Novel PHAge MEthods for improved virus inactivation

Información del proyecto

NoPHAME

Identificador del acuerdo de subvención: 799417

DOI

10.3030/799417

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Marzo 2018

Fecha de inicio 1 Enero 2019

Fecha de finalización 31 Diciembre 2020

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 165 598,80

Aportación de la UE

€ 165 598,80

Coordinado por

ERASMUS UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM ROTTERDAM
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (10)

Characterization of Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Sewage and Stool Samples Through Next-Generation Sequencing

Autores: Sofia Strubbia, My V. T. Phan, Julien Schaeffer, Marion Koopmans, Matthew Cotten, Françoise S. Le Guyader
Publicado en: Food and Environmental Virology, Edición 11/4, 2019, Página(s) 400-409, ISSN 1867-0334
Editor: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s12560-019-09402-3

Increased resolution of African swine fever virus genome patterns based on profile HMMs of protein domains

Autores: Charles Masembe, My V T Phan, David L Robertson, Matthew Cotten
Publicado en: Virus Evolution, Edición 6/2, 2020, ISSN 2057-1577
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ve/veaa044

Setting a baseline for global urban virome surveillance in sewage

Autores: David F. Nieuwenhuijse, Bas B. Oude Munnink, My V. T. Phan, Patrick Munk, Shweta Venkatakrishnan, Frank M. Aarestrup, Matthew Cotten, Marion P. G. Koopmans
Publicado en: Scientific Reports, Edición 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-69869-0

Norovirus outbreak in a natural playground: A One Health approach

Autores: Gregorius J. Sips, Mariëlle J. G. Dirven, Joke T. Donkervoort, Francien M. Kolfschoten, Claudia M. E. Schapendonk, My V. T. Phan, Annemieke Bloem, Anna F. Leeuwen, Mariechristine E. Trompenaars, Marion P. G. Koopmans, Annemiek A. Eijk, Miranda Graaf, Ewout B. Fanoy
Publicado en: Zoonoses and Public Health, Edición 67/4, 2020, Página(s) 453-459, ISSN 1863-1959
Editor: Blackwell-Wiss.-Verl
DOI: 10.1111/zph.12689

Metavirome Sequencing to Evaluate Norovirus Diversity in Sewage and Related Bioaccumulated Oysters

Autores: Sofia Strubbia, Julien Schaeffer, Bas B. Oude Munnink, Alban Besnard, My V. T. Phan, David F. Nieuwenhuijse, Miranda de Graaf, Claudia M. E. Schapendonk, Candice Wacrenier, Matthew Cotten, Marion P. G. Koopmans, Françoise S. Le Guyader
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 10, 2019, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.02394

Genome Sequences of Seven Megrivirus Strains from Chickens in The Netherlands

Autores: Kirsty T. T. Kwok, Myrna M. T. de Rooij, Aniek B. Messink, Inge M. Wouters, Marion P. G. Koopmans, My V. T. Phan
Publicado en: Microbiology Resource Announcements, Edición 9/47, 2020, ISSN 2576-098X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mra.01207-20

Shedding of Yellow Fever Virus From an Imported Case in the Netherlands After Travel to Brazil

Autores: My V T Phan, Mariana Mendonca Melo, Els van Nood, Georgina Aron, Jolanda J C Kreeft-Voermans, Marion P G Koopmans, Chantal Reusken, Corine H GeurtsvanKessel, Matthew Cotten
Publicado en: Open Forum Infectious Diseases, Edición 7/2, 2020, ISSN 2328-8957
Editor: Infectious Disease Society of America
DOI: 10.1093/ofid/ofaa020

Automated download and clean-up of family-specific databases for kmer-based virus identification

Autores: Rosa L Allesøe, Camilla K Lemvigh, My V T Phan, Philip T L C Clausen, Alfred F Florensa, Marion P G Koopmans, Ole Lund, Matthew Cotten
Publicado en: Bioinformatics, Edición 2020 Oct 8;btaa857, 2020, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa857

Genome Sequence of a Minacovirus Strain from a Farmed Mink in The Netherlands

Autores: Kirsty T. T. Kwok, Myrna M. T. de Rooij, Felisita F. Sinartio, Lidwien A. M. Smit, Marion P. G. Koopmans, My V. T. Phan
Publicado en: Microbiology Resource Announcements, Edición 10/8, 2021, ISSN 2576-098X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mra.01451-20

Virus Metagenomics in Farm Animals: A Systematic Review

Autores: Kirsty T. T. Kwok, David F. Nieuwenhuijse, My V. T. Phan, Marion P. G. Koopmans
Publicado en: Viruses, Edición 12/1, 2020, Página(s) 107, ISSN 1999-4915
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v12010107