High speed AFM imaging of molecular processes inside living cells

Projektinformationen

InCell

ID Finanzhilfevereinbarung: 773091

DOI

10.3030/773091

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 6 März 2018

Startdatum 1 April 2018

Enddatum 30 September 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 999 925,00

EU-Beitrag

€ 1 999 925,00

Koordiniert durch

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (21)

Correlative 3D microscopy of single cells using super-resolution and scanning ion-conductance microscopy

Autoren: Vytautas Navikas; Samuel M. Leitao; Kristin S. Grussmayer; Kristin S. Grussmayer; Adrien Descloux; Barney Drake; Klaus Yserentant; Philipp Werther; Dirk-Peter Herten; Richard Wombacher; Richard Wombacher; Aleksandra Radenovic; Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24901-3

Integration of sharp silicon nitride tips into high-speed SU8 cantilevers in a batch fabrication process

Autoren: Nahid Hosseini, Matthias Neuenschwander, Oliver Peric, Santiago H Andany, Jonathan D Adams, Georg E Fantner
Veröffentlicht in: Beilstein Journal of Nanotechnology, Ausgabe 10, 2019, Seite(n) 2357-2363, ISSN 2190-4286
Herausgeber: Beilstein-Institut Zur Forderung der Chemischen Wissenschaften
DOI: 10.3762/bjnano.10.226

Spatially multiplexed single-molecule translocations through a nanopore at controlled speeds

Autoren: S. M. Leitao, B. Drake & G. E. Fantner, V. Navikas, H. Miljkovic, S. Marion, S. F. Mayer & A. Radenovic,G. Pistoletti Blanchet & A. Kuhn,K. Chen & U. F. Keyser
Veröffentlicht in: Nature Nanotechnology, Ausgabe 18, 1078–1084, 2023, ISSN 1748-3387
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-023-01412-4

Tuning SAS-6 architecture with monobodies impairs distinct steps of centriole assembly

Autoren: Hatzopoulos, Georgios N. ; Kuekenshoener, Tim ; Banterle, Niccolo ; Favez, Tatiana ; Flueckiger, Isabelle ; Hamel, Virginie ; Andany, Santiago ; Fantner, Georg E. ; Hantschel, Oliver ; Goenczy, Pierre
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, Seite(n) 3805, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23897-0

Label-Free Long-Term Methods for Live Cell Imaging of Neurons: New Opportunities

Autoren: Zrinko Baričević, Zahra Ayar, Samuel M. Leitao, Miranda Mladinic, Georg E. Fantner Jelena Ban
Veröffentlicht in: Advanced Optical Sensing Techniques for Applications in Biomedicine, Ausgabe 13/3, 2023, Seite(n) 404, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios13030404

Scratching the Surface: Bacterial Cell Envelopes at the Nanoscale

Autoren: Albertus Viljoen, Simon J. Foster, Georg E. Fantner, Jamie K. Hobbs, Yves F. Dufrêne
Veröffentlicht in: mBio, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2150-7511
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.03020-19

Kinetic and structural roles for the surface in guiding SAS-6 self-assembly to direct centriole architecture

Autoren: Banterle, Niccolo; Nievergelt, Adrian P.; de Buhr, Svenja; Hatzopoulos, Georgios N.; Brillard, Charlene; Andany, Santiago; Huebscher, Tania; Sorgenfrei, Frieda A.; Schwarz, Ulrich S.; Graeter, Frauke; Fantner, Georg E.; Goenczy, Pierre
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12, 2021, Seite(n) 6180, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26329-1

Seeing and Touching the Mycomembrane at the Nanoscale

Autoren: Albertus Viljoen, Esther Räth, John D. Mckinney, Georg E. Fantner, Yves F. Dufrêne
Veröffentlicht in: Journal of Bacteriology, Ausgabe 203/10, 2021, ISSN 0021-9193
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jb.00547-20

Mechanical Properties of Soft Biological Membranes for Organ-on-a-Chip Assessed by Bulge Test and AFM

Autoren: Pauline Zamprogno, Giuditta Thoma, Veronika Cencen, Dario Ferrari, Barbara Putz, Johann Michler, Georg E. Fantner, Olivier T. Guenat
Veröffentlicht in: ACS Biomaterials Science & Engineering, 2021, ISSN 2373-9878
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsbiomaterials.0c00515

Overlapping and essential roles for molecular and mechanical mechanisms in mycobacterial cell division

