Objetivo
African trypanosomes are flagellated parasitic protozoans that cause the devastating, lethal disease sleeping sickness, as well as causing economically damaging livestock infections across sub-Saharan Africa. Trypanosomiasis was targeted for elimination by the WHO and others in the London declaration by 2020. Trypanosomes are transmitted by the bite of an infected tsetse fly, which restricts their geographic distribution. In the salivary gland of the fly, parasites coat their surface with approximately 10 million copies of a single variant surface glycoprotein (VSG) in a single layer which is protective against the mammalian immune system and prepares trypanosomes for infectivity. This VSG is expressed in a mono-allelic fashion from a specialized telomeric expression site. VSG coat is an important virulence mechanism; without this coat, parasites are rapidly lysed by mammalian complement. This project will address a fundamental question in trypanosome biology: How do African trypanosomes express a single VSG in its coat? I will address this questions primarily using single cell RNA-seq. First, I will establish an inDrops pipeline at the Institut Pasteur in collaboration with Prof. Andrew Griffiths at ESPCI (Paris) using cultured T. brucei, which will allow me to parameterize this novel single cell RNA-seq pipeline. Then using this protocol, I will generate single cell transcriptomes from tsetse fly derived parasites, constructing a gene expression profile for development of trypanosome infectivity. inDrops is a truly disruptive technology that allows massively parallel indexing of cellular mRNA, allowing transcriptomic analysis of thousands of single cells. These finding will have broad significance in the field; firstly, they will provide the first high-resolution single-cell transcriptome of this pathogen, and they will constitute a significant advance in our understanding of gene expression and the acquisition of infectivity in African trypanosomes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica psiquiatría trastornos del sueño
- ciencias médicas y de la salud medicina básica inmunología
- ciencias agrícolas ciencias animales y lácteas mascotas ganadería
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2017
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75724 Paris
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.