Single Molecule Analytical Raman Tools based on DNA nanostructures

Projektinformationen

SMART-DNA

ID Finanzhilfevereinbarung: 772752

DOI 10.3030/772752

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 Januar 2018

Startdatum 1 April 2018

Enddatum 31 März 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 996 476,00

EU-Beitrag € 1 996 476,00

Koordiniert durch

UNIVERSITAET POTSDAM
Germany

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (25)

Lab-on-a-DNA origami: nanoengineered single-molecule platforms

Autoren: Sergio Kogikoski; João Ameixa; Amr Mostafa; Ilko Bald
Veröffentlicht in: Chemical Communications, Ausgabe 59, 2023, Seite(n) 4726, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3cc00718a

Spatial Separation of Plasmonic Hot-Electron Generation and a Hydrodehalogenation Reaction Center Using a DNA Wire

Autoren: Sergio Kogikoski Jr., Anushree Dutta, Ilko Bald
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe 15, 2021, Seite(n) 20562, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c09176

A Versatile DNA Origami-Based Plasmonic Nanoantenna for Label-Free Single-Molecule Surface-Enhanced Raman Spectroscopy

Autoren: Kosti Tapio, Amr Mostafa, Yuya Kanehira, Antonio Suma, Anushree Dutta, Ilko Bald
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe 15/4, 2021, Seite(n) 7065-7077, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c00188

Plasmonic reactivity of halogen thiophenols on gold nanoparticles studied by SERS and XPS

Autoren: Robin Schürmann, Anushree Dutta, Kenny Ebel, Kosti Tapio, Aleksandar R. Milosavljević, Ilko Bald
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Physics, Ausgabe 157, 2022, Seite(n) 084708, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0098110

The electronic structure of the metal–organic interface of isolated ligand coated gold nanoparticles

Autoren: Robin Schürmann; Evgenii Titov; Kenny Ebel; Sergio Kogikoski; Amr Mostafa; Peter Saalfrank; Aleksandar R. Milosavljević; Ilko Bald
Veröffentlicht in: Nanoscale Advances, Ausgabe 4, 2022, Seite(n) 1599, ISSN 2516-0230
Herausgeber: RSC
DOI: 10.1039/d1na00737h

Influence of Different Salts on the G-Quadruplex Structure Formed from the Reversed Human Telomeric DNA Sequence

Autoren: Lydia Olejko, Anushree Dutta, Kosar Shahsavar, Ilko Bald
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 23, 2022, Seite(n) 12206, ISSN 1000-9035
Herausgeber: mdpi
DOI: 10.3390/ijms232012206

The potential of DNA origami to build multifunctional materials

Autoren: Kosti Tapio, Ilko Bald
Veröffentlicht in: Multifunctional Materials, Ausgabe 3/3, 2020, Seite(n) 032001, ISSN 2399-7532
Herausgeber: IOP Publishing
DOI: 10.1088/2399-7532/ab80d5

Quantum Yield of DNA Strand Breaks under Photoexcitation of a Molecular Ruby

Autoren: Cui Wang; Kenny Ebel; Katja Heinze; Ute Resch‐Genger; Ilko Bald
Veröffentlicht in: Chemistry - A European Journal, Ausgabe 29, 2023, Seite(n) e202203719, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202203719

The Role of Structural Flexibility in Plasmon-Driven Coupling Reactions: Kinetic Limitations in the Dimerization of Nitro-Benzenes

Autoren: Wouter Koopman; Evgenii Titov; Radwan M. Sarhan; Radwan M. Sarhan; Tina Gaebel; Robin Schürmann; Amr Mostafa; Sergio Kogikoski; Alexandar R. Milosavljevic; Felix Stete; Ferenc Liebig; Clemens N. Z. Schmitt; Joachim Koetz; Ilko Bald; Peter Saalfrank; Matias Bargheer; Matias Bargheer
Veröffentlicht in: Advanced Materials Interfaces, Ausgabe 8, 2021, Seite(n) 2101344, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/admi.202101344

Plasmon mediated decomposition of brominated nucleobases on silver nanoparticles – A surface enhanced Raman scattering (SERS) study

Autoren: Anushree Dutta, Robin Schürmann, Ilko Bald
Veröffentlicht in: The European Physical Journal D, Ausgabe 74/1, 2020, ISSN 1434-6060
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1140/epjd/e2019-100115-1

Length and Energy Dependence of Low-Energy Electron-Induced Strand Breaks in Poly(A) DNA

Autoren: Kenny Ebel, Ilko Bald
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 21/1, 2020, Seite(n) 111, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21010111

Colloidal black gold with broadband absorption for plasmon-assisted crosslinking of thiolated diazonium compound

Autoren: Radwan M. Sarhan; Sergio Kogikoski Jr; Robin M. Schürmann; Yuhang Zhao; Andreas Krause; Bernd Schmidt; Ilko Bald; Yan Lu
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry C, Ausgabe 127, 2023, Seite(n) 10051-10061, ISSN 1932-7447
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcc.3c00067

Kinetics and Mechanism of Plasmon-Driven Dehalogenation Reaction of Brominated Purine Nucleobases on Ag and Au.