Autoren: Pascal D. Odermatt, Mélanie T. M. Hannebelle, Haig A. Eskandarian, Adrian P. Nievergelt, John D. McKinney, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Nature Physics, Ausgabe 16/1, 2020, Seite(n) 57-62, ISSN 1745-2473
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41567-019-0679-1

Reducing uncertainties in energy dissipation measurements in atomic force spectroscopy of molecular networks and cell-adhesion studies

Autoren: Soma Biswas, Samuel Leitao, Quentin Theillaud, Blake W. Erickson, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-26979-0

High-speed photothermal off-resonance atomic force microscopy reveals assembly routes of centriolar scaffold protein SAS-6

Autoren: Adrian P. Nievergelt, Niccolò Banterle, Santiago H. Andany, Pierre Gönczy, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Nature Nanotechnology, Ausgabe 13/8, 2018, Seite(n) 696-701, ISSN 1748-3387
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-018-0149-4

Detecting topological variations of DNA at single-molecule level

Autoren: Ke Liu, Chao Pan, Alexandre Kuhn, Adrian Pascal Nievergelt, Georg E. Fantner, Olgica Milenkovic, Aleksandra Radenovic
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-07924-1

Large‐Range HS‐AFM Imaging of DNA Self‐Assembly through In Situ Data‐Driven Control

Autoren: Adrian P. Nievergelt, Christoph Kammer, Charlène Brillard, Eva Kurisinkal, Maartje M. C. Bastings, Alireza Karimi, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Small Methods, 2019, Seite(n) 1900031, ISSN 2366-9608
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/smtd.201900031

Single-molecule kinetics of pore assembly by the membrane attack complex

Autoren: Edward S. Parsons, George J. Stanley, Alice L. B. Pyne, Adrian W. Hodel, Adrian P. Nievergelt, Anaïs Menny, Alexander R. Yon, Ashlea Rowley, Ralf P. Richter, Georg E. Fantner, Doryen Bubeck, Bart W. Hoogenboom
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-10058-7

High-Throughput Nanocapillary Filling Enabled by Microwave Radiation for Scanning Ion Conductance Microscopy Imaging

Autoren: Vytautas Navikas, Samuel M. Leitão, Sanjin Marion, Sebastian James Davis, Barney Drake, Georg E. Fantner, Aleksandra Radenovic
Veröffentlicht in: ACS Applied Nano Materials, Ausgabe 3/8, 2020, Seite(n) 7829-7834, ISSN 2574-0970
Herausgeber: American chemical society
DOI: 10.1021/acsanm.0c01345

Time-Resolved Scanning Ion Conductance Microscopy for Three-Dimensional Tracking of Nanoscale Cell Surface Dynamics

Autoren: Leitao, Samuel M.; Drake, Barney; Pinjusic, Katarina; Pierrat, Xavier; Navikas, Vytautas; Nievergelt, Adrian P.; Brillard, Charlene; Djekic, Denis; Radenovic, Aleksandra; Persat, Alexandre; Constam, Daniel B.; Anders, Jens; Fantner, Georg E.
Veröffentlicht in: Acs Nano, Ausgabe 15, 2022, Seite(n) 17613-17622, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c05202

A biphasic growth model for cell pole elongation in mycobacteria

Autoren: Mélanie T. M. Hannebelle, Joëlle X. Y. Ven, Chiara Toniolo, Haig A. Eskandarian, Gaëlle Vuaridel-Thurre, John D. McKinney, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-14088-z

A high-bandwidth voltage amplifier for driving piezoelectric actuators

Autoren: Santiago H. Andany, Adrian P. Nievergelt, Mustafa Kangül, Dominik Ziegler, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: Rev. Sci. Instrum., Ausgabe 94, 093703, 2023, ISSN 0034-6748
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0159728

Volcano-Shaped Scanning Probe Microscopy Probe for Combined Force-Electrogram Recordings from Excitable Cells

Autoren: B. X. E. Desbiolles, M. T. M Hannebelle, E. de Coulon, A. Bertsch, S. Rohr, G. E. Fantner, P. Renaud
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe 20/6, 2020, Seite(n) 4520-4529, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c01319

Increased drug permeability of a stiffened mycobacterial outer membrane in cells lacking MFS transporter Rv1410 and lipoprotein LprG

