A memetic algorithm enables efficient local and global all-atom protein-protein docking with backbone and side-chain flexibility
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Daniel Varela, Vera Karlin and Ingemar André
Opublikowane w:
Structure, 2022, ISSN 0969-2126
Wydawca:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.str.2022.09.005
The intracellular helical bundle of human glucose transporter <scp>GLUT4</scp> is important for complex formation with <scp>ASPL</scp>
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Peng Huang; Hannah Åbacka; Daniel Varela; Raminta Venskutonytė; Lotta Happonen; Jonathan S. Bogan; Pontus Gourdon; Mahmood R. Amiry‐Moghaddam; Ingmar André; Karin Lindkvist‐Petersson
Opublikowane w:
FEBS Bio Open, 2023, ISSN 2211-5463
Wydawca:
Elsevier BV
DOI:
10.1002/2211-5463.13709
Accurate prediction of protein assembly structure by combining AlphaFold and symmetrical docking
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Mads Jeppesen; Ingemar André
Opublikowane w:
Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-43681-6
DnaK response to expression of protein mutants is dependent on translation rate and stability
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Signe Christensen, Sebastian Rämisch and Ingemar André
Opublikowane w:
Communications Biology, 2022, ISSN 2399-3642
Wydawca:
Nature Publishing Group UK
DOI:
10.1038/s42003-022-03542-2
ZEAL: protein structure alignment based on shape similarity
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Filip Ljung, Ingemar André
Opublikowane w:
Bioinformatics, 2021, ISSN 1367-4803
Wydawca:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btab205
Facile Method for High-throughput Identification of Stabilizing Mutations
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Signe Christensen; Camille Wernersson; Ingemar André
Opublikowane w:
Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Wydawca:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jmb.2023.168209
