Descrizione del progetto
L’analisi del DNA aiuta a comprendere l’evoluzione e l’adattamento dell’uomo
Il rapidissimo sviluppo delle tecnologie di sequenziamento ha consentito l’accesso a migliaia di genomi umani provenienti da tutto il mondo, inclusi antichi dati sulla sequenza del DNA per i genetisti della popolazione. L’analisi di queste raccolte di DNA moderno e antico può aiutare a comprendere tratti degli adattamenti evolutivi umani. Il progetto finanziato dall’UE svilupperà nuove analisi statistiche per rilevare eventi selettivi condivisi tra le popolazioni, prestando particolare attenzione all’integrazione di dati aplotipici su più popolazioni. I ricercatori rileveranno tratti di adattamento facilitati dalla mescolanza nel DNA in applicazione a nuovi set di dati disponibili per le popolazioni delle Americhe insieme ad analisi comparative di campioni europei antichi e moderni. Questo studio è un passo importante non solo nella comprensione dei meccanismi dell’evoluzione, ma anche nell’adattamento alle malattie umane.
Obiettivo
With the advent of new sequencing technologies, population geneticists now have access to more data than ever before. We have access to thousands of human genomes from a diverse set of populations around the globe, and, thanks to advances in DNA extraction and library preparation, we now are beginning to have access to ancient DNA sequence data. These data have greatly improved our knowledge of human history, human adaptation to different environments and human disease. Genome-wide studies have highlighted many genes or genomic loci that may play a role in adaptive or disease related phenotypes of biological importance.
With these collections of modern and ancient sequence data we want to answer a key evolutionary question: how do human adaptations arise? We strongly believe that the state-of-the-art methodologies for uncovering signatures of adaptation are blind to potential modes of adaptation because they are lacking two critical components – more complete integration of multiple population haplotype data (including archaic, ancient and modern samples), and an account of population interactions that facilitate adaptation.
Therefore I plan to develop new methods to detect shared selective events across populations by creating novel statistical summaries, and to detect admixture-facilitated adaptation which we believe is likely a common mode of natural selection. We will apply these tools to new datasets to characterize the interplay of natural selection, archaic and modern admixture in populations in the Americas and make a comparative analysis of modern and ancient European samples to understand the origin and changing profile of adaptive archaic alleles. As a result our work will reveal evolutionary processes that have played an important role in human evolution and disease.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- scienze umanistichestoria e archeologiastoria
- scienze naturaliscienze biologichegeneticaDNA
- scienze naturaliscienze biologichegeneticagenomi
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Programma(i)
Argomento(i)
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-STG
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D02 CX56 Dublin
Irlanda