Autoren: Michael Hohl, Sille Remm, Haig A. Eskandarian, Michael Dal Molin, Fabian M. Arnold, Lea M. Hürlimann, Andri Krügel, Georg E. Fantner, Peter Sander, Markus A. Seeger
Veröffentlicht in: Molecular Microbiology, Ausgabe 111/5, 2019, Seite(n) 1263-1282, ISSN 0950-382X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14220

Conference proceedings (3)

Data-Driven Feedforward Hysteresis Compensation with Genetic Algorithm for Atomic Force Microscope

Autoren: Asmari, Navid ; Kangul, Mustafa ; Andany, Santiago H. ; Karimi, Alireza ; Fantner, Georg E.
Veröffentlicht in: 2022, ISBN 978-1-6654-5974-7
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/marss55884.2022.9870479

Batch Fabrication of Multilayer Polymer Cantilevers with Integrated Hard Tips for High-Speed Atomic Force Microscopy

Autoren: Nahid Hosseini, Oliver Peric, Matthias Neuenschwander, Santiago H. Andany, Jonathan D. Adams, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: 2019 20th International Conference on Solid-State Sensors, Actuators and Microsystems & Eurosensors XXXIII (TRANSDUCERS & EUROSENSORS XXXIII), 2019, Seite(n) 2033-2036, ISBN 978-1-5386-8104-6
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/transducers.2019.8808606

Self-Actuated Polymer-Based Cantilevers With Sharp Silicon Tips For High-Speed Atomic Force Microscopy

Autoren: Neuenschwander, Matthias ; Andany, Santiago H. ; Kanguel, Mustafa ; Hosseini, Nahid ; Fantner, Georg E.
Veröffentlicht in: IEEE Xplore, 2021, ISBN 978-1-6654-4845-1
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/transducers50396.2021.9495715

Other (5)

A hybrid polymer/ceramic/semiconductor fabrication platform for high-sensitivity fluid-compatible MEMS devices with sealed integrated electronics

Autoren: Nahid Hosseini, Matthias Neuenschwander, Jonathan D. Adams, Santiago H. Andany, Oliver Peric, Marcel Winhold, Maria Carmen Giordano, Vinayak Shantaram Bhat, Dirk Grundler, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2307.05221

Enhanced feedback performance in off-resonance AFM modes through pulse train sampling

Autoren: Mustafa Kangül, Navid Asmari, Santiago H. Andany, Marcos Penedo, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2306.16013

OpenSIM: open source microscope add-on for structured illumination microscopy

Autoren: Mélanie T.M Hannebelle,Esther Raeth, Samuel M. Leitao, Tomáš Lukeš, Jakub Pospíšil, Chiara Toniolo, Olivier F. Venzin,Antonius Chrisnandy, Prabhu Prasad Swain, Nathan Ronceray, Matthias P. Lütolf, Andrew C. Oates, Guy M. Hagen, Theo Lasser, Aleksandra Radenovic, John D. McKinney, Georg E. Fantner
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.06.16.545316

Structural flexibility dominates over binding strength for supramolecular crystallinity

Autoren: Vincenzo Caroprese, Cem Tekin, Veronika Cencen, Majid Mosayebi, Tanniemola B. Liverpool, Derek N. Woolfson, Georg Fantner, Maartje M.C. Bastings
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.09.04.556250

Combining thermal scanning probe lithography and dry etching for grayscale nanopattern amplification

Autoren: Berke Erbas,Ana Conde-Rubio ,Xia Liu ,Joffrey Pernollet ,Zenyu Wang ,Arnaud Bertsch ,Marcos Penedo ,Georg Fantner ,Mitali Banerjee ,Andras Kis ,Giovanni Boero ,Juergen Brugger
Veröffentlicht in: 12 July 2023, Version 1, 2023, ISSN 2573-2293
Herausgeber: ChemRxiv
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-x0r76

Non-peer reviewed articles (2)

Air and Water-Stable n-Type Doping and Encapsulation of Flexible MoS2 Devices with SU8

Autoren: Kung, Yen-Cheng, Hosseini, Nahid, Dumcenco, Dumitru, Fantner, Georg E.,Kis, Andras
Veröffentlicht in: Advanced Electronic Materials Vol 5, Ausgabe 1, Ausgabe 1800492, 2018, ISSN 2199-160X
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/aelm.201800492

Photothermal Off-Resonance Tapping for Rapid and Gentle Atomic Force Imaging of Live Cells

Autoren: Adrian Nievergelt, Charlène Brillard, Haig Eskandarian, John McKinney, Georg Fantner
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 19/10, 2018, Seite(n) 2984, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms19102984