Repurposing small RNA from ciliates for genome editing: single-molecule study

Informations projet

MIGHTY_RNA

N° de convention de subvention: 819299

DOI

10.3030/819299

Projet clôturé

Date de signature de la CE 18 Decembre 2018

Date de début 1 Mai 2019

Date de fin 30 Avril 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 792 850,00

Contribution de l’UE

€ 1 792 850,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (8)

the road to next-generation single-molecule biophysics

Auteurs: Severins, I.W.H.; Joo, C.; Noort, S.J.T. van
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 4, 2022, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.024

RNA-guided RNA silencing by an Asgard archaeal Argonaute

Auteurs: Carolien Bastiaanssen, Pilar Bobadilla Ugarte, Kijun Kim, Giada Finocchio, Yanlei Feng, Todd A. Anzelon, Stephan Köstlbacher, Daniel Tamarit, Thijs J. G. Ettema, Martin Jinek, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Daan C. Swarts & Fabai Wu
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, Page(s) 5499, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49452-1

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions

Auteurs: Suzan Ruijtenberg, Stijn Sonneveld, Tao Ju Cui, Ive Logister, Dion de Steenwinkel, Yao Xiao, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Marvin E. Tanenbaum
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 27/9, 2020, Page(s) 790-801, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0461-1

High-Speed Super-Resolution Imaging Using Protein-Assisted DNA-PAINT

Auteurs: Mike Filius, Tao Ju Cui, Adithya N. Ananth, Margreet W. Docter, Jorrit W. Hegge, John van der Oost, Chirlmin Joo
Publié dans: Nano Letters, Numéro 20/4, 2020, Page(s) 2264-2270, ISSN 1530-6984
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.9b04277

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices

Auteurs: Lerner, Eitan; Barth, Anders; Hendrix, Jelle; Ambrose, Benjamin; Birkedal, Victoria; Blanchard, Scott C.; Börner, Richard; Chung, Hoi Sung; Cordes, Thorben; Craggs, Timothy D.; Deniz, Ashok A.; Diao, Jiajia; Fei, Jingyi; Gonzalez, Ruben L.; Gopich, Irina V.; Ha, Taekjip; Hanke, Christian A.; Haran, Gilad; Hatzakis, Nikos S.; Hohng, Sungchul; Hong, Seok Cheol; Hugel, Thorsten; Ingargiola, Antonino
Publié dans: eLife, Numéro 2, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60416

Argonaute bypasses cellular obstacles without hindrance during target search

Auteurs: Tao Ju Cui, Misha Klein, Jorrit W. Hegge, Stanley D. Chandradoss, John van der Oost, Martin Depken, Chirlmin Joo
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12415-y

Targeting G-quadruplex Forming Sequences with Cas9

Auteurs: Hamza Balci; Hamza Balci; Viktorija Globyte; Chirlmin Joo
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 2, 2021, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2020.09.19.304816

Small RNA-directed DNA elimination: the molecular mechanism and its potential for genome editing.

Auteurs: C.K.J.M.L. Bastiaanssen; Chirlmin Joo
Publié dans: RNA Biology, Numéro 2, 2021, ISSN 1547-6286
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2021.1885208