Descrizione del progetto
Una nuova piattaforma per far luce su adattamento del CRISPR e immunità batterica contro i virus invasori
Ad oggi, molte persone hanno sentito almeno parlare del sistema «CRISPR». Nell’ultimo decennio, questa tecnica semplice ed economica per l’editing genetico in vivo ha conquistato il mondo grazie al proprio potenziale per la terapia genica delle malattie. Il progetto CRISPRsition, finanziato dall’UE, ci riporta alle sue umili origini. Le brevi ripetizioni palindrome aggregate regolarmente distanziate (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, CRISPR) e le proteine associate al CRISPR (CRISPR-associated, Cas) sono parte del sistema immunitario adattativo nei procarioti. I batteri lo utilizzano per preservare una «memoria» dell’invasione da parte di un fago, impiegando lo splicing su un pezzo dell’acido nucleico del fago invasore nel sistema CRISPR in un processo chiamato adattamento. CRISPRsition pianifica di fornire una piattaforma che identifichi le parti pertinenti di genomi batterici e fagici con potenziale per la nuova terapia «antibiotica».
Obiettivo
The CRISPR-Cas system has been extensively studied for its ability to cleave DNA. In contrast, studies of the ability of the system to acquire and integrate new DNA from invaders as a form of prokaryotic adaptive immunity, have lagged behind. This delay reflects the extreme enthusiasm surrounding the potential of using the system’s cleavage capabilities as a genome editing tool. However, the enormous potential of the adaptation process can and should arouse a similar degree of enthusiasm. My lab has pioneered studies on the CRISPR adaptation process by establishing new methodologies, and applying them to demonstrate the essential role of the proteins and DNA elements, as well as the molecular mechanisms, operating in this process. In this project, I will establish novel platforms for studying adaptation and develop them into biotechnological applications and research tools. These tools will allow me to identify the first natural and synthetic inhibitors of the adaptation process. This, in turn, will provide genetic tools to control adaptation, as well as advance the understanding of the arms race between bacteria and their invaders. I will also harness the adaptation process as a platform for diversifying genetic elements for phage display, and for extending phage recognition of a wide range of hosts. Lastly, I will provide the first evidence for an association between the CRISPR adaptation system and gene repression. This linkage will form the basis of a molecular scanner and recorder platform that I will develop and that can be used to identify crucial genetic elements in phage genomes as well as novel regulatory circuits in the bacterial genome. Together, my findings will represent a considerable leap in the understanding of CRISPR adaptation with respect to the process, potential applications, and the intriguing evolutionary significance.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
69978 Tel Aviv
Israele
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.