How does the ubiquitin-like protein NEDD8 activate ubiquitin ligase machineries?

Información del proyecto

Nedd8Activate

Identificador del acuerdo de subvención: 789016

DOI

10.3030/789016

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 17 Abril 2018

Fecha de inicio 1 Octubre 2018

Fecha de finalización 30 Septiembre 2023

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 193 871,00

Aportación de la UE

€ 2 193 871,00

Coordinado por

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Publicaciones

Peer reviewed articles (18)

Linkage-specific ubiquitin chain formation depends on a lysine hydrocarbon ruler

Autores: Joanna Liwocha, David T. Krist, Gerbrand J. van der Heden van Noort, Fynn M. Hansen, Vinh H. Truong, Ozge Karayel, Nicholas Purser, Daniel Houston, Nicole Burton, Mark J. Bostock, Michael Sattler, Matthias Mann, Joseph S. Harrison, Gary Kleiger, Huib Ovaa, Brenda A. Schulman
Publicado en: Nature Chemical Biology, Edición 17/3, 2021, Página(s) 272-279, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-00696-0

K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution.

Autores: Aldwin Suryo Rahmanto, Christian J Blum, Claudia Scalera , Jan B Heidelberger, Mikhail Mesitov , Daniel Horn-Ghetko, Justus F Gräf, Ivan Mikicic, Rebecca Hobrecht, Anna Orekhova, Matthias Ostermaier, Stefanie Ebersberger, Martin M Möckel, Nils Krapoth, Nádia Da Silva Fernandes, Athanasia Mizi, Yajie Zhu, Jia-Xuan Chen, Chunaram Choudhary, Argyris Papantonis, Helle D Ulrich, Brenda A Schulman,
Publicado en: Molecular Cell, Edición 83/23, 2023, Página(s) 4272-4289.e10, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.10.011

CUL5-ARIH2 E3-E3 ubiquitin ligase structure reveals cullin-specific NEDD8 activation

Autores: Sebastian Kostrhon, J. Rajan Prabu, Kheewoong Baek, Daniel Horn-Ghetko, Susanne von Gronau, Maren Klügel, Jérôme Basquin, Arno F. Alpi, Brenda A. Schulman
Publicado en: Nature Chemical Biology, Edición 17/10, 2021, Página(s) 1075-1083, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00858-8

Structure of CRL7FBXW8 reveals coupling with CUL1-RBX1/ROC1 for multi-cullin-RING E3-catalyzed ubiquitin ligation.

Autores: Hopf LVM, Baek K, Klügel M, Gronau Sv, Xiong Y, Schulman BA
Publicado en: Nature Structural and Molecular Biology, Edición 29, 2022, Página(s) 854-864, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-022-00815-6

Decoding the messaging of the ubiquitin system using chemical and protein probes

Autores: Lukas T. Henneberg, Brenda A. Schulman
Publicado en: Cell Chemical Biology, Edición 28/7, 2021, Página(s) 889-902, ISSN 2451-9456
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chembiol.2021.03.009

Activity-based profiling of cullin-RING ligase networks by conformation-specific probes.

Autores: Henneberg LT, Singh J, Duda DM, Baek K, Yanishevski D, Murray PJ, Mann M, Sidhu SS, Schulman BA.
Publicado en: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01392-5

NEDD8 and ubiquitin ligation by cullin-RING E3 ligases

Autores: Kheewoong Baek, Daniel C Scott, Brenda A Schulman
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 67, 2021, Página(s) 101-109, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.10.007

Papain-like protease regulates SARS-CoV-2 viral spread and innate immunity

Autores: Donghyuk Shin, Rukmini Mukherjee, Diana Grewe, Denisa Bojkova, Kheewoong Baek, Anshu Bhattacharya, Laura Schulz, Marek Widera, Ahmad Reza Mehdipour, Georg Tascher, Paul P. Geurink, Alexander Wilhelm, Gerbrand J. van der Heden van Noort, Huib Ovaa, Stefan Müller, Klaus-Peter Knobeloch, Krishnaraj Rajalingam, Brenda A. Schulman, Jindrich Cinatl, Gerhard Hummer, Sandra Ciesek, Ivan Dikic
Publicado en: Nature, Edición 587/7835, 2020, Página(s) 657-662, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2601-5

E3 ligase autoinhibition by C-degron mimicry maintains C-degron substrate fidelity.

