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Pathway database with all ranking and analysis metricsDatabase containing the pathways and ranking metrics used
Report detailing the communication channels, such as the website and social media accounts
Project visuals and messagingReport detailing project visuals and messaging plaforms
Sustainability appraisal and risk assessment of 10 target moleculesPublicaciones
Autores:
Vítor Pereira, Miguel Rocha
Publicado en:
Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, 15th International Conference (PACBB 2021), 2021, ISBN 978-3-030-86257-2
Editor:
Springer
DOI:
10.1007/978-3-030-86258-9_16
Autores:
Fernando Cruz, Diogo Lima, José P. Faria, Miguel Rocha, Oscar Dias
Publicado en:
Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 13th International Conference, Edición 1005, 2020, Página(s) 173-181, ISBN 978-3-030-23872-8
Editor:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-030-23873-5_21
Autores:
João Correia, Tiago Resende, Delora Baptista, Miguel Rocha
Publicado en:
Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 13th International Conference, Edición 1005, 2020, Página(s) 164-172, ISBN 978-3-030-23872-8
Editor:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-030-23873-5_20
Autores:
Pablo Carbonell
Publicado en:
New Frontiers and Applications of Synthetic Biology, 2022, Página(s) 205-214, ISBN 978-0-12-824469-2
Editor:
Academic Press
DOI:
10.1016/b978-0-12-824469-2.00024-5
Autores:
Verónica Ramos-Viana; Iben Møller-Hansen; Paul Kempen; Irina Borodina
Publicado en:
FEMS Yeast Research, Edición 1, 2022, ISSN 1567-1356
Editor:
Blackwell
DOI:
10.1093/femsyr/foac037
Autores:
Francesco Del Carratore, Erik KR Hanko, Rainer Breitling, Eriko Takano
Publicado en:
Current Opinion in Biotechnology, 2022, ISSN 1879-0429
Editor:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.copbio.2022.102762
Autores:
Omid Oftadeh, Pierre Salvy, Maria Masid, Maxime Curvat, Ljubisa Miskovic & Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
Nature Communications, Edición 12, 2021, Página(s) 4790, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-25158-6
Autores:
Erik K. R. Hanko, Tariq A. Joosab Noor Mahomed, Ruth A. Stoney, and Rainer Breitlin
Publicado en:
ACS Synthetic Biology, 2023, ISSN 2161-5063
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acssynbio.2c00679
Autores:
Subham Choudhury; Michael Moret; Pierre Salvy; Daniel Weilandt; Vassily Hatzimanikatis; Ljubisa Miskovic
Publicado en:
Nature Machine Intelligence, Edición 1, 2022, ISSN 2522-5839
Editor:
Nature Group
DOI:
10.1101/2022.01.06.475020
Autores:
Margarida Saramago; Cátia Bárria; Vanessa G. Costa; Caio S. Souza; Sandra C. Viegas; Susana Domingues; Diana Lousa; Cláudio M. Soares; Cecília M. Arraiano; Rute G. Matos
Publicado en:
The Febs Journal, Edición 1, 2021, ISSN 1742-464X
Editor:
Blackwell Publishing Inc.
DOI:
10.1111/febs.15815
Autores:
Evangelia Vayena; Anush Chiappino-Pepe; Homa MohammadiPeyhani; Yannick Francioli; Noushin Hadadi; Meriç Ataman; Jasmin Hafner; Stavros Pavlou; Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
PNAS, Edición 1, 2022, ISSN 0027-8424
Editor:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1101/2022.02.10.479881
Autores:
Nicholas Milne; Javier Sáez‐Sáez; Annette Munch Nielsen; Jane Dannow Dyekjær; Daniela Rago; Mette Kristensen; Tune Wulff; Irina Borodina
Publicado en:
ChemistryOpen, Edición 1, 2023, ISSN 2191-1363
Editor:
Weinheim: Wiley-VCH-Verl.
