Opis projektu
Profilowanie sekwencji DNA, które mogą przemieszczać się wewnątrz organizmu i pomiędzy różnymi organizmami
Każdego dnia DNA organizmu zagrażają czynniki zewnętrzne i wewnętrzne. Transpozony, zwane inaczej „wędrującymi genami”, to sekwencje DNA, które przemieszczają się z jednego miejsca w genomie do drugiego. Choć transpozony są ważnym źródłem różnorodności genetycznej, często mają one szkodliwe działanie. Sam genom koduje mechanizmy hamujące większość aktywności transpozonów, jednak transpozony mogą unikać tych mechanizmów poprzez inwazję na nowe gatunki. Na szczęście u ich nowych gospodarzy szybko rozwijają się mechanizmy obronne. Zespół finansowanego ze środków UE projektu TE_INVASION pracuje nad rozwikłaniem skomplikowanych relacji transpozonów z ich pierwotnymi i nowymi gospodarzami. Wnioski z tego projektu będą miały istotny wpływ na naszą wiedzę na temat rozwoju i potencjalnych skutków terapii genowych.
Cel
Transposable elements play major roles in the genome evolution of eukaryotes, and cause harmful mutations, deleterious side effects, and disease. These costs drive their eukaryotic hosts to evolve counter-adaptations, which are so effective that TEs are thought to only survive long term by invading new naïve species. These transposable element invasions appear to occur via horizontal transfer, and can result in the rapid, selfish spread of the element through a species. Despite the evolutionary importance of the host-transposable element relationship, there are still major gaps in our knowledge of how they evolve and persist. Host resistance can evolve astonishingly rapidly, but the evolutionary mechanism by which this happens is unknown. Some horizontal transfer events result in successful invasions, but we have little idea of what factors favour success, or, except in rare cases, how the transfer events occur.
This proposal outlines a four-part research programme to address these gaps, examining both sides of the coevolutionary equation. Specifically, I will examine the rapid evolution of suppression from the host side, to understand the population genetics of this process. I will study invasions from the perspective of the transposable element, and ask what genetic factors contribute to their success. To accomplish these objectives, I will take advantage of a unique opportunity-- an ongoing invasion of a model transposable element in a close relative of the genetic model fly. Finally, I will examine the role of parasites as vectors of TEs ,to understand mechanisms of horizontal transfer between species.
Dziedzina nauki
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-COG - Consolidator GrantInstytucja przyjmująca
L69 7ZX Liverpool
Zjednoczone Królestwo