Description du projet
Former les chercheurs à l’analyse de données à grande échelle
Les chercheurs européens ont contribué de manière significative aux vastes ensembles de données génomiques, transcriptomiques et cliniques recueillis auprès de patients atteints de maladies chroniques. Les progrès réalisés en science de l’information offrent des possibilités d’utilisation accrue de ces ensembles de données. Cependant, peu de chercheurs possèdent les compétences informatiques requises et connaissent les derniers principes de protection des données. Le projet HELICAL, financé par l’UE, développera un programme de formation interdisciplinaire pour 15 étudiants en doctorat. Il utilisera la vascularite auto‑immune comme paradigme pour dispenser une formation à l’analyse des données. Ce programme de formation de 36 mois sera axé sur l’application de l’informatique à ces ensembles de données afin d’acquérir de nouvelles connaissances biologiques, ainsi que sur la traduction des résultats biologiques en résultats cliniques pratiques. Il vise également à développer des stratégies pour gérer les contraintes éthiques imposées à de telles études.
Objectif
European researchers have made leading contributions to the large genomic, transcriptomic and clinical datasets from patients with chronic diseases. Advances in information science provide unprecedented opportunities for using these datasets to elucidate the complex biology of these disorders, its influence by environmental triggers, and to personalise their management. Currently, exploitation of these opportunities is limited by a shortage of researchers with the required informatics skills and knowledge of requisite data protection principles. HELICAL addresses this unmet need by developing a trans-sectoral and interdisciplinary training programme that builds on the expertise and existing collaborations of its partners. It provides 15 early stage researchers with training in analysis of large datasets, using autoimmune vasculitis as a paradigm as it is scalable, and as comprehensive biological and clinical datasets are already available. The HELICAL training program focuses on three complementary areas: application of informatics to such datasets to gain new biological insights; translation of these into practical clinical outputs and management of ethical constraints imposed on such studies. The programme will be delivered through a multidisciplinary, trans-sectoral partnership of Academic and Industry researchers with expertise in basic biomedical research, epidemiology, statistics, machine learning, health data governance and ethics. Therefore, HELICAL exploits recent advances in data science to link research datasets with longitudinal healthcare records, based on the robust ethical foundation required for linkage studies using near-patient data, to address key experimental questions. The results will have obvious potential for transforming healthcare in the field of autoimmune disease. The training provided addresses a key skills gap in the European workforce and should make the ESR eminently employable in academic, industrial and clinical sectors.
Champ scientifique
- natural sciencescomputer and information sciencesdata science
- natural sciencescomputer and information sciencescomputer securitydata protection
- medical and health scienceshealth sciencespublic healthepidemiology
- medical and health sciencesbasic medicineimmunologyautoimmune diseases
- natural sciencescomputer and information sciencesartificial intelligencemachine learning
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-ITN - Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Networks (ITN)Coordinateur
D02 CX56 DUBLIN 2
Irlande
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Participants (14)
Participation terminée
75006 Paris
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08036 Barcelona
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28006 Madrid
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LS2 9JT Leeds
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08036 Barcelona
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1090 Wien
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100 44 Stockholm
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08007 Barcelona
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
1020 Wien
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68330 Huningue
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9860 OOSTERZELE
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G12 8QQ Glasgow
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8803 Rueschlikon
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9007 St. Gallen
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Partenaires (10)
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
NE1 7RU Newcastle Upon Tyne
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751 05 Uppsala
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9000 Gent
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116 36 Praha 1
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08193 Cerdanyola Del Valles
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39011 Santander
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CB10 1DR Cambridge
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08007 Barcelona
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75015 Paris
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D08P X8H Dublin
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