DOI:
10.1002/open.202200266
Autores:
Bharath Narayanan; Daniel Weilandt; Maria Masid; Ljubisa Miskovic; Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
Nature Communications, Edición 1, 2024, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1101/2022.11.14.516382
Autores:
Mahsa Babaei; Gheorghe Manuel Borja Zamfir; Xiao Chen; Hanne Bjerre Christensen; Mette Kristensen; Jens Nielsen; Jens Nielsen; Irina Borodina
Publicado en:
ACS Synthetic Biology, Edición 6, 2020, ISSN 2161-5063
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acssynbio.0c00048
Autores:
Tiago J. C. Sousa; João Correia; Vitor Pereira; Miguel Rocha
Publicado en:
Journal of Chemical Information and Modeling, Edición 61 (11), 2021, Página(s) 5343–5361, ISSN 1549-9596
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.0c01496
Autores:
Erik K. R. Hanko; João Correia; Caio S. Souza; Alison Green; Jakub Chromy; Ruth Stoney; Cunyu Yan; Eriko Takano; Diana Lousa; Cláudio M. Soares; Rainer Breitling
Publicado en:
BMC Research Notes, Edición 1, 2023, ISSN 1756-0500
Editor:
BioMed Central
DOI:
10.21203/rs.3.rs-2742541/v1
Autores:
Asli Sahin; Daniel R. Weilandt; Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
Nature Communications, Edición 1, 2023, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-38159-4
Autores:
Mark S Dunstan, Christopher J Robinson, Adrian J Jervis, Cunyu Yan, Pablo Carbonell, Katherine A Hollywood, Andrew Currin, Neil Swainston, Rosalind Le Feuvre, Jason Micklefield, Jean-Loup Faulon, Rainer Breitling, Nicholas Turner, Eriko Takano, Nigel S Scrutton
Publicado en:
Synthetic Biology, Edición 5 (1), 2020, ISSN 2397-7000
Editor:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/synbio/ysaa012
Autores:
Guokun Wang; Guokun Wang; Aline Tavares; Simone Schmitz; Simone Schmitz; Lucas Gabriel Souza França; Hugo Almeida; João Cavalheiro; Ana Carolas; Süleyman Øzmerih; Lars M. Blank; Bruno Sommer Ferreira; Irina Borodina
Publicado en:
Biotechnology and Bioengineering, Edición 7, 2021, ISSN 0006-3592
Editor:
Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI:
10.1002/bit.27992
Autores:
Javier Sáez-Sáez; Guokun Wang; Eko Roy Marella; Suresh Sudarsan; Marc Cernuda Pastor; Irina Borodina
Publicado en:
Metabolic Engineering, 2020, ISSN 1096-7176
Editor:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.ymben.2020.08.009
Autores:
Mahsa Babaei, Philip Tinggaard Thomsen, Marc Cernuda Pastor, Michael Krogh Jensen, and Irina Borodina
Publicado en:
ACS Synthetic Biology, 2024, ISSN 2161-5063
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acssynbio.3c00396
Autores:
Irene Otero-Muras, Pablo Carbonell
Publicado en:
Metabolic Engineering, Edición 63, 2020, Página(s) 61-80, ISSN 1096-7176
Editor:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.ymben.2020.11.012
Autores:
Carlos Costa; Iben Møller-Hansen; Aloia Romaní; José A. Teixeira; Irina Borodina; Lucília Domingues
Publicado en:
ACS Synthetic Biology, Edición 6, 2021, ISSN 2161-5063
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acssynbio.1c00120
Autores:
Carlos E. Costa; Aloia Romaní; Iben Møller-Hansen; José A. Teixeira; Irina Borodina; Lucília Domingues
Publicado en:
Green Chemistry, Edición 1, 2022, ISSN 1463-9270
Editor:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/d2gc02429b
Autores:
