How does the ubiquitin-like protein NEDD8 activate ubiquitin ligase machineries?

Informacje na temat projektu

Nedd8Activate

Identyfikator umowy o grant: 789016

DOI

10.3030/789016

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 17 Kwietnia 2018

Data rozpoczęcia 1 Października 2018

Data zakończenia 30 Września 2023

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 193 871,00

Wkład UE

€ 2 193 871,00

Koordynowany przez

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (18)

Linkage-specific ubiquitin chain formation depends on a lysine hydrocarbon ruler

Autorzy: Joanna Liwocha, David T. Krist, Gerbrand J. van der Heden van Noort, Fynn M. Hansen, Vinh H. Truong, Ozge Karayel, Nicholas Purser, Daniel Houston, Nicole Burton, Mark J. Bostock, Michael Sattler, Matthias Mann, Joseph S. Harrison, Gary Kleiger, Huib Ovaa, Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 17/3, 2021, Strona(/y) 272-279, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-00696-0

K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution.

Autorzy: Aldwin Suryo Rahmanto, Christian J Blum, Claudia Scalera , Jan B Heidelberger, Mikhail Mesitov , Daniel Horn-Ghetko, Justus F Gräf, Ivan Mikicic, Rebecca Hobrecht, Anna Orekhova, Matthias Ostermaier, Stefanie Ebersberger, Martin M Möckel, Nils Krapoth, Nádia Da Silva Fernandes, Athanasia Mizi, Yajie Zhu, Jia-Xuan Chen, Chunaram Choudhary, Argyris Papantonis, Helle D Ulrich, Brenda A Schulman,
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 83/23, 2023, Strona(/y) 4272-4289.e10, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.10.011

CUL5-ARIH2 E3-E3 ubiquitin ligase structure reveals cullin-specific NEDD8 activation

Autorzy: Sebastian Kostrhon, J. Rajan Prabu, Kheewoong Baek, Daniel Horn-Ghetko, Susanne von Gronau, Maren Klügel, Jérôme Basquin, Arno F. Alpi, Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 17/10, 2021, Strona(/y) 1075-1083, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00858-8

Structure of CRL7FBXW8 reveals coupling with CUL1-RBX1/ROC1 for multi-cullin-RING E3-catalyzed ubiquitin ligation.

Autorzy: Hopf LVM, Baek K, Klügel M, Gronau Sv, Xiong Y, Schulman BA
Opublikowane w: Nature Structural and Molecular Biology, Numer 29, 2022, Strona(/y) 854-864, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-022-00815-6

Decoding the messaging of the ubiquitin system using chemical and protein probes

Autorzy: Lukas T. Henneberg, Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Cell Chemical Biology, Numer 28/7, 2021, Strona(/y) 889-902, ISSN 2451-9456
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chembiol.2021.03.009

Activity-based profiling of cullin-RING ligase networks by conformation-specific probes.

Autorzy: Henneberg LT, Singh J, Duda DM, Baek K, Yanishevski D, Murray PJ, Mann M, Sidhu SS, Schulman BA.
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01392-5

NEDD8 and ubiquitin ligation by cullin-RING E3 ligases

Autorzy: Kheewoong Baek, Daniel C Scott, Brenda A Schulman
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 67, 2021, Strona(/y) 101-109, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.10.007

Papain-like protease regulates SARS-CoV-2 viral spread and innate immunity

Autorzy: Donghyuk Shin, Rukmini Mukherjee, Diana Grewe, Denisa Bojkova, Kheewoong Baek, Anshu Bhattacharya, Laura Schulz, Marek Widera, Ahmad Reza Mehdipour, Georg Tascher, Paul P. Geurink, Alexander Wilhelm, Gerbrand J. van der Heden van Noort, Huib Ovaa, Stefan Müller, Klaus-Peter Knobeloch, Krishnaraj Rajalingam, Brenda A. Schulman, Jindrich Cinatl, Gerhard Hummer, Sandra Ciesek, Ivan Dikic
Opublikowane w: Nature, Numer 587/7835, 2020, Strona(/y) 657-662, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2601-5

E3 ligase autoinhibition by C-degron mimicry maintains C-degron substrate fidelity.

Autorzy: Daniel C Scott, Moeko T King, Kheewoong Baek, Clifford T Gee, Ravi Kalathur, Jerry Li, Nicholas Purser, Amanda Nourse, Sergio C Chai, Sivaraja Vaithiyalingam, Taosheng Chen, Richard E Lee, Stephen J Elledge, Gary Kleiger, Brenda A Schulman.
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 83/5, 2023, Strona(/y) 770-786.e.9, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.01.019

NEDD8 nucleates a multivalent cullin–RING–UBE2D ubiquitin ligation assembly

Autorzy: Kheewoong Baek, David T. Krist, J. Rajan Prabu, Spencer Hill, Maren Klügel, Lisa-Marie Neumaier, Susanne von Gronau, Gary Kleiger, Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Nature, Numer 578/7795, 2020, Strona(/y) 461-466, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2000-y

Systemwide disassembly and assembly of SCF ubiquitin ligases.

Autorzy: Baek K, Scott DC, Henneberg LT, King M, Mann M, Schulman BA
Opublikowane w: Cell, Numer 186/9, 2023, Strona(/y) 1895-1911.e.21, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.02.035

New classes of E3 ligases illuminated by chemical probes.

Autorzy: Daniel Horn-Ghetko and Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 73, 2022, Strona(/y) 102341, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102341

How the ends signal the end: Regulation by E3 ubiquitin ligases recognizing protein termini.

Autorzy: Sherpa, D., Chrustowicz, J., & Schulman, B.
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 82/8, 2022, Strona(/y) 1424-1438, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.02.004

A GID E3 ligase assembly ubiquitinates an Rsp5 E3 adaptor and regulates plasma membrane transporters.

Autorzy: Langlois CR, Beier V, Karayel O, Chrustowicz J, Sherpa D, Mann M, Schulman BA.
Opublikowane w: EMBO Reports, Numer 23, 2022, Strona(/y) e53835, ISSN 1469-221X
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202153835

Ubiquitin ligation to F-box protein targets by SCF–RBR E3–E3 super-assembly

Autorzy: Daniel Horn-Ghetko, David T. Krist, J. Rajan Prabu, Kheewoong Baek, Monique P. C. Mulder, Maren Klügel, Daniel C. Scott, Huib Ovaa, Gary Kleiger, Brenda A. Schulman
Opublikowane w: Nature, Numer 590/7847, 2021, Strona(/y) 671-676, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03197-9

An expanded lexicon for the ubiquitin code. Nature Reviews Molecular Cell Biology. doi.

Autorzy: Dikic, I., & Schulman, B. A.
Opublikowane w: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numer 24/4, 2022, Strona(/y) 273-287, ISSN 1471-0072
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-022-00543-1

Structural snapshots along K48-linked ubiquitin chain formation by the HECT E3 UBR5.

Autorzy: Hehl LA, Horn-Ghetko D., Prabu JR, Vollrath R., Vu DT, Pérez Berrocal DA, Mulder MPC, van der Heden van Noort GJ, Schulman BA.
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01414-2

A pro-Fluorescent Ubiquitin-based Probe to Monitor Cysteine-based E3 Ligase Activity.

Autorzy: Pérez Berrocal D, Vishwanatha T, Horn Ghetko D, Bosch J, Hehl L, Kostrhon S, Misra M, Dikic I, Geurink P, van Dam H, Schulman B, Mulder MPC.
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 62/32, 2023, Strona(/y) e202303319, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202303319