Descripción del proyecto
Formar a los investigadores sobre el análisis de datos a gran escala
Los investigadores europeos han contribuido de manera significativa a grandes conjuntos de datos genómicos, transcriptómicos y clínicos obtenidos de pacientes con enfermedades crónicas. Los avances en la ciencia de la información ofrecen oportunidades para impulsar el uso de estos conjuntos de datos. Sin embargo, no son muchos los investigadores que cuentan con los conocimientos y competencias informáticas en relación con los últimos principios de protección de datos. El proyecto financiado con fondos europeos HELICAL desarrollará un programa pluridisciplinario de formación para quince estudiantes de doctorado. Utilizará la vasculitis autoinmunitaria como paradigma para impartir la formación sobre análisis de datos. El programa de formación de treinta y seis meses se centrará en la aplicación de la informática a estos conjuntos de datos para obtener nuevos datos biológicos así como la traducción de dichos datos en resultados prácticos para el ámbito clínico. Asimismo, busca desarrollar estrategias para hacer frente a las limitaciones éticas impuestas sobre estos estudios.
Objetivo
European researchers have made leading contributions to the large genomic, transcriptomic and clinical datasets from patients with chronic diseases. Advances in information science provide unprecedented opportunities for using these datasets to elucidate the complex biology of these disorders, its influence by environmental triggers, and to personalise their management. Currently, exploitation of these opportunities is limited by a shortage of researchers with the required informatics skills and knowledge of requisite data protection principles. HELICAL addresses this unmet need by developing a trans-sectoral and interdisciplinary training programme that builds on the expertise and existing collaborations of its partners. It provides 15 early stage researchers with training in analysis of large datasets, using autoimmune vasculitis as a paradigm as it is scalable, and as comprehensive biological and clinical datasets are already available. The HELICAL training program focuses on three complementary areas: application of informatics to such datasets to gain new biological insights; translation of these into practical clinical outputs and management of ethical constraints imposed on such studies. The programme will be delivered through a multidisciplinary, trans-sectoral partnership of Academic and Industry researchers with expertise in basic biomedical research, epidemiology, statistics, machine learning, health data governance and ethics. Therefore, HELICAL exploits recent advances in data science to link research datasets with longitudinal healthcare records, based on the robust ethical foundation required for linkage studies using near-patient data, to address key experimental questions. The results will have obvious potential for transforming healthcare in the field of autoimmune disease. The training provided addresses a key skills gap in the European workforce and should make the ESR eminently employable in academic, industrial and clinical sectors.
Ámbito científico
- natural sciencescomputer and information sciencesdata science
- natural sciencescomputer and information sciencescomputer securitydata protection
- medical and health scienceshealth sciencespublic healthepidemiology
- medical and health sciencesbasic medicineimmunologyautoimmune diseases
- natural sciencescomputer and information sciencesartificial intelligencemachine learning
Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-ITN - Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Networks (ITN)Coordinador
D02 CX56 DUBLIN 2
Irlanda
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Participantes (14)
La participación finalizó
75006 Paris
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08036 Barcelona
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28006 Madrid
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LS2 9JT Leeds
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08036 Barcelona
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1090 Wien
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100 44 Stockholm
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08007 Barcelona
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
1020 Wien
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
68330 Huningue
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
9860 OOSTERZELE
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G12 8QQ Glasgow
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8803 Rueschlikon
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9007 St. Gallen
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Socios (10)
Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
NE1 7RU Newcastle Upon Tyne
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
751 05 Uppsala
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
9000 Gent
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
116 36 Praha 1
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
08193 Cerdanyola Del Valles
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
39011 Santander
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
CB10 1DR Cambridge
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
08007 Barcelona
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
75015 Paris
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Las organizaciones asociadas contribuyen a la aplicación de la acción, pero no firman el acuerdo de subvención.
D08P X8H Dublin
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