Autores: Daniel C Scott, Moeko T King, Kheewoong Baek, Clifford T Gee, Ravi Kalathur, Jerry Li, Nicholas Purser, Amanda Nourse, Sergio C Chai, Sivaraja Vaithiyalingam, Taosheng Chen, Richard E Lee, Stephen J Elledge, Gary Kleiger, Brenda A Schulman.
Publicado en: Molecular Cell, Edición 83/5, 2023, Página(s) 770-786.e.9, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.01.019

NEDD8 nucleates a multivalent cullin–RING–UBE2D ubiquitin ligation assembly

Autores: Kheewoong Baek, David T. Krist, J. Rajan Prabu, Spencer Hill, Maren Klügel, Lisa-Marie Neumaier, Susanne von Gronau, Gary Kleiger, Brenda A. Schulman
Publicado en: Nature, Edición 578/7795, 2020, Página(s) 461-466, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2000-y

Systemwide disassembly and assembly of SCF ubiquitin ligases.

Autores: Baek K, Scott DC, Henneberg LT, King M, Mann M, Schulman BA
Publicado en: Cell, Edición 186/9, 2023, Página(s) 1895-1911.e.21, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.02.035

New classes of E3 ligases illuminated by chemical probes.

Autores: Daniel Horn-Ghetko and Brenda A. Schulman
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 73, 2022, Página(s) 102341, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102341

How the ends signal the end: Regulation by E3 ubiquitin ligases recognizing protein termini.

Autores: Sherpa, D., Chrustowicz, J., & Schulman, B.
Publicado en: Molecular Cell, Edición 82/8, 2022, Página(s) 1424-1438, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.02.004

A GID E3 ligase assembly ubiquitinates an Rsp5 E3 adaptor and regulates plasma membrane transporters.

Autores: Langlois CR, Beier V, Karayel O, Chrustowicz J, Sherpa D, Mann M, Schulman BA.
Publicado en: EMBO Reports, Edición 23, 2022, Página(s) e53835, ISSN 1469-221X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202153835

Ubiquitin ligation to F-box protein targets by SCF–RBR E3–E3 super-assembly

Autores: Daniel Horn-Ghetko, David T. Krist, J. Rajan Prabu, Kheewoong Baek, Monique P. C. Mulder, Maren Klügel, Daniel C. Scott, Huib Ovaa, Gary Kleiger, Brenda A. Schulman
Publicado en: Nature, Edición 590/7847, 2021, Página(s) 671-676, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03197-9

An expanded lexicon for the ubiquitin code. Nature Reviews Molecular Cell Biology. doi.

Autores: Dikic, I., & Schulman, B. A.
Publicado en: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Edición 24/4, 2022, Página(s) 273-287, ISSN 1471-0072
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-022-00543-1

Structural snapshots along K48-linked ubiquitin chain formation by the HECT E3 UBR5.

Autores: Hehl LA, Horn-Ghetko D., Prabu JR, Vollrath R., Vu DT, Pérez Berrocal DA, Mulder MPC, van der Heden van Noort GJ, Schulman BA.
Publicado en: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01414-2

A pro-Fluorescent Ubiquitin-based Probe to Monitor Cysteine-based E3 Ligase Activity.

Autores: Pérez Berrocal D, Vishwanatha T, Horn Ghetko D, Bosch J, Hehl L, Kostrhon S, Misra M, Dikic I, Geurink P, van Dam H, Schulman B, Mulder MPC.
Publicado en: Angewandte Chemie International Edition, Edición 62/32, 2023, Página(s) e202303319, ISSN 1433-7851
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202303319