Vítor Vieira, Paulo Maia, Miguel Rocha, Isabel Rocha
Publicado en:
BMC Bioinformatics, Edición 20/1, 2019, ISSN 1471-2105
Editor:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12859-019-2934-y
Autores:
Christopher J. Robinson, Pablo Carbonell, Adrian J. Jervis, Cunyu Yan, Katherine A. Hollywood, Mark S. Dunstan, Andrew Currin, Neil Swainston, Reynard Spiess, Sandra Taylor, Paul Mulherin, Steven Parker, William Rowe, Nicholas E. Matthews, Kirk J. Malone, Rosalind Le Feuvre, Philip Shapira, Perdita Barran, Nicholas J. Turner, Jason Micklefield, Rainer Breitling, Eriko Takano, Nigel S. Scrutton
Publicado en:
Metabolic Engineering, Edición 60, 2020, Página(s) 168-182, ISSN 1096-7176
Editor:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.ymben.2020.04.008
Autores:
N. Milne, P. Thomsen, N. Mølgaard Knudsen, P. Rubaszka, M. Kristensen, I. Borodina
Publicado en:
Metabolic Engineering, Edición 60, 2020, Página(s) 25-36, ISSN 1096-7176
Editor:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.ymben.2019.12.007
Autores:
Gheorghe M. Borja, Angelica Rodriguez, Kate Campbell, Irina Borodina, Yun Chen, Jens Nielsen
Publicado en:
Microbial Cell Factories, Edición 18/1, 2019, ISSN 1475-2859
Editor:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12934-019-1244-4
Autores:
Vítor Vieira, Miguel Rocha
Publicado en:
Bioinformatics, Edición 35/24, 2019, Página(s) 5361-5362, ISSN 1367-4803
Editor:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btz598
Autores:
Lewis Grozinger, Martyn Amos, Thomas E. Gorochowski, Pablo Carbonell, Diego A. Oyarzún, Ruud Stoof, Harold Fellermann, Paolo Zuliani, Huseyin Tas, Angel Goñi-Moreno
Publicado en:
Nature Communications, Edición 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-019-13232-z
Autores:
Francesco Del Carratore, Kamila Schmidt, Maria Vinaixa, Katherine A. Hollywood, Caitlin Greenland-Bews, Eriko Takano, Simon Rogers, Rainer Breitling
Publicado en:
Analytical Chemistry, Edición 91/20, 2019, Página(s) 12799-12807, ISSN 0003-2700
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b02354
Autores:
Andrew Currin, Neil Swainston, Mark S Dunstan, Adrian J Jervis, Paul Mulherin, Christopher J Robinson, Sandra Taylor, Pablo Carbonell, Katherine A Hollywood, Cunyu Yan, Eriko Takano, Nigel S Scrutton, Rainer Breitling
Publicado en:
Synthetic Biology, 2019, ISSN 2397-7000
Editor:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/synbio/ysz025
Autores:
Pablo Carbonell, Jean-Loup Faulon, Rainer Breitling
Publicado en:
IFAC-PapersOnLine, Edición 52/26, 2019, Página(s) 7-12, ISSN 2405-8963
Editor:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.ifacol.2019.12.228
Autores:
Margarida Saramago; Vanessa Costa; Caio Souza; Cátia Bárria; Susana Domingues; Sandra Viegas; Diana Lousa; Cláudio Soares; Cecília Arraiano; Rute Matos
Publicado en:
Microorganisms, Edición 1, 2022, ISSN 2076-2607
Editor:
MDPI
DOI:
10.3390/microorganisms10020342
Autores:
Pablo Carbonell; Pablo Carbonell; Rosalind Le Feuvre; Eriko Takano; Nigel S. Scrutton
Publicado en:
Synthetic Biology, Edición 5 (1), 2020, Página(s) ysaa020, ISSN 2397-7000
Editor:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/synbio/ysaa020
Autores:
Guokun Wang; Douglas B. Kell; Irina Borodina
Publicado en:
Essays in Biochemistry, 2021, ISSN 0071-1365
Editor:
Portland Press, Ltd.
