Possible Life: The Philosophical Significance of Extending Biology

Understanding, Virtually: How Does the Synthetic Cell Matter?

Autori: Daphne Broeks; Tarja Knuuttila; Henk de Regt
Pubblicato in: Perspectives ion Science, Numero 32(3), 2024, Pagina/e 394-414, ISSN 1063-6145
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1162/posc_a_00612

Deidealization: No Easy Reversals

Autori: Tarja Knuuttila, Mary S. Morgan
Pubblicato in: Philosophy of Science, Numero 86(4), 2019, ISSN 0031-8248
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1086/704975

"""Molecular Biology”—Pleonasm or Denotation for a Discipline ofIts Own? Reflections on the Origins of Molecular Biology and Its Situation Today"

Autori: Gregor P. Greslehner
Pubblicato in: Biomolecule, Numero 13(10), 2023, Pagina/e 1511, ISSN 2218-273X
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/biom13101511

Holistic idealization: An artifactual standpoint

Autori: Natalia Carrillo, Tarja Knuuttila
Pubblicato in: Studies in History and Philosophy of Science Part A,, Numero 91, 2022, Pagina/e 49-59, ISSN 0039-3681
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.shpsa.2021.10.009

How localized are computational templates? A machine learning approach

Autori: Maximilian Noichl
Pubblicato in: Synthese, Numero 201, 2023, Pagina/e 107, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.
DOI: 10.1007/s11229-023-04057-x

Minding the gut: extending embodied cognition and perception to the gut complex

Autori: Boem, F., Greslehner G.P., Konsman, J.P., Chiu, L.
Pubblicato in: Frontiers in Neuroscience, Numero 17, 2023, Pagina/e 1172783, ISSN 1662-4548
Editore: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnins.2023.1172783

Representations of and by the Extended Mind

Autori: Moritz Kriegleder
Pubblicato in: Constructivist Foundations, Numero 17(3), 2022, Pagina/e 236–238, ISSN 1782-348X
Editore: Vrije Universiteit Brussel

Could We Really Be Made of Swiss Cheese? Xenobiology as an Engineering Epistemology for Biological Realization

Autori: Rami Koskinen
Pubblicato in: ChemBioChem, Numero 21/18, 2020, Pagina/e 2591-2594, ISSN 1439-4227
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000063

(Un)Easily Possible Synthetic Biology

Autori: Knuuttila, Tarja; Loettgers, Andrea
Pubblicato in: Philosophy of Science, Numero 89(5), 2022, Pagina/e 908 - 917, ISSN 0031-8248
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1017/psa.2022.60

Divide & Rule: The Future of Enactivism

Autori: Moritz Kriegleder
Pubblicato in: Constructivist Foundations, Numero 19(1), 2023, Pagina/e 27-28, ISSN 1782-348X
Editore: Vrije Universiteit Brussel

Exploring biological possibility through synthetic biology

Autori: Tero Ijäs, Rami Koskinen
Pubblicato in: European Journal for Philosophy of Science, Numero 11, 2021, ISSN 1879-4912
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s13194-021-00364-7

Synthetic fictions: turning imagined biological systems into concrete ones

Autori: Tarja Knuuttila, Rami Koskinen
Pubblicato in: Synthese, 2019, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.
DOI: 10.1007/s11229-020-02567-6

Model templates: transdisciplinary application and entanglement

Autori: Knuuttila, Tarja; Loettgers, Andrea
Pubblicato in: Synthese 201(6), Numero 201(6), 2023, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.
DOI: 10.1007/s11229-023-04178-3

Mechanisms and the problem of abstract models

Autori: Natalia Carrillo; Tarja Knuuttila
Pubblicato in: European Journal for Philosophy of Science, Numero 13(27), 2023, ISSN 1879-4912
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s13194-023-00530-z

Models as Epistemic Artifacts for Scientific Reasoning in Science Education Research

Autori: Tarja Knuuttila, Marvin Rost
Pubblicato in: Education Sciences, Numero 12(4), 2022, ISSN 2227-7102
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/educsci12040276

Simulation of Group Agency – From Collective Intentions to Proto-Collective Actors

Autori: Maximilian Noichl, Johannes Marx
Pubblicato in: Historical Social research / Historische Sozialforschung, Numero 48(3), 2023, Pagina/e 56-74, ISSN 0172-6404
Editore: Quantum and Zentrum fur Historische Sozialforschung

Insider apology for microeconomic theorising?

