Descrizione del progetto
Ruolo dell’epigenetica e del trasferimento genico laterale nell’evoluzione eucariotica
I protisti sono organismi eucarioti, per lo più unicellulari, diversi da animali, piante o funghi. La loro evoluzione è strettamente legata a quella delle cellule eucariotiche. Sono ancora in gran parte inesplorati, il che limita la comprensione del significato del trasferimento genico laterale (LGT) e delle influenze non genetiche (ossia epigenetiche) sull’espressione genica nell’evoluzione eucariotica. Utilizzando tecniche bioinformatiche all’avanguardia, il progetto Macro-EpiK, finanziato dall’UE, mira a comprendere in che modo questi fattori abbiano influenzato la macroevoluzione del genoma eucariotico. In particolare, lo studio determinerà la filogenesi degli eucarioti e traccerà il profilo genetico dell’ultimo antenato comune eucariotico. Verranno inoltre analizzati i meccanismi epigenetici e le influenze sui protisti, nonché l’affascinante possibilità che anche il trasferimento genico orizzontale abbia avuto un impatto.
Obiettivo
Multicellular organisms (e.g. animals, fungi and plants) are the best-studied eukaryotes but their ancestors and the vast majority of eukaryotic diversity correspond to microbial species (“protists”). The evolutionary history of protists is closely connected to the evolution of the eukaryotic cell itself.
However, most protist diversity is still genomically unexplored, limiting our investigation of eukaryotic evolution. For example, while the importance of lateral gene transfer (LGT) in prokaryotic evolution is well recognized, its role in eukaryotic evolution is still debated. In addition, although epigenetic mechanisms represent a hallmark of eukaryotic genome regulation, we know surprisingly little about the evolution of these mechanisms across eukaryotic diversity.
The overarching goal of my project is to understand how epigenetic mechanisms and LGT have shaped the macroevolution of eukaryotic genomes. This project has several inter-related intermediate objectives, which each in themselves will bring crucial insights into eukaryotic evolution: 1) reconstructing a robust phylogeny of eukaryotes; 2) inferring the gene content of the Last Eukaryotic Common Ancestor; 3) tracing the evolution of genes involved in epigenetic mechanisms and obtaining epigenomic maps from under-studied protists; 4) investigating the intriguing hypothesis of a possible interplay between epigenetic regulation and horizontal gene transfer and its influence on eukaryotic genome evolution: Have genes involved in epigenomic mechanisms been transferred between eukaryotes? Do epigenomic modifications affect the frequency of LGT in different lineages?
To achieve this, I will characterize the transcriptomes, genomes, methylomes and small RNAs of understudied eukaryotic microbes selected for their key phylogenetic position, and to analyse them using state-of-the-art bioinformatic methods. I will target uncultivated protists, using single-cell techniques and novel genome-scaffolding approaches.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare genetica molecolare
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica epigenetica
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi genomi eucariotici
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Siamo spiacenti… si è verificato un errore inatteso durante l’esecuzione.
È necessario essere autenticati. La sessione potrebbe essere scaduta.
Grazie per il tuo feedback. Riceverai presto un'e-mail di conferma dell'invio. Se hai scelto di ricevere una notifica sullo stato della segnalazione, sarai contattato anche quando lo stato della segnalazione cambierà.
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-STG - Starting Grant
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-STG
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bandoIstituzione ospitante
Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75794 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.