Schumacher, Leïla Perié
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37167-8

Simultaneous Assessment of Kinship, Division Number, and Phenotype <em>via</em> Flow Cytometry for Hematopoietic Stem and Progenitor Cells

Autori: Alessandro Donada, Tamar Tak, Giulio Prevedello, Idan Milo, Ken R. Duffy, Leïla Perié
Pubblicato in: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Editore: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/64918

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autori: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié, Céline Vallot
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 54, 2022, Pagina/e 459-468, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

To portray clonal evolution in blood cancer, count your stem cells

Autori: Anne-Marie Lyne, Lucie Laplane, Leïla Perié
Pubblicato in: Blood, Numero Online ahead of print, 2020, ISSN 0006-4971
Editore: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2020008407

Comparing phylogenetic approaches to reconstructing cell lineage from microsatellites with missing data

Autori: Anne-Marie Lyne, Leila Perie
Pubblicato in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2020, Pagina/e 1-1, ISSN 1545-5963
Editore: IEEE Computer Society
DOI: 10.1109/tcbb.2020.2992813

Other (1)

Metabolically Primed Multipotent Hematopoietic Progenitors Fuel Innate Immunity

Autori: Jason Cosgrove, Anne-Marie Lyne, Ildefonso Rodriguez, Vincent Cabeli, Cecile Conrad, Sabrina Tenreira-Bento, Emilie Tubeuf, Erica Russo, Fanny Tabarin, Yannis Belloucif, Shayda Maleki-Toyserkani, Sophie Reed, Federica Monaco, Ann Ager, Camille Lobry, Philippe Bousso, Pablo Jose Fernández-Marcos, Herve Isambert, Rafael J. Argüello, Leïla Perié
Pubblicato in: 2023
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.01.24.525166