Obiettivo
Protein domains start to fold co-translationally while they are being synthesized on the ribosome. Co-translational folding starts in the confined space of the ribosomal polypeptide exit tunnel and is modulated by the speed of translation. Although defects in protein folding cause many human diseases, the mechanisms of co-translational folding and the link between the speed of translation and the quality of protein folding is poorly understood. Here I propose to study when, where and how proteins emerging from the ribosome start to fold, how the ribosome and auxiliary proteins bound at the polypeptide exit affect nascent peptide folding, what causes ribosome pausing during translation, and how pausing affects nascent peptide folding. Our recent results (Holtkamp et al., Science 2015; Buhr et al., Mol Cell 2016) provide the proof of principle for monitoring translation and protein folding simultaneously at high temporal resolution. First, we will follow translation processivity and folding trajectories for proteins of different domain structure types using time-resolved ensemble kinetics and single-molecule setups. The structures of complexes with stalled folding intermediates will be solved by cryo-electron microscopy. Second, we will investigate the effects of the chaperone trigger factor, the signal recognition particle, and other protein biogenesis factors on the folding landscape. Third, we will analyze transient ribosome pauses in vivo (based on ribosome profiling data) and in vitro (based on time-resolved translation assays and mathematical modeling) and identify the events that cause pausing. Finally, we will probe how changes in translational processivity affect the conformational landscape of a protein. We expect that these results will open new horizons in understanding co-translational protein folding and will help to understand the molecular basis of many diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2017-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
80539 MUNCHEN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.