Autori: Maarten Janssen,Tarja Knuuttila, Mary S. Morgan
Pubblicato in: Journal of Economic Methodology, 2024, ISSN 1350-178X
Editore: Routledge
DOI: 10.1080/1350178x.2024.2326895

Epistemic artifacts and the modal dimension of modeling

Autori: Tarja Knuuttila
Pubblicato in: European Journal for Philosophy of Science, Numero 11/3, 2021, ISSN 1879-4912
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s13194-021-00374-5

Biological Control Variously Materialized: Modeling, Experimentation and Exploration in Multiple Media

Autori: Tarja Knuuttila, Andrea Loettgers
Pubblicato in: Perspectives on Science, Numero 29 (4), 2021, Pagina/e 468–492, ISSN 1063-6145
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1162/posc_a_00379

Explanatory power by vagueness. Challenges to the strong prior hypothesis on hallucinations exemplified by the Charles-Bonnet-Syndrome

Autori: Franz Roman Schmid, Moritz F. Kriegleder
Pubblicato in: Consciousness and Cognition, Numero 17, 2024, Pagina/e 103620, ISSN 1053-8100
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.concog.2023.103620

Modal inferences in science: a tale of two epistemologies.

Autori: Ilmari Hirvonen, Rami Koskinen, Ilkka Pättiniemi
Pubblicato in: Synthese, 2021, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.
DOI: 10.1007/s11229-021-03399-8

The vaccinologist’s “dirty little secret”: a better understanding of structure-function relationships of viral immunogens might advance rational HIV vaccine design

Autori: Gregor P. Greslehner
Pubblicato in: Archives of Virology, 2021, Pagina/e 1297-1303, ISSN 0304-8608
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00705-021-04982-7

Understanding immunity: an alternative framework beyond defense and strength

Autori: Martin Zach; Gregor P. Greslehner
Pubblicato in: Biology & Philosophy, Numero 38(7), 2023, ISSN 0169-3867
Editore: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10539-023-09893-2

Towards an extended view of immunity: A philosophical perspective

Autori: Martin Zach; Gregor P. Greslehner
Pubblicato in: Anaesthesia Critical Care & Pain Medicine, Numero 41(6), 2022, Pagina/e 101156, ISSN 2352-5568
Editore: Elsevier Masson SAS
DOI: 10.1016/j.accpm.2022.101156

Modelling gene regulation: (De)compositional and template-based strategies

Autori: Tarja Knuuttilaa, Vivette García Deisterb
Pubblicato in: Studies in History and Philosophy of Science, Numero 77, 2020, Pagina/e 101-111, ISSN 0039-3681
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.shpsa.2017.11.002

Multiple Realizability and Biological Modality

Autori: Rami Koskinen
Pubblicato in: Philosophy of Science, Numero 86(5), 2019, ISSN 0031-8248
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1086/705478

Kinds of modalities and modeling practices

Autori: Rami Koskinen
Pubblicato in: Synthese, Numero 201(196), 2023, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.
DOI: 10.1007/s11229-023-04185-4

Perceptual Presence as Enactive Inference

Autori: Moritz Kriegleder
Pubblicato in: Constructivist Foundations, Numero 16 (3), 2021, Pagina/e 313-314, ISSN 1782-348X
Editore: Vrije Universiteit Brussel

Modeling the structure of recent philosophy

Autori: Maximilian Noichl
Pubblicato in: Synthese, Numero 198, 2021, Pagina/e 5089-5100, ISSN 0039-7857
Editore: D. Reidel Pub. Co.

