Microsatellite Barcoding: reconstructing the family tree of hematopoietic cells

Projektinformationen

MicroBar

ID Finanzhilfevereinbarung: 758170

DOI

10.3030/758170

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 November 2017

Startdatum 1 August 2018

Enddatum 31 Juli 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

INSTITUT CURIE
France

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Hematopoiesis in numbers

Autoren: Jason Cosgrove, Lucie S.P. Hustin, Rob J. de Boer, Leïla Perié
Veröffentlicht in: Trends in Immunology, Ausgabe 42, 2023, Seite(n) 1100-1112, ISSN 1471-4906
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.it.2021.10.006

CellDestiny: A RShiny application for the visualization and analysis of single-cell lineage tracing data

Autoren: Louisa Hadj Abed, Tamar Tak, Jason Cosgrove, Leïla Perié
Veröffentlicht in: Frontiers in Medicine, Ausgabe 9, 2022, ISSN 2296-858X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fmed.2022.919345

Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools

Autoren: Wenjie Sun, Meghan Perkins, Mathilde Huyghe, Marisa M. Faraldo, Silvia Fre, Leïla Perié, Anne-Marie Lyne
Veröffentlicht in: Nature Computational Science, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 128-143, ISSN 2662-8457
Herausgeber: springer nature
DOI: 10.1038/s43588-024-00595-7

DRAG in situ barcoding reveals an increased number of HSPCs contributing to myelopoiesis with age

Autoren: Jos Urbanus, Jason Cosgrove, Joost B. Beltman, Yuval Elhanati, Rafael A. Moral, Cecile Conrad, Jeroen W. van Heijst, Emilie Tubeuf, Arno Velds, Lianne Kok, Candice Merle, Jens P. Magnusson, Léa Guyonnet, Jonas Frisén, Silvia Fre, Aleksandra M. Walczak, Thierry Mora, Heinz Jacobs, Ton N. Schumacher, Leïla Perié
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37167-8

Simultaneous Assessment of Kinship, Division Number, and Phenotype <em>via</em> Flow Cytometry for Hematopoietic Stem and Progenitor Cells

Autoren: Alessandro Donada, Tamar Tak, Giulio Prevedello, Idan Milo, Ken R. Duffy, Leïla Perié
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/64918

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autoren: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 54, 2022, Seite(n) 459-468, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

To portray clonal evolution in blood cancer, count your stem cells

Autoren: Anne-Marie Lyne, Lucie Laplane, Leïla Perié
Veröffentlicht in: Blood, Ausgabe Online ahead of print, 2020, ISSN 0006-4971
Herausgeber: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2020008407

Comparing phylogenetic approaches to reconstructing cell lineage from microsatellites with missing data

Autoren: Anne-Marie Lyne, Leila Perie
Veröffentlicht in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2020, Seite(n) 1-1, ISSN 1545-5963
Herausgeber: IEEE Computer Society
DOI: 10.1109/tcbb.2020.2992813

Other (1)

Metabolically Primed Multipotent Hematopoietic Progenitors Fuel Innate Immunity

Autoren: Jason Cosgrove, Anne-Marie Lyne, Ildefonso Rodriguez, Vincent Cabeli, Cecile Conrad, Sabrina Tenreira-Bento, Emilie Tubeuf, Erica Russo, Fanny Tabarin, Yannis Belloucif, Shayda Maleki-Toyserkani, Sophie Reed, Federica Monaco, Ann Ager, Camille Lobry, Philippe Bousso, Pablo Jose Fernández-Marcos, Herve Isambert, Rafael J. Argüello, Leïla Perié
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.01.24.525166