Autoren: Anushree Dutta; Robin Schürmann; Sergio Kogikoski; Niclas S. Mueller; Stephanie Reich; Ilko Bald
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, Ausgabe 11, 2021, Seite(n) 8370, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.1c01851

Poly-N-isopropylacrylamide colloidal arrays as templates for droplet-assisted fabrication of plasmonic nanostructure patterns

Autoren: Ruth Fabiola Balderas‐Valadez; Alessandro Nagel; Yuya Kanehira; Ilko Bald; Claudia Pacholski
Veröffentlicht in: Advanced Materials Technologies, Ausgabe 24, 2023, Seite(n) 2201717, ISSN 2365-709X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-5382g

Interaction of 4-nitrothiophenol with low energy electrons: Implications for plasmon mediated reactions

Autoren: Robin Schürmann, Thomas F. M. Luxford, Ivo S. Vinklárek, Jaroslav Kočišek, Mateusz Zawadzki, Ilko Bald
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 153/10, 2020, Seite(n) 104303, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0018784

Raman Enhancement of Nanoparticle Dimers Self-Assembled Using DNA Origami Nanotriangles

Autoren: Sergio Kogikoski, Kosti Tapio, Robert Edler von Zander, Peter Saalfrank, Ilko Bald
Veröffentlicht in: Molecules, Ausgabe 26/6, 2021, Seite(n) 1684, ISSN 1420-3049
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules26061684

Amorphous Carbon Generation as a Photocatalytic Reaction on DNA-Assembled Gold and Silver Nanostructures

Autoren: Christian Heck, Yuya Kanehira, Janina Kneipp, Ilko Bald
Veröffentlicht in: Molecules, Ausgabe 24/12, 2019, Seite(n) 2324, ISSN 1420-3049
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules24122324

A new reporter design based on DNA origami nanostructures for quantification of short oligonucleotides using microbeads

Autoren: Youngeun Choi, Carsten Schmidt, Philip Tinnefeld, Ilko Bald, Stefan Rödiger
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-41136-x

Role of Valence Band States and Plasmonic Enhancement in Electron-Transfer-Induced Transformation of Nitrothiophenol

Autoren: Robin Schürmann, Kenny Ebel, Christophe Nicolas, Aleksandar R. Milosavljević, Ilko Bald
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Ausgabe 10/11, 2019, Seite(n) 3153-3158, ISSN 1948-7185
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b00848

Analytical epigenetics: single-molecule optical detection of DNA and histone modifications

Autoren: Christian Heck, Yael Michaeli, Ilko Bald, Yuval Ebenstein
Veröffentlicht in: Current Opinion in Biotechnology, Ausgabe 55, 2019, Seite(n) 151-158, ISSN 0958-1669
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2018.09.006

Folding DNA into origami nanostructures enhances resistance to ionizing radiation.

Autoren: Leo Sala; Agnes Zerolová; Alvaro Rodriguez; Dan Reimitz; Marie Davídková; Kenny Ebel; Ilko Bald; Jaroslav Kočišek
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 13, 2021, Seite(n) 11197, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1nr02013g

Experimental and Theoretical Studies of Dissociative Electron Attachment to Metabolites Oxaloacetic and Citric Acids

Autoren: J. Kopyra, P. Wierzbicka, A. Tulwin, G. Thiam, I. Bald, F. Rabilloud and H. Abdoul-Carime
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 22, 2021, Seite(n) 7676, ISSN 1000-9035
Herausgeber: mdpi
DOI: 10.3390/ijms22147676

Microscopic Understanding of Reaction Rates Observed in Plasmon Chemistry of Nanoparticle–Ligand Systems

Autoren: Robin Schürmann; Alessandro Nagel; Sabrina Juergensen; Anisha Pathak; Stephanie Reich; Claudia Pacholski; Ilko Bald
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry C, Ausgabe 126, 2022, Seite(n) 5333, ISSN 1932-7447
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcc.2c00278

Low-Energy (5–20 eV) Electron-Induced Single and Double Strand Breaks in Well-Defined DNA Sequences

Autoren: Kenny Ebel; Ilko Bald
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Ausgabe 13, 2022, Seite(n) 4871, ISSN 1948-7185
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.2c00684

Molecular states and spin crossover of hemin studied by DNA origami enabled single-molecule surface-enhanced Raman scattering

Autoren: Anushree Dutta; Kosti Tapio; Antonio Suma; Amr Mostafa; Yuya Kanehira; Vincenzo Carnevale; Giovanni Bussi; Ilko Bald
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 14, 2022, Seite(n) 16467, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr03664a