Synthetic models in biology

Autori: Tarja Knuuttila, Andrea Loettgers
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling, 2024, Pagina/e 482-496, ISBN 9781003205647
Editore: Routledge

Philosophical Perspectiveson Neuroendocrine–Immune Interactions: The Building Block Model and ComplementaryNeuro-Endocrine-Immune-Microbiota Systems Approaches. I

Autori: Gregor P. Greslehner, F. Boem, L. Chiu, J.P. Konsman
Pubblicato in: Neuroendocrine-Immune System Interactions. Masterclass in Neuroendocrinology, vol 13., Numero vol 13, 2023
Editore: Springer
DOI: 10.1007/978-3-031-21358-8_2

Scientific Models int he Philosophy of Science

Autori: Tarja Knuttila, Rami Koskinen, Natalia Carrillo
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientif modelling, 2024, Pagina/e 1-8, ISBN 9781032071510
Editore: Routledge

Models of the nerve impulse

Autori: Natalia Carrillo
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling, 2024, Pagina/e 549-560, ISBN 9781032071510
Editore: Routledge

An Artifactual Perspective on Idealization: Constant Capacitance and the Hodgkin and Huxley Model

Autori: Knuuttila, Tarja; Carrillo, Natalia
Pubblicato in: Models and Idealizations in Science, 2021, ISBN 978-3-030-65801-4
Editore: Springer International Publishing
DOI: 10.5281/zenodo.4483156

Models, Fictions and Artifacts

Autori: Knuuttila, Tarja
Pubblicato in: Language and Scientific Research, Numero 1, 2021, ISBN 978-3-030-60536-0
Editore: Palgrave Macmillan
DOI: 10.5281/zenodo.4478276

Introduction

Autori: Tarja Knuuttila, Natlia Carrillo, Rami Koskinen
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling, 2024, Pagina/e 1-8, ISBN 9781003205647
Editore: Routledge

The Metaphoric Sources of Scientific Innovation

Autori: Sergio F Martínez, Natalia Carrillo
Pubblicato in: Metaphors and Analogies in Sciences and Humanities, 2022, Pagina/e 33-47, ISBN 978-3-030-90687-0
Editore: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-90688-7_2

Abstraction as Material Translation: An Artistic Reflection of (Re)Presentation

Autori: Tarja Knuuttila, Hanna Johansson, Natalia Carrillo
Pubblicato in: Abstraction in Science and Art Philosophical Perspectives, 2024, ISBN 9781032462875
Editore: Routledge

Magnetized Memories: Analogies and Templates in Model Transfer

Autori: Tarja Knuuttila, Andrea Loettgers
Pubblicato in: Living Machines? Philosophical Perspectives on the Engineering Approach in Biology., 2020, ISBN 9780815380788
Editore: Routledge

The Combinatorial Possibilities of Synthetic Biology

Autori: Tarja Knuuttila, Andrea Loettgers
Pubblicato in: Modeling the possible, 2025
Editore: Routledge

Climate Models

Autori: Ikka Pättiniemi, Rami Koskinen
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling, 2024, Pagina/e 443-455, ISBN 9781003205647
Editore: Routledge

The artifactual approach to modeling

Autori: Tarja Knuttila
Pubblicato in: The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling, 2024, Pagina/e 111-125, ISBN 9781003205647
Editore: Routledge

Modelling the Possible

Autori: Tarja Knuuttila, Till Gruene-Yanoff, Rami Koskinen, Ylwa Sjölin Wirling
Pubblicato in: 2025
Editore: Routledge

The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modelling

Autori: Tarja Knuuttila, Natalia Carrillo, Rami Koskinen
Pubblicato in: Routledge Handbooks, 2024, ISBN 9781032071510
Editore: Routledge

Modelling the Possible

Autori: Knuuttila, Tarja, Till Gruene-Yanoff, Rami Koskinen, and Ylwa Sjölin Wirling
Pubblicato in: 2025
Editore: Routledge

The Routledge Handbook of Philosophy of Scientific Modeling

Autori: Tarja Knuuttila, Rami Koskinen, Natalia Carrillo
Pubblicato in: 2024
Editore: London

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