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The evolutionary genetics of transposable element invasions

Descrizione del progetto

Profilazione di sequenze di DNA scorrette in grado di saltare tra gli organismi o al loro interno

Il DNA di un organismo viene costantemente minacciato da fattori esterni e interni. I trasposoni, definiti ufficialmente elementi trasponibili (TE, transposable elements), sono sequenze di DNA che si spostano da una posizione del genoma all’altra e, pur rappresentando una fonte importante di diversità genetica, hanno spesso effetti deleteri. Al fine di inibirne gran parte dell’attività, il genoma stesso codifica meccanismi che i TE riescono ad eludere invadendo nuove specie. Fortunatamente, i loro nuovi ospiti sviluppano rapidamente i meccanismi di difesa. Il progetto TE_INVASION, finanziato dall’UE, sta chiarendo il complicato rapporto dei TE con i loro ospiti originali e adottati. Le informazioni provenienti dal progetto avranno un impatto significativo sulla nostra comprensione dell’evoluzione e delle potenziali conseguenze di terapie geniche.

Obiettivo

Transposable elements play major roles in the genome evolution of eukaryotes, and cause harmful mutations, deleterious side effects, and disease. These costs drive their eukaryotic hosts to evolve counter-adaptations, which are so effective that TEs are thought to only survive long term by invading new naïve species. These transposable element invasions appear to occur via horizontal transfer, and can result in the rapid, selfish spread of the element through a species. Despite the evolutionary importance of the host-transposable element relationship, there are still major gaps in our knowledge of how they evolve and persist. Host resistance can evolve astonishingly rapidly, but the evolutionary mechanism by which this happens is unknown. Some horizontal transfer events result in successful invasions, but we have little idea of what factors favour success, or, except in rare cases, how the transfer events occur.

This proposal outlines a four-part research programme to address these gaps, examining both sides of the coevolutionary equation. Specifically, I will examine the rapid evolution of suppression from the host side, to understand the population genetics of this process. I will study invasions from the perspective of the transposable element, and ask what genetic factors contribute to their success. To accomplish these objectives, I will take advantage of a unique opportunity-- an ongoing invasion of a model transposable element in a close relative of the genetic model fly. Finally, I will examine the role of parasites as vectors of TEs ,to understand mechanisms of horizontal transfer between species.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-COG - Consolidator Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

THE UNIVERSITY OF LIVERPOOL
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 991 315,00
Indirizzo
BROWNLOW HILL 765 FOUNDATION BUILDING
L69 7ZX LIVERPOOL
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
North West (England) Merseyside Liverpool
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 991 315,00

Beneficiari (1)

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