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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Folding Pathways of DNA G-quadruplexes in Crowding Conditions, and Implications for Mass Spectrometry-based Ligand Screening Assays

Objectif

Nucleic acids come in many forms aside from the Watson-Crick duplex. For example, guanine-rich DNA strands can form G-quadruplex structures, which have become attractive targets for small molecule ligands. It is now proven that G-quadruplexes can form in cells. Today most biophysical and structural studies on G-quadruplex folding are carried out in dilute aqueous solutions, but recent works suggest that the folding of some G-quadruplexes may differ in a crowded environment such as the cell environment. In the same way, most in vitro ligand binding assays are today carried out in dilute aqueous solutions. The aim of the project is to assess whether and how the folding pathways of G-quadruplexes differs in dilute and crowded conditions, and whether the community should revise the experimental design of ligand screening assays. We will focus on mass spectrometry-based assays, which have the unique advantage to give a direct read-out of ligand binding stoichiometry, quantity, and the variety of structural ensembles hiding behind the free and bound nucleic acid. The research program involves (1) developing mass spectrometry in more “native” conditions in the sense that we will add co-solutes to mimic cellular crowding, (2) comparing the G-quadruplex folding pathways in dilute and crowded conditions, by combining for the first time mass spectrometry, nuclear magnetic resonance, and single-molecule FRET (Förster resonance energy transfer), and (3) evaluating the impact of crowding on both traditional melting assays and mass spectrometry-based ligand screening assays. Our project will contribute to unveil fundamental principles of nucleic acid folding. It will also foster collaboration between three European institutes specialized in complementary biophysical and structural approaches to study G-quadruplexes. Finally, our project will also contribute to society by improving analytical approaches that are highly relevant to pharmacology.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017

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Coordinateur

INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 173 076,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 173 076,00
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