Novel PHAge MEthods for improved virus inactivation

Veröffentlichungen

Characterization of Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Sewage and Stool Samples Through Next-Generation Sequencing

Autoren: Sofia Strubbia, My V. T. Phan, Julien Schaeffer, Marion Koopmans, Matthew Cotten, Françoise S. Le Guyader
Veröffentlicht in: Food and Environmental Virology, Ausgabe 11/4, 2019, Seite(n) 400-409, ISSN 1867-0334
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s12560-019-09402-3

Increased resolution of African swine fever virus genome patterns based on profile HMMs of protein domains

Autoren: Charles Masembe, My V T Phan, David L Robertson, Matthew Cotten
Veröffentlicht in: Virus Evolution, Ausgabe 6/2, 2020, ISSN 2057-1577
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ve/veaa044

Setting a baseline for global urban virome surveillance in sewage

Autoren: David F. Nieuwenhuijse, Bas B. Oude Munnink, My V. T. Phan, Patrick Munk, Shweta Venkatakrishnan, Frank M. Aarestrup, Matthew Cotten, Marion P. G. Koopmans
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-69869-0

Norovirus outbreak in a natural playground: A One Health approach

Autoren: Gregorius J. Sips, Mariëlle J. G. Dirven, Joke T. Donkervoort, Francien M. Kolfschoten, Claudia M. E. Schapendonk, My V. T. Phan, Annemieke Bloem, Anna F. Leeuwen, Mariechristine E. Trompenaars, Marion P. G. Koopmans, Annemiek A. Eijk, Miranda Graaf, Ewout B. Fanoy
Veröffentlicht in: Zoonoses and Public Health, Ausgabe 67/4, 2020, Seite(n) 453-459, ISSN 1863-1959
Herausgeber: Blackwell-Wiss.-Verl
DOI: 10.1111/zph.12689

Metavirome Sequencing to Evaluate Norovirus Diversity in Sewage and Related Bioaccumulated Oysters

Autoren: Sofia Strubbia, Julien Schaeffer, Bas B. Oude Munnink, Alban Besnard, My V. T. Phan, David F. Nieuwenhuijse, Miranda de Graaf, Claudia M. E. Schapendonk, Candice Wacrenier, Matthew Cotten, Marion P. G. Koopmans, Françoise S. Le Guyader
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.02394

Genome Sequences of Seven Megrivirus Strains from Chickens in The Netherlands

Autoren: Kirsty T. T. Kwok, Myrna M. T. de Rooij, Aniek B. Messink, Inge M. Wouters, Marion P. G. Koopmans, My V. T. Phan
Veröffentlicht in: Microbiology Resource Announcements, Ausgabe 9/47, 2020, ISSN 2576-098X
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mra.01207-20

Shedding of Yellow Fever Virus From an Imported Case in the Netherlands After Travel to Brazil

Autoren: My V T Phan, Mariana Mendonca Melo, Els van Nood, Georgina Aron, Jolanda J C Kreeft-Voermans, Marion P G Koopmans, Chantal Reusken, Corine H GeurtsvanKessel, Matthew Cotten
Veröffentlicht in: Open Forum Infectious Diseases, Ausgabe 7/2, 2020, ISSN 2328-8957
Herausgeber: Infectious Disease Society of America
DOI: 10.1093/ofid/ofaa020

Automated download and clean-up of family-specific databases for kmer-based virus identification

Autoren: Rosa L Allesøe, Camilla K Lemvigh, My V T Phan, Philip T L C Clausen, Alfred F Florensa, Marion P G Koopmans, Ole Lund, Matthew Cotten
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 2020 Oct 8;btaa857, 2020, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa857

Genome Sequence of a Minacovirus Strain from a Farmed Mink in The Netherlands

Autoren: Kirsty T. T. Kwok, Myrna M. T. de Rooij, Felisita F. Sinartio, Lidwien A. M. Smit, Marion P. G. Koopmans, My V. T. Phan
Veröffentlicht in: Microbiology Resource Announcements, Ausgabe 10/8, 2021, ISSN 2576-098X
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mra.01451-20

Virus Metagenomics in Farm Animals: A Systematic Review

Autoren: Kirsty T. T. Kwok, David F. Nieuwenhuijse, My V. T. Phan, Marion P. G. Koopmans
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 12/1, 2020, Seite(n) 107, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v12010107

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