Shape-directed protein assembly design

Projektinformationen

3DPROTEINPUZZLES

ID Finanzhilfevereinbarung: 771820

DOI

10.3030/771820

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 23 Februar 2018

Startdatum 1 Juni 2018

Enddatum 31 Mai 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 325 292,00

EU-Beitrag

€ 2 325 292,00

Koordiniert durch

LUNDS UNIVERSITET
Sweden

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (6)

A memetic algorithm enables efficient local and global all-atom protein-protein docking with backbone and side-chain flexibility

Autoren: Daniel Varela, Vera Karlin and Ingemar André
Veröffentlicht in: Structure, 2022, ISSN 0969-2126
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2022.09.005

The intracellular helical bundle of human glucose transporter <scp>GLUT4</scp> is important for complex formation with <scp>ASPL</scp>

Autoren: Peng Huang; Hannah Åbacka; Daniel Varela; Raminta Venskutonytė; Lotta Happonen; Jonathan S. Bogan; Pontus Gourdon; Mahmood R. Amiry‐Moghaddam; Ingmar André; Karin Lindkvist‐Petersson
Veröffentlicht in: FEBS Bio Open, 2023, ISSN 2211-5463
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1002/2211-5463.13709

Accurate prediction of protein assembly structure by combining AlphaFold and symmetrical docking

Autoren: Mads Jeppesen; Ingemar André
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43681-6

DnaK response to expression of protein mutants is dependent on translation rate and stability

Autoren: Signe Christensen, Sebastian Rämisch and Ingemar André
Veröffentlicht in: Communications Biology, 2022, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Nature Publishing Group UK
DOI: 10.1038/s42003-022-03542-2

ZEAL: protein structure alignment based on shape similarity

Autoren: Filip Ljung, Ingemar André
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2021, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btab205

Facile Method for High-throughput Identification of Stabilizing Mutations

Autoren: Signe Christensen; Camille Wernersson; Ingemar André
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168209