Objectif
Technologies to sequence single-cell transcriptomes (scRNA-seq) are revolutionizing our ability to analyze cell composition and differentiation in complex tissues. In parallel, recent innovations allow the generation of three-dimensional tissues from stem cells that recapitulate human development. In this proposal, we will focus on human cortex development modelled by cerebral organoids. Our vision is to create an integrative single-cell transcriptomic platform to reconstruct cerebral organoid development, and dissect network alterations that lead to human brain malformations. Our project will be advanced through the following objectives:
1. Single-cell transcriptome-coupled lineage tracing: We will use cellular barcoding to label individual cortical progenitor cells, trace their output and lineage trees with high-throughput scRNA-seq, and quantify lineage transition probabilities between cell types.
2. Gene knockout screens in mosaic organoids: We will use CRISPR/Cas9 to perform genetic screens of up to 100 genotypes in mosaic organoids to understand mechanisms that regulate cell lineage decisions during cortex development.
3. High-throughput reconstructions of cortex malformations: We will generate cerebral organoids from patients with cortical malformations and reconstruct networks and infer differentiation hierarchies using high-throughput and lineage-coupled scRNA-seq. We will spatially resolve network aberrations using sequential fluorescence in situ hybridization (seqFISH).
ORGANOMICS provides an entirely new quantitative direction to study human corticogenesis. We will build high-resolution models of cortex development by measuring the expression and function of genes in thousands of single cells. Our interdisciplinary project will lead to groundbreaking insight into mechanisms underlying neurodevelopmental diseases. Our general strategy can be extended to various other organ systems where protocols to generate in vitro counterparts can be established.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé médecine personnalisée
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8092 Zuerich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.