DOI:
10.1042/ebc20200137
Autores:
Jasmin Hafner, Homa MohammadiPeyhani, Anastasia Sveshnikova, Alan Scheidegger, and Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
ACS Synthetic Biology, Edición 9 (6), 2020, Página(s) 1479-1482, ISSN 2161-5063
Editor:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acssynbio.0c00052
Autores:
Vítor Pereira, Fernando Cruz, Miguel Rocha
Publicado en:
Bioinformatics, Edición 37 (16), 2021, Página(s) 2494-2496, ISSN 1367-4803
Editor:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btab013
Autores:
Mahsa Babaei; Luisa Sartori; Alexey Karpukhin; Dmitrii Abashkin; Elena Matrosova; Irina Borodina
Publicado en:
FEMS Yeast Research, Edición 3, 2021, ISSN 1567-1356
Editor:
Blackwell
DOI:
10.1093/femsyr/foab027
Autores:
Tiago J. C. Sousa; João Correia; Vitor Pereira; Miguel Rocha
Publicado en:
Applications of Evolutionary Computation, Edición 24th International Conference, EvoApplications 2021, Held as Part of EvoStar 2021, Virtual Event, April 7–9, 2021, Proceedings, 2021, Página(s) 81-96, ISBN 978-3-030-72699-7
Editor:
Springer
DOI:
10.1007/978-3-030-72699-7_6
Autores:
Miguel Martins; Miguel Rocha; Vitor Pereira
Publicado en:
2022 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), Edición 1, 2022, ISBN 9788070439876
Editor:
IEEE
DOI:
10.1109/cec55065.2022.9870421
Autores:
Maria Guadalupe Camarena; Yadira Boada; Jesús Picó; Pablo Carbonell
Publicado en:
Actas de las Jornadas de Automática, Edición yearly, 2021, ISBN 978-84-9749-804-3
Editor:
CEA-IFAC
DOI:
10.17979/spudc.9788497498043.485
Autores:
João Correia; Vítor Pereira; Miguel Rocha
Publicado en:
GECCO '23: Proceedings of the Genetic and Evolutionary Computation Conference, Edición 1, 2023
Editor:
Association for Computing Machinery
DOI:
10.1145/3583131.3590413
Autores:
Saez Saez, Javier (PhD Student)Borodina, Irina (Main Supervisor)Babaei, Mahsa (Supervisor)Ingemann Jensen, Sheila (Supervisor)Morrissey, John (Examiner)Siewers, Verena (Examiner)
Publicado en:
2023
Editor:
DTU
Autores:
Weilandt, Daniel Robert
Publicado en:
2020
Editor:
EPFL
DOI:
10.5075/epfl-thesis-7900
Autores:
Daniel R. Weilandt, Pierre Salvy, Maria Masid, Georgios Fengos, Robin Denhardt-Erikson, Zhaleh Hosseini, Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
bioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editor:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/2022.01.17.476618
Autores:
María Camarena, Pablo Carbonell
Publicado en:
bioRxiv, 2021, ISSN 2692-8205
Editor:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/2021.09.09.459461
Autores:
Anastasia Sveshnikova, Homa MohammadiPeyhani, Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
bioRxiv, 2021, ISSN 2692-8205
Editor:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/2021.12.06.471405
Autores:
Homa Mohammadi-Peyhani, Jasmin Hafner, Anastasia Sveshnikova, Victor Viterbo, Vassily Hatzimanikatis
Publicado en:
bioRxiv, 2021, ISSN 2692-8205
Editor:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/2021.02.17.431583
Autores:
Subham Choudhury; Bharath Narayanan; Michael Moret; Vassily Hatzimanikatis; Ljubisa Miskovic
Publicado en:
bioRxiv, Edición 1, 2023
Editor:
bioRxiv
DOI:
10.1101/2023.02.21.529387
Derechos de propiedad intelectual
Número de solicitud/publicación:
20
20075823
Fecha:
2020-09-16
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